RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425388.1

LINC00501-201, long intergenic non-protein coding RNA 501, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LINC00501, Length 2,046 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00501-201ENST00000425388 AK4P27144 223 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 TBPL1P62380 186 aa7.21□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 ZNF117Q03924 483 aa7.21□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 SLAQ13239 276 aa7.21□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 NSDHLQ15738 373 aa7.21□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 ANKRD55Q3KP44 614 aa7.21□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 ELOA3BQ3SY89 546 aa7.21□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa7.21□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa7.21□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 AGBL4Q5VU57 503 aa7.21□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 COLCA1Q6ZS62 124 aa7.21□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 SLC16A9Q7RTY1 509 aa7.21□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 HMGN2P46Q86SG4 172 aa7.21□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 TMEM156Q8N614 296 aa7.21□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 STPG4Q8N801 248 aa7.21□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 SLC38A9Q8NBW4 561 aa7.21□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 KLHDC9Q8NEP7 349 aa7.21□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 ELOA3Q8NG57 546 aa7.21□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 OR5L1Q8NGL2 311 aa7.21□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 OR4D5Q8NGN0 318 aa7.21□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 PFN4Q8NHR9 129 aa7.21□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 TMEM56Q96MV1 263 aa7.21□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 DCBLD2Q96PD2 775 aa7.21□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 OR7D2Q96RA2 312 aa7.21□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 P2RX4Q99571 388 aa7.21□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 LANCL2Q9NS86 450 aa7.21□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 C20orf141Q9NUB4 165 aa7.21□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 BET1LQ9NYM9 111 aa7.21□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 WNT16Q9UBV4 365 aa7.21□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa7.21□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 LAMP3Q9UQV4 416 aa7.21□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa7.21□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 FAM166BA8MTA8 275 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 NPIPA7E9PJI5 369 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 C1QL1O75973 258 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 NDUFB2O95178 105 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 SEMA4FO95754 770 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 ABHD16AO95870 558 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 C8AP07357 584 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 NPIPA8P0DM63 369 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 HOXB2P14652 356 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 FSTP19883 344 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 GNRHRP30968 328 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 BLKP51451 505 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP7.2□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 ZNF136P52737 540 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 CLDN6P56747 220 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 TPPP2P59282 170 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 RAB11AP62491 216 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 SMIM21Q3B7S5 101 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 PRR27Q6MZM9 219 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 OLIG3Q7RTU3 272 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 CMTM1Q8IZ96 169 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 CFAP52Q8N1V2 620 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 NPEPL1Q8NDH3 523 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 CLDND2Q8NHS1 167 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 ERGIC1Q969X5 290 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 KXD1Q9BQD3 176 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 GPR84Q9NQS5 396 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 ZNF319Q9P2F9 582 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 TRAV27A0A087WT01 109 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 HELTA6NFD8 242 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 A8MZ25 164 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 M0QZ24 198 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 HRKO00198 91 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 TNFSF15O95150 251 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 ZNF43P17038 809 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 RBMXP38159 391 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 RAB28P51157 221 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 MFAP4P55083 255 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 IL13RA2Q14627 380 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 SLC17A1Q14916 467 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 MMDQ15546 238 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 TMEM41BQ5BJD5 291 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 TCEAL5Q5H9L2 206 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 OR4C11Q6IEV9 310 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 COMMD2Q86X83 199 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 C20orf196Q8IYI0 205 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 OR4K13Q8NH42 304 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00501-201ENST00000425388 TMEM234Q8WY98 164 aa7.2□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.9 ms