RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429581.2

PTPRD-AS2-201, Transcript of PTPRD antisense RNA 2 (head to head), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD-AS2, Length 2,838 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZNF488Q96MN9 340 aa10.92□□□□□ -0.66
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 BCO1Q9HAY6 547 aa10.92□□□□□ -0.66
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP10.92□□□□□ -0.66
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ANXA10Q9UJ72 324 aa10.92□□□□□ -0.66
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TNFSF18Q9UNG2 199 aa10.92□□□□□ -0.66
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 XRCC2O43543 280 aa10.92□□□□□ -0.66
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SFT2D2O95562 160 aa10.92□□□□□ -0.66
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 OR5H8P0DN80 308 aa10.92□□□□□ -0.66
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RRASP10301 218 aa10.92□□□□□ -0.66
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PTGER4P35408 488 aa10.92□□□□□ -0.66
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PRDX4Q13162 271 aa10.92□□□□□ -0.66
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 THAP6Q8TBB0 222 aa10.92□□□□□ -0.66
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 HPSE2Q8WWQ2 592 aa10.92□□□□□ -0.66
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZNF442Q9H7R0 627 aa10.92□□□□□ -0.66
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP10.92□□□□□ -0.66
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa10.92□□□□□ -0.66
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa10.92□□□□□ -0.66
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 DBX1A6NMT0 343 aa10.91□□□□□ -0.66
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LGALS8O00214 317 aa10.91□□□□□ -0.66
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 IL18BPO95998 194 aa10.91□□□□□ -0.66
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PDGFAP04085 211 aa10.91□□□□□ -0.66
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FCGR3AP08637 254 aa10.91□□□□□ -0.66
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 BCL3P20749 454 aa10.91□□□□□ -0.66
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SOX8P57073 446 aa10.91□□□□□ -0.66
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CLN3Q13286 438 aa10.91□□□□□ -0.66
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LPCAT3Q6P1A2 487 aa10.91□□□□□ -0.66
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP10.91□□□□□ -0.66
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SLC22A25Q6T423 547 aa10.91□□□□□ -0.66
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP10.91□□□□□ -0.66
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 DCUN1D4Q92564 292 aa10.91□□□□□ -0.66
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FAHD2AQ96GK7 314 aa10.91□□□□□ -0.66
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 WDYHV1Q96HA8 205 aa10.91□□□□□ -0.66
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LINC00470Q9BZP3 86 aa10.91□□□□□ -0.66
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PRDM14Q9GZV8 571 aa10.91□□□□□ -0.66
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 H0YIZ8 118 aa10.91□□□□□ -0.66
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CRHP06850 196 aa10.91□□□□□ -0.66
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CELA3BP08861 270 aa10.91□□□□□ -0.66
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RPS2P15880 293 aaKnown RBP10.91□□□□□ -0.66
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TAS2R31P59538 309 aa10.91□□□□□ -0.66
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FGL1Q08830 312 aa10.91□□□□□ -0.66
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP10.91□□□□□ -0.66
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP10.91□□□□□ -0.66
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SCARB1Q8WTV0 552 aa10.91□□□□□ -0.66
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ST8SIA2Q92186 375 aa10.91□□□□□ -0.66
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RGCCQ9H4X1 137 aa10.91□□□□□ -0.66
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SLC22A20A6NK97 555 aa10.9□□□□□ -0.66
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP10.9□□□□□ -0.66
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PHLDA2Q53GA4 152 aa10.9□□□□□ -0.66
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 COLCA1Q6ZS62 124 aa10.9□□□□□ -0.66
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TMEM185AQ8NFB2 350 aa10.9□□□□□ -0.66
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 OR5M9Q8NGP3 310 aa10.9□□□□□ -0.66
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 OR6K3Q8NGY3 331 aa10.9□□□□□ -0.66
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.66
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.66
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 GTF3C1Q12789 2109 aa10.9□□□□□ -0.66
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa10.9□□□□□ -0.66
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP10.9□□□□□ -0.66
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa10.9□□□□□ -0.66
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZNF732B4DXR9 585 aa10.9□□□□□ -0.66
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SIGLEC5O15389 551 aa10.9□□□□□ -0.66
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PSMB6P28072 239 aa10.9□□□□□ -0.66
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 AGTR1P30556 359 aa10.9□□□□□ -0.66
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 WNT5AP41221 380 aa10.9□□□□□ -0.66
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa10.9□□□□□ -0.66
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SLC51BQ86UW2 128 aa10.9□□□□□ -0.66
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TMEM200AQ86VY9 491 aa10.9□□□□□ -0.66
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CCDC54Q8NEL0 328 aa10.9□□□□□ -0.66
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SPSB4Q96A44 273 aa10.9□□□□□ -0.66
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 POM121L2Q96KW2 1035 aa10.9□□□□□ -0.66
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 IP6K3Q96PC2 410 aa10.9□□□□□ -0.66
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 OR5AC2Q9NZP5 309 aa10.9□□□□□ -0.66
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.66
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ICE1Q9Y2F5 2266 aa10.9□□□□□ -0.66
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.66
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MSGN1A6NI15 193 aa10.9□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 F5H0A9 414 aaPredicted RBP10.9□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SYNGR1O43759 233 aa10.9□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 B3GALNT1O75752 331 aa10.9□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RBMXP38159 391 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TNFSF10P50591 281 aa10.9□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RBM11P57052 281 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 S100A10P60903 97 aa10.9□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 OR2T2Q6IF00 324 aa10.9□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MDP1Q86V88 176 aa10.9□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CCDC28AQ8IWP9 274 aa10.9□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 WBP1Q96G27 269 aa10.9□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 GPHA2Q96T91 129 aa10.9□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SDHAF2Q9NX18 166 aa10.9□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 AUP1Q9Y679 476 aa10.9□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CADP27708 2225 aa10.89□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZNF724A8MTY0 619 aa10.89□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa10.89□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LYZL6O75951 148 aa10.89□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 HLA-GP17693 338 aa10.89□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PLP2Q04941 152 aa10.89□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RAB32Q13637 225 aa10.89□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP10.89□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PIP4P1Q86T03 277 aa10.89□□□□□ -0.67
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 C17orf78Q8N4C9 275 aa10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms