RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 CDC14BO60729 498 aa7.38□□□□□ -1.23
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RABGEF1-203ENST00000439720 GPR1P46091 355 aa7.38□□□□□ -1.23
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RABGEF1-203ENST00000439720 ELLP55199 621 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 CTXN1P60606 82 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 EGR3Q06889 387 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 UNC119Q13432 240 aa7.38□□□□□ -1.23
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RABGEF1-203ENST00000439720 ALKBH6Q3KRA9 238 aa7.38□□□□□ -1.23
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RABGEF1-203ENST00000439720 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 SIT1Q9Y3P8 196 aa7.38□□□□□ -1.23
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RABGEF1-203ENST00000439720 BRS3P32247 399 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 HLA-DRB3P79483 266 aa7.38□□□□□ -1.23
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RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 C1orf194Q5T5A4 169 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 C1QL3Q5VWW1 255 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 FBXW9Q5XUX1 488 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 OR13C3Q8NGS6 347 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 C5orf30Q96GV9 206 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 PCBD2Q9H0N5 130 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 PARD6AQ9NPB6 346 aa7.38□□□□□ -1.23
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RABGEF1-203ENST00000439720 MMP16P51512 607 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 TLE4Q04727 773 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC17A1Q14916 467 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 ZIC1Q15915 447 aa7.38□□□□□ -1.23
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RABGEF1-203ENST00000439720 COX15Q7KZN9 410 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
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RABGEF1-203ENST00000439720 SGPP2Q8IWX5 399 aa7.38□□□□□ -1.23
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RABGEF1-203ENST00000439720 CHRM2P08172 466 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 MMP9P14780 707 aa7.37□□□□□ -1.23
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RABGEF1-203ENST00000439720 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
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RABGEF1-203ENST00000439720 FZD2Q14332 565 aa7.37□□□□□ -1.23
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RABGEF1-203ENST00000439720 SLC35E3Q7Z769 313 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 KIR2DL5AQ8N109 375 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM105Q8N8V8 129 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 OR5H2Q8NGV7 314 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP7.37□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 AK3Q9UIJ7 227 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 HIF3AQ9Y2N7 669 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa7.37□□□□□ -1.23
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