RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428482.5

HDLBP-216, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-216ENST00000428482 FGF12P61328 243 aa8.47□□□□□ -1.05
HDLBP-216ENST00000428482 RPS25P62851 125 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
HDLBP-216ENST00000428482 KLRD1Q13241 179 aa8.47□□□□□ -1.05
HDLBP-216ENST00000428482 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
HDLBP-216ENST00000428482 DGUOKQ16854 277 aa8.47□□□□□ -1.05
HDLBP-216ENST00000428482 Q499Y3 187 aa8.47□□□□□ -1.05
HDLBP-216ENST00000428482 CROCCP3Q8IVE0 287 aa8.47□□□□□ -1.05
HDLBP-216ENST00000428482 PDZD9Q8IXQ8 264 aa8.47□□□□□ -1.05
HDLBP-216ENST00000428482 RDH10Q8IZV5 341 aa8.47□□□□□ -1.05
HDLBP-216ENST00000428482 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa8.47□□□□□ -1.05
HDLBP-216ENST00000428482 ZDHHC22Q8N966 263 aa8.47□□□□□ -1.05
HDLBP-216ENST00000428482 SCCPDHQ8NBX0 429 aa8.47□□□□□ -1.05
HDLBP-216ENST00000428482 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa8.47□□□□□ -1.05
HDLBP-216ENST00000428482 OR51A4Q8NGJ6 313 aa8.47□□□□□ -1.05
HDLBP-216ENST00000428482 C10orf35Q96D05 121 aa8.47□□□□□ -1.05
HDLBP-216ENST00000428482 TBX15Q96SF7 602 aa8.47□□□□□ -1.05
HDLBP-216ENST00000428482 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
HDLBP-216ENST00000428482 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
HDLBP-216ENST00000428482 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa8.47□□□□□ -1.05
HDLBP-216ENST00000428482 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
HDLBP-216ENST00000428482 SLC22A4Q9H015 551 aa8.47□□□□□ -1.05
HDLBP-216ENST00000428482 RGCCQ9H4X1 137 aa8.47□□□□□ -1.05
HDLBP-216ENST00000428482 IL36RNQ9UBH0 155 aa8.47□□□□□ -1.05
HDLBP-216ENST00000428482 DNAJB11Q9UBS4 358 aa8.47□□□□□ -1.05
HDLBP-216ENST00000428482 CLN8Q9UBY8 286 aa8.47□□□□□ -1.05
HDLBP-216ENST00000428482 AUP1Q9Y679 476 aa8.47□□□□□ -1.05
HDLBP-216ENST00000428482 V9GYS6 101 aa8.47□□□□□ -1.05
HDLBP-216ENST00000428482 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa8.46□□□□□ -1.06
HDLBP-216ENST00000428482 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa8.46□□□□□ -1.06
HDLBP-216ENST00000428482 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
HDLBP-216ENST00000428482 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa8.46□□□□□ -1.06
HDLBP-216ENST00000428482 ANXA2P2A6NMY6 339 aa8.46□□□□□ -1.06
HDLBP-216ENST00000428482 DHRS7CA6NNS2 312 aa8.46□□□□□ -1.06
HDLBP-216ENST00000428482 ZNF879B4DU55 563 aa8.46□□□□□ -1.06
HDLBP-216ENST00000428482 IFNL4K9M1U5 179 aa8.46□□□□□ -1.06
HDLBP-216ENST00000428482 DVL1O14640 695 aa8.46□□□□□ -1.06
HDLBP-216ENST00000428482 TMPRSS2O15393 492 aa8.46□□□□□ -1.06
HDLBP-216ENST00000428482 PLATP00750 562 aa8.46□□□□□ -1.06
HDLBP-216ENST00000428482 SRMP19623 302 aa8.46□□□□□ -1.06
HDLBP-216ENST00000428482 PSMD7P51665 324 aa8.46□□□□□ -1.06
HDLBP-216ENST00000428482 HILS1P60008 231 aa8.46□□□□□ -1.06
HDLBP-216ENST00000428482 VBP1P61758 197 aa8.46□□□□□ -1.06
HDLBP-216ENST00000428482 PAX8Q06710 450 aa8.46□□□□□ -1.06
HDLBP-216ENST00000428482 SPCS2Q15005 226 aa8.46□□□□□ -1.06
HDLBP-216ENST00000428482 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
HDLBP-216ENST00000428482 MOB3CQ70IA8 216 aa8.46□□□□□ -1.06
HDLBP-216ENST00000428482 CEACAM19Q7Z692 300 aa8.46□□□□□ -1.06
HDLBP-216ENST00000428482 CALHM1Q8IU99 346 aa8.46□□□□□ -1.06
HDLBP-216ENST00000428482 PARP16Q8N5Y8 322 aa8.46□□□□□ -1.06
HDLBP-216ENST00000428482 ZFP41Q8N8Y5 198 aa8.46□□□□□ -1.06
HDLBP-216ENST00000428482 TMEM203Q969S6 136 aa8.46□□□□□ -1.06
HDLBP-216ENST00000428482 ERGIC1Q969X5 290 aa8.46□□□□□ -1.06
HDLBP-216ENST00000428482 RNF170Q96K19 258 aa8.46□□□□□ -1.06
HDLBP-216ENST00000428482 MICU1Q9BPX6 476 aa8.46□□□□□ -1.06
HDLBP-216ENST00000428482 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa8.46□□□□□ -1.06
HDLBP-216ENST00000428482 DCSTAMPQ9H295 470 aa8.46□□□□□ -1.06
HDLBP-216ENST00000428482 OR51I2Q9H344 312 aa8.46□□□□□ -1.06
HDLBP-216ENST00000428482 C14orf119Q9NWQ9 140 aa8.46□□□□□ -1.06
HDLBP-216ENST00000428482 MIOXQ9UGB7 285 aa8.46□□□□□ -1.06
HDLBP-216ENST00000428482 ZNF222Q9UK12 451 aa8.46□□□□□ -1.06
HDLBP-216ENST00000428482 HHLA2Q9UM44 414 aa8.46□□□□□ -1.06
HDLBP-216ENST00000428482 FOXJ3Q9UPW0 622 aa8.46□□□□□ -1.06
HDLBP-216ENST00000428482 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
HDLBP-216ENST00000428482 DNAH3Q8TD57 4116 aa8.46□□□□□ -1.06
HDLBP-216ENST00000428482 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-216ENST00000428482 A0A075B6Q4 140 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-216ENST00000428482 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-216ENST00000428482 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-216ENST00000428482 MEGF11A6BM72 1044 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-216ENST00000428482 F8VVB4 439 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-216ENST00000428482 F8VWA3 439 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-216ENST00000428482 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-216ENST00000428482 CFL1P23528 166 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-216ENST00000428482 CFPP27918 469 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-216ENST00000428482 CFHR2P36980 270 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-216ENST00000428482 RPS19P39019 145 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-216ENST00000428482 DDOSTP39656 456 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-216ENST00000428482 RANBP1P43487 201 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-216ENST00000428482 NCS1P62166 190 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-216ENST00000428482 TUSC1Q2TAM9 212 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-216ENST00000428482 TMEM42Q69YG0 159 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-216ENST00000428482 NLRC3Q7RTR2 1065 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-216ENST00000428482 CDH26Q8IXH8 852 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-216ENST00000428482 PNKDQ8N490 385 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-216ENST00000428482 BPIFB2Q8N4F0 458 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-216ENST00000428482 ZNF676Q8N7Q3 588 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-216ENST00000428482 RAB40AQ8WXH6 277 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-216ENST00000428482 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-216ENST00000428482 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-216ENST00000428482 DERL3Q96Q80 235 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-216ENST00000428482 PCGF1Q9BSM1 259 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-216ENST00000428482 MRI1Q9BV20 369 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-216ENST00000428482 TMED9Q9BVK6 235 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-216ENST00000428482 SIRPDQ9H106 197 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-216ENST00000428482 MMP27Q9H306 513 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-216ENST00000428482 SIRT7Q9NRC8 400 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-216ENST00000428482 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-216ENST00000428482 MPC1Q9Y5U8 109 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-216ENST00000428482 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa8.44□□□□□ -1.06
HDLBP-216ENST00000428482 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa8.44□□□□□ -1.06
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