RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445369.2

CLDN9-201, Transcript of claudin 9, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CLDN9, Length 2,050 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9-201ENST00000445369 OR1C1Q15619 314 aa15.41■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 TTTY12Q9BZ98 90 aa15.41■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 ACKR4Q9NPB9 350 aa15.41■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 ABI3Q9P2A4 366 aa15.41■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 MEMO1Q9Y316 297 aa15.41■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 MAGEA5P43359 124 aa15.4■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 DCAF10Q5QP82 559 aa15.4■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 TFAP2EQ6VUC0 442 aa15.4■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 FAM219AQ8IW50 185 aa15.4■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 SLC6A15Q9H2J7 730 aa15.4■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 TMEM100Q9NV29 134 aa15.4■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 PCDHB10Q9UN67 800 aa15.4■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 ZNF850A8MQ14 1090 aa15.4■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 PDCD6O75340 191 aa15.4■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 RBM11P57052 281 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 BTN1A1Q13410 526 aa15.4■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 TMEM164Q5U3C3 297 aa15.4■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 CALHM1Q8IU99 346 aa15.4■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 TUSC5Q8IXB3 177 aa15.4■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 OR1S2Q8NGQ3 325 aa15.4■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 SLC5A7Q9GZV3 580 aa15.4■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 PIGMQ9H3S5 423 aa15.4■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 PARPBPQ9NWS1 579 aa15.4■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 GSKIPQ9P0R6 139 aa15.4■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 FREM2Q5SZK8 3169 aa15.39■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 FAM166BA8MTA8 275 aa15.39■□□□□ 0.05
CLDN9-201ENST00000445369 BET1O15155 118 aa15.39■□□□□ 0.05
CLDN9-201ENST00000445369 ITGA3P26006 1051 aa15.39■□□□□ 0.05
CLDN9-201ENST00000445369 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
CLDN9-201ENST00000445369 PLA2G2CQ5R387 149 aa15.39■□□□□ 0.05
CLDN9-201ENST00000445369 BRICD5Q6PL45 260 aa15.39■□□□□ 0.05
CLDN9-201ENST00000445369 LDAHQ9H6V9 325 aa15.39■□□□□ 0.05
CLDN9-201ENST00000445369 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa15.39■□□□□ 0.05
CLDN9-201ENST00000445369 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
CLDN9-201ENST00000445369 SYNGR4O95473 234 aa15.39■□□□□ 0.05
CLDN9-201ENST00000445369 PIGPP57054 158 aa15.39■□□□□ 0.05
CLDN9-201ENST00000445369 S100A10P60903 97 aa15.39■□□□□ 0.05
CLDN9-201ENST00000445369 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
CLDN9-201ENST00000445369 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
CLDN9-201ENST00000445369 SLC22A25Q6T423 547 aa15.39■□□□□ 0.05
CLDN9-201ENST00000445369 Q6ZPA2 131 aa15.39■□□□□ 0.05
CLDN9-201ENST00000445369 TMEM251Q8N6I4 163 aa15.39■□□□□ 0.05
CLDN9-201ENST00000445369 ZNF611Q8N823 705 aa15.39■□□□□ 0.05
CLDN9-201ENST00000445369 FNDC9Q8TBE3 224 aa15.39■□□□□ 0.05
CLDN9-201ENST00000445369 CALHM2Q9HA72 323 aa15.39■□□□□ 0.05
CLDN9-201ENST00000445369 ASF1BQ9NVP2 202 aa15.39■□□□□ 0.05
CLDN9-201ENST00000445369 PLA2G3Q9NZ20 509 aa15.39■□□□□ 0.05
CLDN9-201ENST00000445369 A0A096LPE4 126 aa15.38■□□□□ 0.05
CLDN9-201ENST00000445369 A0A1W2PPZ6 126 aa15.38■□□□□ 0.05
CLDN9-201ENST00000445369 FAM221AA4D161 298 aa15.38■□□□□ 0.05
CLDN9-201ENST00000445369 ZNF728P0DKX0 622 aa15.38■□□□□ 0.05
CLDN9-201ENST00000445369 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
CLDN9-201ENST00000445369 PXDC1Q5TGL8 231 aa15.38■□□□□ 0.05
CLDN9-201ENST00000445369 C9orf135Q5VTT2 229 aa15.38■□□□□ 0.05
CLDN9-201ENST00000445369 ZNF585AQ6P3V2 769 aa15.38■□□□□ 0.05
CLDN9-201ENST00000445369 UQCC3Q6UW78 93 aa15.38■□□□□ 0.05
CLDN9-201ENST00000445369 CCDC36Q8IYA8 594 aa15.38■□□□□ 0.05
CLDN9-201ENST00000445369 BPIFCQ8NFQ6 507 aa15.38■□□□□ 0.05
CLDN9-201ENST00000445369 OR56B2PQ8NGI1 322 aa15.38■□□□□ 0.05
CLDN9-201ENST00000445369 TOMM40LQ969M1 308 aa15.38■□□□□ 0.05
CLDN9-201ENST00000445369 MARC2Q969Z3 335 aa15.38■□□□□ 0.05
CLDN9-201ENST00000445369 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa15.38■□□□□ 0.05
CLDN9-201ENST00000445369 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
CLDN9-201ENST00000445369 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa15.38■□□□□ 0.05
CLDN9-201ENST00000445369 ZNF286AQ9HBT8 521 aa15.38■□□□□ 0.05
CLDN9-201ENST00000445369 TUBD1Q9UJT1 453 aa15.38■□□□□ 0.05
CLDN9-201ENST00000445369 RAB19A4D1S5 217 aa15.37■□□□□ 0.05
CLDN9-201ENST00000445369 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
CLDN9-201ENST00000445369 COX5BP10606 129 aa15.37■□□□□ 0.05
CLDN9-201ENST00000445369 CD79AP11912 226 aa15.37■□□□□ 0.05
CLDN9-201ENST00000445369 PMELP40967 661 aa15.37■□□□□ 0.05
CLDN9-201ENST00000445369 MALLQ13021 153 aa15.37■□□□□ 0.05
CLDN9-201ENST00000445369 GGNBP1Q5YKI7 109 aa15.37■□□□□ 0.05
CLDN9-201ENST00000445369 LINC00696Q6ZRV3 163 aa15.37■□□□□ 0.05
CLDN9-201ENST00000445369 Q8NFD4 153 aa15.37■□□□□ 0.05
CLDN9-201ENST00000445369 TMED6Q8WW62 240 aa15.37■□□□□ 0.05
CLDN9-201ENST00000445369 GALNT14Q96FL9 552 aa15.37■□□□□ 0.05
CLDN9-201ENST00000445369 POM121Q96HA1 1249 aa15.37■□□□□ 0.05
CLDN9-201ENST00000445369 LOXL4Q96JB6 756 aa15.37■□□□□ 0.05
CLDN9-201ENST00000445369 NAA60Q9H7X0 242 aa15.37■□□□□ 0.05
CLDN9-201ENST00000445369 RNF122Q9H9V4 155 aa15.37■□□□□ 0.05
CLDN9-201ENST00000445369 C12orf4Q9NQ89 552 aa15.37■□□□□ 0.05
CLDN9-201ENST00000445369 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa15.37■□□□□ 0.05
CLDN9-201ENST00000445369 PQLC2LA1A4F0 135 aa15.37■□□□□ 0.05
CLDN9-201ENST00000445369 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa15.37■□□□□ 0.05
CLDN9-201ENST00000445369 ZNF724A8MTY0 619 aa15.37■□□□□ 0.05
CLDN9-201ENST00000445369 ZNF205O95201 554 aa15.37■□□□□ 0.05
CLDN9-201ENST00000445369 MT-CO3P00414 261 aa15.37■□□□□ 0.05
CLDN9-201ENST00000445369 HLA-HP01893 362 aa15.37■□□□□ 0.05
CLDN9-201ENST00000445369 APOC3P02656 99 aa15.37■□□□□ 0.05
CLDN9-201ENST00000445369 HKR1P10072 659 aa15.37■□□□□ 0.05
CLDN9-201ENST00000445369 SLC25A26Q70HW3 274 aa15.37■□□□□ 0.05
CLDN9-201ENST00000445369 RNF141Q8WVD5 230 aa15.37■□□□□ 0.05
CLDN9-201ENST00000445369 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
CLDN9-201ENST00000445369 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa15.37■□□□□ 0.05
CLDN9-201ENST00000445369 FAM157CP0CG43 387 aa15.36■□□□□ 0.05
CLDN9-201ENST00000445369 FUT3P21217 361 aa15.36■□□□□ 0.05
CLDN9-201ENST00000445369 NPBWR2P48146 333 aa15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms