RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463041.1

PTPRF-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRF, Length 298 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-210ENST00000463041 SSX3Q99909 188 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 CHST5Q9GZS9 411 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 C19orf12Q9NSK7 152 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 MTCH1Q9NZJ7 389 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 OR14J1Q9UGF5 321 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 NOTCH1P46531 2555 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 C17orf98A8MV24 154 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 H3BNX3 289 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 SLC16A6O15403 523 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 MPZL2O60487 215 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 RBP4P02753 201 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 HTR1AP08908 422 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 ATF1P18846 271 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 PEX2P28328 305 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 KIR3DL2P43630 455 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 KIR2DS4P43632 304 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 OR12D2P58182 307 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 COL10A1Q03692 680 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 TP53I3Q53FA7 332 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 SLC35E4Q6ICL7 350 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 BRICD5Q6PL45 260 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 SLC25A26Q70HW3 274 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 GDPD3Q7L5L3 318 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 OR13D1Q8NGV5 346 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 RHOXF1Q8NHV9 184 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 FGGYQ96C11 551 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 MALSU1Q96EH3 234 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 AJUBAQ96IF1 538 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 MBOAT4Q96T53 435 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 C9orf16Q9BUW7 83 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 NEK6Q9HC98 313 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 RAB18Q9NP72 206 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 FRRS1LQ9P0K9 344 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 FBLN5Q9UBX5 448 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 GLS2Q9UI32 602 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 HHLA2Q9UM44 414 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 hADV38S2A0JD32 116 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 F8VVB4 439 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 F8VWA3 439 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 H3BSH0 61 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 H3BUX3 64 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 J3QLW9 94 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 M0QZ24 198 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 EI24O14681 340 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 SH2D1BO14796 132 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF737O75373 536 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 ALX3O95076 343 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 FADS2O95864 444 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 MT-ND2P03891 347 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF728P0DKX0 622 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 CCL3L1P16619 93 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF19P17023 458 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF20P17024 532 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 DLX6P56179 175 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 MTCP1P56278 107 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 KRTAP10-3P60369 221 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 ACTA2P62736 377 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 ACTG2P63267 376 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 PDZK1IP1Q13113 114 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 GALEQ14376 348 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF146Q15072 292 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 ASPHD2Q6ICH7 369 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 C11orf88Q6PI97 169 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 LHFPL3Q86UP9 236 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 OR8H2Q8N162 312 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 FAM58AQ8N1B3 248 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 BATF2Q8N1L9 274 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 CBR4Q8N4T8 237 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 OR11H6Q8NGC7 330 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 PPP1R35Q8TAP8 253 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 C17orf50Q8WW18 174 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 SLAMF9Q96A28 289 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 SPSB1Q96BD6 273 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 CDCA4Q9BXL8 241 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 PPA2Q9H2U2 334 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 RHOFQ9HBH0 211 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 TCF7L1Q9HCS4 588 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 INPP5EQ9NRR6 644 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
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