RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439415.1

CBX1P4-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene CBX1P4, Length 457 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P4-201ENST00000439415 IL5RAQ01344 420 aa3.45□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 TTLL9Q3SXZ7 439 aa3.45□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 TTMPQ5BVD1 217 aa3.45□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 MARC1Q5VT66 337 aa3.45□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 METTL7BQ6UX53 244 aa3.45□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 DRAM2Q6UX65 266 aa3.45□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 RNF165Q6ZSG1 346 aa3.45□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 POM121L12Q8N7R1 296 aa3.45□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 WDSUB1Q8N9V3 476 aa3.45□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 ACBD4Q8NC06 268 aa3.45□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa3.45□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 OR2AE1Q8NHA4 323 aa3.45□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 RNF133Q8WVZ7 376 aa3.45□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 DYDC1Q8WWB3 177 aa3.45□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 RXFP2Q8WXD0 754 aa3.45□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 S100PBPQ96BU1 408 aa3.45□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 LRRC58Q96CX6 371 aa3.45□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM19A4Q96LR4 140 aa3.45□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 EDA2RQ9HAV5 297 aa3.45□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 UVRAGQ9P2Y5 699 aa3.45□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 ANXA10Q9UJ72 324 aa3.45□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 PROCRQ9UNN8 238 aa3.45□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa3.45□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 ADGRB1O14514 1584 aa3.44□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 A0A0J9YWU9 116 aa3.44□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 A0A0J9YXV3 536 aa3.44□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 PRSS44E7EML9 344 aa3.44□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 UBDO15205 165 aa3.44□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC16A4O15374 487 aa3.44□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 FGF16O43320 207 aa3.44□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 RAD1O60671 282 aa3.44□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 HPGDSO60760 199 aa3.44□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 TNFSF13O75888 250 aa3.44□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 BGLAPP02818 100 aa3.44□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 IL6P05231 212 aa3.44□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 FABP3P05413 133 aa3.44□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 CD3GP09693 182 aa3.44□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 COX5BP10606 129 aa3.44□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 M6PRP20645 277 aa3.44□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 GABRR1P24046 479 aa3.44□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 CRABP2P29373 138 aa3.44□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 CDKN2BP42772 138 aa3.44□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 RAB8AP61006 207 aa3.44□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 KRTAP1-1Q07627 177 aa3.44□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 STX5Q13190 355 aa3.44□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 KIAA0040Q15053 153 aa3.44□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 RGNQ15493 299 aa3.44□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 CEACAM21Q3KPI0 293 aa3.44□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa3.44□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 COX19Q49B96 90 aa3.44□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 STEAP4Q687X5 459 aa3.44□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 STPG2Q8N412 459 aa3.44□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF525Q8N782 197 aa3.44□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 OR5L1Q8NGL2 311 aa3.44□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 NTAN1Q96AB6 310 aa3.44□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 DNAJC19Q96DA6 116 aa3.44□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 YIPF6Q96EC8 236 aa3.44□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 PPP1R36Q96LQ0 422 aa3.44□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 ATOH8Q96SQ7 321 aa3.44□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 LHX5Q9H2C1 402 aa3.44□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 CENPHQ9H3R5 247 aa3.44□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 ABCB9Q9NP78 766 aa3.44□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 DDIT4Q9NX09 232 aa3.44□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 IL17CQ9P0M4 197 aa3.44□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 PCYOX1Q9UHG3 505 aa3.44□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 VAX2Q9UIW0 290 aa3.44□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 CDH23Q9H251 3354 aa3.44□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 SCN4AP35499 1836 aa3.44□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 NFAT5O94916 1531 aa3.44□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 NFASCO94856 1347 aa3.44□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 RGPD2P0DJD1 1756 aa3.43□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa3.43□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 CEP290O15078 2479 aa3.43□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 PALLDQ8WX93 1383 aa3.43□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 A0A1B0GVG6 124 aa3.43□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 H0Y9J4 135 aa3.43□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 J3QT63 122 aa3.43□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 STX10O60499 249 aa3.43□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 SUPT3HO75486 399 aa3.43□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF30P17039 623 aa3.43□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 FUT3P21217 361 aa3.43□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 NDUFA8P51970 172 aa3.43□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 CEBPGP53567 150 aa3.43□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 RIPPLY3P57055 190 aa3.43□□□□□ -1.86
CBX1P4-201ENST00000439415 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms