RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469637.1

CASP9-208, Transcript of caspase 9, human

TSL 3

Gene CASP9, Length 725 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CASP9-208	ENST00000469637	NUDT16L1	Q9BRJ7	211 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
CASP9-208	ENST00000469637	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CASP9-208	ENST00000469637	OPN4	Q9UHM6	478 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CASP9-208	ENST00000469637	RPUSD1	Q9UJJ7	312 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
CASP9-208	ENST00000469637	KPTN	Q9Y664	436 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CASP9-208	ENST00000469637	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
CASP9-208	ENST00000469637	CUBN	O60494	3623 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CASP9-208	ENST00000469637	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CASP9-208	ENST00000469637	ZNF879	B4DU55	563 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CASP9-208	ENST00000469637	CHRM2	P08172	466 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CASP9-208	ENST00000469637	IGFBP3	P17936	291 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
CASP9-208	ENST00000469637	AMY2B	P19961	511 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CASP9-208	ENST00000469637	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
CASP9-208	ENST00000469637	TPBG	Q13641	420 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CASP9-208	ENST00000469637	DOC2B	Q14184	412 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CASP9-208	ENST00000469637	ASCL4	Q6XD76	172 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CASP9-208	ENST00000469637	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CASP9-208	ENST00000469637	SLC25A26	Q70HW3	274 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CASP9-208	ENST00000469637	ANGPTL5	Q86XS5	388 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CASP9-208	ENST00000469637	OR5D13	Q8NGL4	314 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CASP9-208	ENST00000469637	TRMT10A	Q8TBZ6	339 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
CASP9-208	ENST00000469637	DCTN5	Q9BTE1	182 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CASP9-208	ENST00000469637	UNKL	Q9H9P5	680 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
CASP9-208	ENST00000469637	SMURF1	Q9HCE7	757 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CASP9-208	ENST00000469637	MMP26	Q9NRE1	261 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CASP9-208	ENST00000469637	PCDHB16	Q9NRJ7	776 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CASP9-208	ENST00000469637	IL36G	Q9NZH8	169 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CASP9-208	ENST00000469637	SLC25A10	Q9UBX3	287 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
CASP9-208	ENST00000469637	GLS2	Q9UI32	602 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CASP9-208	ENST00000469637	IGHV3OR15-7	A0A075B7D8	119 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CASP9-208	ENST00000469637	SMIM31	A0A1B0GVY4	71 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CASP9-208	ENST00000469637		A0A1W2PPH5	198 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CASP9-208	ENST00000469637		A6NHS1	94 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CASP9-208	ENST00000469637	C22orf46	C9J442	243 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CASP9-208	ENST00000469637	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CASP9-208	ENST00000469637	SC5D	O75845	299 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CASP9-208	ENST00000469637	PRDX2	P32119	198 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CASP9-208	ENST00000469637	SRP14	P37108	136 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CASP9-208	ENST00000469637	RANBP1	P43487	201 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CASP9-208	ENST00000469637	ZP1	P60852	638 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CASP9-208	ENST00000469637	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CASP9-208	ENST00000469637	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CASP9-208	ENST00000469637	METAP1D	Q6UB28	335 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CASP9-208	ENST00000469637	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CASP9-208	ENST00000469637	BTN2A1	Q7KYR7	527 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CASP9-208	ENST00000469637	NKAIN3	Q8N8D7	197 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CASP9-208	ENST00000469637	CHST4	Q8NCG5	386 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CASP9-208	ENST00000469637	C19orf18	Q8NEA5	215 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CASP9-208	ENST00000469637	UFD1	Q92890	307 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CASP9-208	ENST00000469637	CCL13	Q99616	98 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CASP9-208	ENST00000469637	METRN	Q9UJH8	293 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CASP9-208	ENST00000469637	MEGF11	A6BM72	1044 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CASP9-208	ENST00000469637	RFPL4A	A6NLU0	287 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CASP9-208	ENST00000469637	RFPL4AL1	F8VTS6	287 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CASP9-208	ENST00000469637		K7N7A8	449 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CASP9-208	ENST00000469637		M0R1W7	72 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CASP9-208	ENST00000469637	INMT	O95050	263 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CASP9-208	ENST00000469637	HCK	P08631	526 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CASP9-208	ENST00000469637	GAL	P22466	123 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CASP9-208	ENST00000469637	BDKRB2	P30411	391 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CASP9-208	ENST00000469637	MTNR1B	P49286	362 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CASP9-208	ENST00000469637	PDCD1	Q15116	288 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CASP9-208	ENST00000469637	NHLRC3	Q5JS37	347 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CASP9-208	ENST00000469637	ASPHD2	Q6ICH7	369 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CASP9-208	ENST00000469637	UNQ9370/PRO34162	Q6UXP9	181 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CASP9-208	ENST00000469637	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CASP9-208	ENST00000469637	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CASP9-208	ENST00000469637	FAM58A	Q8N1B3	248 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CASP9-208	ENST00000469637	SVOP	Q8N4V2	548 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CASP9-208	ENST00000469637	FAM216B	Q8N7L0	139 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CASP9-208	ENST00000469637	NPRL2	Q8WTW4	380 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CASP9-208	ENST00000469637	FCGR1B	Q92637	280 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CASP9-208	ENST00000469637	DERL3	Q96Q80	235 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CASP9-208	ENST00000469637	CNTD2	Q9H8S5	307 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CASP9-208	ENST00000469637	HMG20A	Q9NP66	347 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CASP9-208	ENST00000469637	MAB21L2	Q9Y586	359 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CASP9-208	ENST00000469637	COL6A5	A8TX70	2615 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CASP9-208	ENST00000469637		H3BSH0	61 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CASP9-208	ENST00000469637	ZNF737	O75373	536 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CASP9-208	ENST00000469637	FCN3	O75636	299 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CASP9-208	ENST00000469637	AVP	P01185	164 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CASP9-208	ENST00000469637	RBP4	P02753	201 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CASP9-208	ENST00000469637	MMP9	P14780	707 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CASP9-208	ENST00000469637	CPE	P16870	476 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CASP9-208	ENST00000469637	FPR2	P25090	351 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CASP9-208	ENST00000469637	LMO1	P25800	156 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CASP9-208	ENST00000469637	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CASP9-208	ENST00000469637	RBMX	P38159	391 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CASP9-208	ENST00000469637	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CASP9-208	ENST00000469637	PAX5	Q02548	391 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CASP9-208	ENST00000469637	GPR176	Q14439	515 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CASP9-208	ENST00000469637	MED22	Q15528	200 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CASP9-208	ENST00000469637	DGUOK	Q16854	277 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CASP9-208	ENST00000469637	ARMCX4	Q5H9R4	360 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CASP9-208	ENST00000469637	DMRTC1	Q5HYR2	192 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CASP9-208	ENST00000469637	METTL11B	Q5VVY1	283 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CASP9-208	ENST00000469637	LINC00596	Q86U02	117 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CASP9-208	ENST00000469637	CD177	Q8N6Q3	437 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CASP9-208	ENST00000469637	OR51T1	Q8NGJ9	327 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CASP9-208	ENST00000469637	PPP1R35	Q8TAP8	253 aa		11.62	□□□□□ -0.55

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