RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428858.1

TTC28-AS1-209, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene TTC28-AS1, Length 565 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 WIPI2Q9Y4P8 454 aa6.86□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NPTNQ9Y639 398 aa6.86□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MYO9AB2RTY4 2548 aa6.86□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 A0A1W2PPK0 400 aa6.85□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa6.85□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LGALS8O00214 317 aa6.85□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PPIHO43447 177 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SNAPC5O75971 98 aa6.85□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PAHP00439 452 aa6.85□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HCKP08631 526 aa6.85□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PGA5P0DJD9 388 aa6.85□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CD36P16671 472 aa6.85□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ADRA2CP18825 462 aa6.85□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CPT2P23786 658 aa6.85□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MDH2P40926 338 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZNF45Q02386 682 aa6.85□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PDZK1IP1Q13113 114 aa6.85□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZMYND11Q15326 602 aa6.85□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa6.85□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZNF404Q494X3 552 aa6.85□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DDI2Q5TDH0 399 aa6.85□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa6.85□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SLC25A26Q70HW3 274 aa6.85□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LRRTM1Q86UE6 522 aa6.85□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ANGPTL5Q86XS5 388 aa6.85□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FAM90A1Q86YD7 464 aa6.85□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SETD6Q8TBK2 473 aa6.85□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SLITRK2Q9H156 845 aa6.85□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RHOFQ9HBH0 211 aa6.85□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HES4Q9HCC6 221 aa6.85□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RASL12Q9NYN1 266 aa6.85□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MTCH1Q9NZJ7 389 aa6.85□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OTOGQ6ZRI0 2925 aa6.84□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TEX15Q9BXT5 2789 aa6.84□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PPIAL4EA0A075B759 164 aa6.84□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa6.84□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa6.84□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa6.84□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OOEPA6NGQ2 149 aa6.84□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PPIAL4DF5H284 164 aa6.84□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 AKR7A2O43488 359 aa6.84□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NDUFA2O43678 99 aa6.84□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SYNGR1O43759 233 aa6.84□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KDM4BO94953 1096 aa6.84□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 IGKV1D-12P01611 117 aa6.84□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MAS1P04201 325 aa6.84□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PPIAL4FP0DN26 164 aa6.84□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 EGR1P18146 543 aa6.84□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 USF1P22415 310 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GADD45AP24522 165 aa6.84□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CFPP27918 469 aa6.84□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ERP29P30040 261 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RBMXP38159 391 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PTGFRP43088 359 aa6.84□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 POU3F4P49335 361 aa6.84□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SSTP61278 116 aa6.84□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 IKZF1Q13422 519 aa6.84□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 AVPI1Q5T686 147 aa6.84□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 C22orf42Q6IC83 251 aa6.84□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ASCL4Q6XD76 172 aa6.84□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RNF144BQ7Z419 303 aa6.84□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MKXQ8IYA7 352 aa6.84□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 Q8IYB0 196 aa6.84□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SLC38A6Q8IZM9 456 aa6.84□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SPICQ8N5J4 248 aa6.84□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 Q8NFD4 153 aa6.84□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PXT1Q8NFP0 134 aa6.84□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TMIGD2Q96BF3 282 aa6.84□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SPACA5Q96QH8 159 aa6.84□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 REG4Q9BYZ8 158 aa6.84□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OR51E2Q9H255 320 aa6.84□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 IL36GQ9NZH8 169 aa6.84□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SSR3Q9UNL2 185 aa6.84□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PPIAL4AQ9Y536 164 aa6.84□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RTTNQ86VV8 2226 aa6.84□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa6.83□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SHISA3A0PJX4 238 aa6.83□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RNF223E7ERA6 249 aa6.83□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 J3QRK9 145 aa6.83□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PDCD5O14737 125 aa6.83□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 WNT9BO14905 357 aa6.83□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ANGPTL7O43827 346 aa6.83□□□□□ -1.32
TTC28-AS1-209ENST00000428858 UPK1BO75841 260 aa6.83□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.4 ms