RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 CD200P41217 278 aa9.8□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 LRRC10Q5BKY1 277 aa9.8□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 OR2A2Q6IF42 318 aa9.8□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 C20orf196Q8IYI0 205 aa9.8□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 LYG1Q8N1E2 194 aa9.8□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 DPF1Q92782 380 aa9.8□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 FBXO17Q96EF6 278 aa9.8□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 POMT1Q9Y6A1 747 aa9.8□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 C9orf170A2RU37 121 aa9.8□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM24AA6NFZ4 105 aa9.8□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 RGS13O14921 159 aa9.8□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 GPR3P46089 330 aa9.8□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 WNT3P56703 355 aa9.8□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 INSL4Q14641 139 aa9.8□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 VWA1Q6PCB0 445 aa9.8□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa9.8□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 SPEM1Q8N4L4 309 aa9.8□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 OR4F17Q8NGA8 305 aa9.8□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 OR10V1Q8NGI7 309 aa9.8□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 ZG16BQ96DA0 208 aa9.8□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 FAAP24Q9BTP7 215 aa9.8□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 CACNG5Q9UF02 275 aa9.8□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 THSD7BQ9C0I4 1608 aa9.8□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 TRIP11Q15643 1979 aa9.8□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 HMSDA8MTL9 139 aa9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 SPRY3O43610 288 aa9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 GATCO43716 136 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 TNFSF15O95150 251 aa9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 HTR1DP28221 377 aa9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 LPAR6P43657 344 aa9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 RHOBP62745 196 aa9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 IL13RA2Q14627 380 aa9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF793Q6ZN11 406 aa9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 MRGPREQ86SM8 312 aa9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 OR2A5Q96R48 311 aa9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM147Q9BVK8 224 aa9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 IL36GQ9NZH8 169 aa9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 ALG1L2C9J202 215 aa9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 CST2P09228 141 aa9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 CEACAM6P40199 344 aa9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 OPRK1P41145 380 aa9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 GNG4P50150 75 aa9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 PMS2P11Q13670 270 aa9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 LIAT1Q6ZQX7 453 aa9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 C6orf201Q7Z4U5 140 aa9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 OR13G1Q8NGZ3 307 aa9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 MFRPQ9BY79 579 aa9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 NAA60Q9H7X0 242 aa9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 MBTPS2O43462 519 aa9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 RBP4P02753 201 aa9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 IGFBP7Q16270 282 aa9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 IER2Q9BTL4 223 aa9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 SARGQ9BW04 601 aa9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 METTL12A8MUP2 240 aa9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 PEX11BO96011 259 aa9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 HLA-DRB3P79483 266 aa9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 ZXDAP98168 799 aa9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF117Q03924 483 aa9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 C17orf47Q8NEP4 570 aa9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 OR2Z1Q8NG97 314 aa9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 GNRHR2Q96P88 292 aa9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 PRO1933Q9H354 126 aa9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC25A22Q9H936 323 aa9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 PSG11Q9UQ72 335 aa9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 SHISA8B8ZZ34 492 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 GLULP15104 373 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF32P17041 273 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 OR10C1Q96KK4 312 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 P4HTMQ9NXG6 502 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 TRAV17A0A0B4J275 112 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 OPN1MWP04001 364 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 OPN1MW2P0DN77 364 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 OPN1MW3P0DN78 364 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 DEFB109BQ30KR1 87 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 DHRS11Q6UWP2 260 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 CD300LDQ6UXZ3 194 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 DUSP18Q8NEJ0 188 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-202ENST00000426333 FGF14Q92915 247 aa9.78□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.4 ms