RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 JTBO76095 146 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 CD5P06127 495 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 ECI1P42126 302 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 KCNJ3P48549 501 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 HIST1H3AP68431 136 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 PCOLCEQ15113 449 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 PPA1Q15181 289 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 SWI5Q1ZZU3 235 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 TSPO2Q5TGU0 170 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 DHRS11Q6UWP2 260 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 HIST2H3AQ71DI3 136 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 GLYATL2Q8WU03 294 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 METTL9Q9H1A3 318 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 TUBD1Q9UJT1 453 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 FGF5P12034 268 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 F2RL1P55085 397 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 AKR1E2Q96JD6 320 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 PARP11Q9NR21 331 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 TNFSF11O14788 317 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 AKR1C3P42330 323 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 PEA15Q15121 130 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 PLXDC2Q6UX71 529 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 KIRREL1Q96J84 757 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 BIN3Q9NQY0 253 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 DIRAS3O95661 229 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 DHRS13Q6UX07 377 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 C12orf57Q99622 126 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 DKKL1Q9UK85 242 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 LOXL2Q9Y4K0 774 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 OR5AC1P0C628 307 aa16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 ABCA11PQ4W5N1 156 aa16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 ZIC4Q8N9L1 334 aa16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 SECTM1Q8WVN6 248 aa16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 REEP6Q96HR9 211 aa16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 MGAQ8IWI9 3026 aa16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A087WZY1 265 aa16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 XRCC2O43543 280 aa16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 ZIC3O60481 467 aa16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 APOC1P02654 83 aa16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 MBPP02686 304 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 HEXAP06865 529 aa16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF728P0DKX0 622 aa16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 OTX2P32243 289 aa16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 PPT1P50897 306 aa16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 HGFACQ04756 655 aa16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 PHLDA2Q53GA4 152 aa16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 OPN5Q6U736 354 aa16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 NECAP2Q9NVZ3 263 aa16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 NBEAQ8NFP9 2946 aa16.22■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A0J9YW62 118 aa16.22■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 VAMP5O95183 116 aa16.22■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 PATE4P0C8F1 98 aa16.22■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 LIFP15018 202 aa16.22■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF774Q6NX45 483 aa16.22■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 LYZL2Q7Z4W2 148 aa16.22■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 C10orf35Q96D05 121 aa16.22■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 EDARQ9UNE0 448 aa16.22■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa16.22■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 AKAP13Q12802 2813 aa16.22■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 SGCEO43556 437 aa16.22■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 NME2P1O60361 137 aa16.22■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 CD59P13987 128 aa16.22■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 IL11RAQ14626 422 aa16.22■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 Q6ZSR3 168 aa16.22■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 PROK2Q9HC23 129 aa16.22■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 DECR2Q9NUI1 292 aa16.22■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM157AC9JC47 383 aa16.21■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 LCATP04180 440 aa16.21■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 PDCD1Q15116 288 aa16.21■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 PIGYQ3MUY2 71 aa16.21■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 SRXN1Q9BYN0 137 aa16.21■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 NAA60Q9H7X0 242 aa16.21■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 ONECUT2O95948 504 aa16.21■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF616Q08AN1 781 aa16.21■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM187Q14656 261 aa16.21■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM27BQ5VT28 67 aa16.21■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 SPSB1Q96BD6 273 aa16.21■□□□□ 0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 SHANK1Q9Y566 2161 aa16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms