RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411000.1

RNU6-172P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 172, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-172P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-172P-201ENST00000411000 CYP4Z1Q86W10 505 aa-2.32□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa-2.32□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 C17orf78Q8N4C9 275 aa-2.32□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRELID2Q8N945 189 aa-2.32□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF555Q8NEP9 628 aa-2.32□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR5AU1Q8NGC0 362 aa-2.32□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 SFXN5Q8TD22 340 aa-2.32□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP-2.32□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 RASSF5Q8WWW0 418 aa-2.32□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC7A6Q92536 515 aa-2.32□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 PLEKHB2Q96CS7 222 aa-2.32□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 MUCL1Q96DR8 90 aa-2.32□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 CFAP36Q96G28 342 aa-2.32□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 COQ2Q96H96 371 aa-2.32□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 MS4A4EQ96PG1 132 aa-2.32□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 GBP5Q96PP8 586 aa-2.32□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP-2.32□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP-2.32□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 ANKEF1Q9NU02 776 aa-2.32□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC39A1Q9NY26 324 aa-2.32□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 TAGLN3Q9UI15 199 aa-2.32□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 HS3ST2Q9Y278 367 aa-2.32□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 RP1P56715 2156 aa-2.32□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 SPG11Q96JI7 2443 aa-2.32□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP-2.32□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 MAP3K19Q56UN5 1328 aa-2.33□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 CDHR2Q9BYE9 1310 aa-2.33□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 LOC100653049A0A140TA62 436 aa-2.33□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 RNF222A6NCQ9 220 aa-2.33□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 ARGFXA6NJG6 315 aa-2.33□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa-2.33□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 PSTPIP1O43586 416 aa-2.33□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 KERAO60938 352 aa-2.33□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 ATP6V1G1O75348 118 aa-2.33□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 CRCPO75575 148 aa-2.33□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 KRT34O76011 436 aa-2.33□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 PLEKHA8P1O95397 391 aa-2.33□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 SOX14O95416 240 aa-2.33□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP-2.33□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF728P0DKX0 622 aa-2.33□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 BMI1P35226 326 aa-2.33□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 FDFT1P37268 417 aa-2.33□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 CA7P43166 264 aa-2.33□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 MAGEA2P43356 314 aa-2.33□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 MTPNP58546 118 aa-2.33□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 SSTP61278 116 aa-2.33□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 CNBPP62633 177 aaKnown RBP-2.33□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP-2.33□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC35A2P78381 396 aa-2.33□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 PDE6HQ13956 83 aa-2.33□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 COG2Q14746 738 aa-2.33□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR8G1Q15617 311 aa-2.33□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 USH1GQ495M9 461 aa-2.33□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 LINC01620Q4KN68 170 aa-2.33□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 TP53I3Q53FA7 332 aa-2.33□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 ACTBL2Q562R1 376 aa-2.33□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 SPRNQ5BIV9 151 aa-2.33□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP-2.33□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZYG11AQ6WRX3 759 aa-2.33□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP-2.33□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 Q8IZM0 81 aa-2.33□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR2M7Q8NG81 312 aa-2.33□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 CD200R1Q8TD46 325 aa-2.33□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 RPS4Y2Q8TD47 263 aa-2.33□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 RDH12Q96NR8 316 aa-2.33□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP-2.33□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 PCGF6Q9BYE7 350 aa-2.33□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 NDEL1Q9GZM8 345 aa-2.33□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 RHOJQ9H4E5 214 aa-2.33□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP-2.33□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 MED29Q9NX70 200 aa-2.33□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 IL36GQ9NZH8 169 aa-2.33□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 TAC3Q9UHF0 121 aa-2.33□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa-2.33□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 UNC13BO14795 1591 aa-2.33□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP-2.33□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 WDR90Q96KV7 1748 aa-2.34□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 ABCB11O95342 1321 aa-2.34□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 AKAP9Q99996 3911 aa-2.34□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa-2.34□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 A0A1W2PNV4 684 aa-2.34□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 URADA6NGE7 173 aa-2.34□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 SMIM9A6NGZ8 99 aa-2.34□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM212A6NML5 194 aa-2.34□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 M0R2T5 61 aa-2.34□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 GPR31O00270 319 aa-2.34□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 RAD1O60671 282 aa-2.34□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 AP2A1O95782 977 aa-2.34□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 MT1AP04731 61 aa-2.34□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 SPRR1AP35321 89 aa-2.34□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP-2.34□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 RAB9AP51151 201 aa-2.34□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 MPP1Q00013 466 aa-2.34□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 GABRA6Q16445 453 aa-2.34□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 MAPK6Q16659 721 aa-2.34□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP-2.34□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa-2.34□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 KRT80Q6KB66 452 aa-2.34□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 IYDQ6PHW0 289 aa-2.34□□□□□ -2.78
RNU6-172P-201ENST00000411000 CLEC4FQ8N1N0 589 aa-2.34□□□□□ -2.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms