RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476784.5

TTC3-215, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, humanhuman

TSL 2

Gene TTC3, Length 7,425 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC3-215ENST00000476784 PXT1Q8NFP0 134 aa5.94□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 OR10Z1Q8NGY1 313 aa5.94□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 LOXL4Q96JB6 756 aa5.94□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 PKMYT1Q99640 499 aa5.94□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 CLMPQ9H6B4 373 aa5.94□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 TRGV2A0A075B6R0 118 aa5.94□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 SNURFLB1AK76 121 aa5.94□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 CHST1O43916 411 aa5.94□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 PFN3P60673 137 aa5.94□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 KRTDAPP60985 99 aa5.94□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 PRSS45Q7RTY3 260 aa5.94□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 ABHD3Q8WU67 409 aa5.94□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 FAM210BQ96KR6 192 aa5.94□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 FAM210AQ96ND0 272 aa5.94□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 CCL13Q99616 98 aa5.94□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 SERGEFQ9UGK8 458 aa5.94□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 NME4O00746 187 aa5.94□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 AQP8O94778 261 aa5.94□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 NUDT3O95989 172 aa5.94□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 CTSLP07711 333 aa5.94□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 MALP21145 153 aa5.94□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 GDNFP39905 211 aa5.94□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 RPS25P62851 125 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 MEIG1Q5JSS6 88 aa5.94□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa5.94□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 MRAPQ8TCY5 172 aa5.94□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 YIPF5Q969M3 257 aa5.94□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa5.94□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 ZNF727A8MUV8 499 aa5.94□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 CRPP02741 224 aa5.94□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 CA5AP35218 305 aa5.94□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 CFHR1Q03591 330 aa5.94□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 FFAR4Q5NUL3 377 aa5.94□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 OR4A47Q6IF82 309 aa5.94□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 RHOUQ7L0Q8 258 aa5.94□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 VSTM2AQ8TAG5 236 aa5.94□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 DOK1Q99704 481 aa5.94□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 MON2Q7Z3U7 1717 aa5.94□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 PPLO60437 1756 aa5.94□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 CDIPTO14735 213 aa5.94□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 CLEC2LP0C7M8 214 aa5.94□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 TGFBR1P36897 503 aa5.94□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 ZNF691Q5VV52 312 aa5.94□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 FAM219AQ8IW50 185 aa5.94□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 TTC9CQ8N5M4 171 aa5.94□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 MCHR2Q969V1 340 aa5.94□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 SLC52A3Q9NQ40 469 aa5.94□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa5.94□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa5.93□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 PPP5D1E7EU14 171 aa5.93□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 MGMTP16455 207 aa5.93□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 CTSSP25774 331 aa5.93□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 LIMK1P53667 647 aa5.93□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 PROX2Q3B8N5 592 aa5.93□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 SMRP1Q8NCR6 262 aa5.93□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 SLC25A46Q96AG3 418 aa5.93□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 ADGRB1O14514 1584 aa5.93□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 MELTFP08582 738 aa5.93□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 FABP4P15090 132 aa5.93□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 CAMPP49913 170 aa5.93□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 DPTQ07507 201 aa5.93□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 TEX261Q6UWH6 196 aa5.93□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa5.93□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 ARRDC2Q8TBH0 407 aa5.93□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 RPS4Y2Q8TD47 263 aa5.93□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 TTTY12Q9BZ98 90 aa5.93□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 ANXA10Q9UJ72 324 aa5.93□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 NPFFO15130 113 aa5.93□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 PMCHP20382 165 aa5.93□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 HOXD13P35453 343 aa5.93□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP5.93□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 LURAP1Q96LR2 239 aa5.93□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 R4GMQ9 66 aa5.93□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa5.93□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 A0A087WUJ7 227 aa5.93□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 ZNHIT1O43257 154 aa5.93□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 RECKO95980 971 aa5.93□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 OR2B8PP59922 312 aa5.93□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 WDR73Q6P4I2 378 aa5.93□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 ASCL4Q6XD76 172 aa5.93□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
TTC3-215ENST00000476784 A4GALTQ9NPC4 353 aa5.93□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.8 ms