RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409024.3

POLR1A-202, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 560 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-202ENST00000409024 OR13G1Q8NGZ3 307 aa8.37□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 LILRB4Q8NHJ6 448 aa8.37□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 RADILQ96JH8 1075 aa8.37□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa8.37□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 CACNG6Q9BXT2 260 aa8.37□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 CXXC4Q9H2H0 198 aa8.37□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 BANF2Q9H503 90 aa8.37□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 SPACA1Q9HBV2 294 aa8.37□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 EDARQ9UNE0 448 aa8.37□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa8.37□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 MED13LQ71F56 2210 aa8.36□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa8.36□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 A0A0A6YYD4 124 aa8.36□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa8.36□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa8.36□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 MEIOCA2RUB1 952 aa8.36□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 SOCS1O15524 211 aa8.36□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 PFDN1O60925 122 aa8.36□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 DHFRP00374 187 aa8.36□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 IGKV1D-12P01611 117 aa8.36□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 TCRBP04435 133 aa8.36□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 TRAPPC2P0DI81 140 aa8.36□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 TRAPPC2BP0DI82 140 aa8.36□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 SPNP16150 400 aa8.36□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 AGAP20933 346 aa8.36□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 CA6P23280 308 aa8.36□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 CCKARP32238 428 aa8.36□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 SRP9P49458 86 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 RBM11P57052 281 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 IL13RA2Q14627 380 aa8.36□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 OR8G1Q15617 311 aa8.36□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP8.36□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 PLAC9Q5JTB6 97 aa8.36□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 SPATA46Q5T0L3 261 aa8.36□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 FJX1Q86VR8 437 aa8.36□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 CALHM1Q8IU99 346 aa8.36□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa8.36□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 OR56B4Q8NH76 319 aa8.36□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 ST8SIA4Q92187 359 aa8.36□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 NEDD4LQ96PU5 975 aa8.36□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 NICN1Q9BSH3 213 aa8.36□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 PECRQ9BY49 303 aa8.36□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 CHST6Q9GZX3 395 aa8.36□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 TLNRD1Q9H1K6 362 aa8.36□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF442Q9H7R0 627 aa8.36□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 IFT22Q9H7X7 185 aa8.36□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa8.36□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 NLKQ9UBE8 527 aa8.36□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 NDRG3Q9UGV2 375 aa8.36□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa8.36□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 OSGIN2Q9Y236 505 aa8.36□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM235A6NFC5 223 aa8.35□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa8.35□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 ANGPTL7O43827 346 aa8.35□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 PRAF2O60831 178 aa8.35□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 PDCD6O75340 191 aa8.35□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 GNB3P16520 340 aa8.35□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 FUT3P21217 361 aa8.35□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 DTYMKP23919 212 aa8.35□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 HLA-DMAP28067 261 aa8.35□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 BTCP35070 178 aa8.35□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 MPV17P39210 176 aa8.35□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 MECP2P51608 486 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 ARFRP1Q13795 201 aa8.35□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 STEAP1BQ6NZ63 245 aa8.35□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa8.35□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 OR10K1Q8NGX5 313 aa8.35□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 CCDC120Q96HB5 630 aa8.35□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 MED30Q96HR3 178 aa8.35□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa8.35□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 DIRC2Q96SL1 478 aa8.35□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 OR51B6Q9H340 312 aa8.35□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 IFT46Q9NQC8 304 aa8.35□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 SLC2A8Q9NY64 477 aa8.35□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa8.35□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 ST3GAL6Q9Y274 331 aa8.35□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP8.35□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa8.34□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 A0A1W2PP11 408 aa8.34□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 DISC1C4P0D8 188 aa8.34□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 RAB3DO95716 219 aa8.34□□□□□ -1.07
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