RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380221.7

TRAPPC10-202, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC10, Length 1,763 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-202ENST00000380221 ENKURQ8TC29 256 aa23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 ITLN1Q8WWA0 313 aa23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 MEGF10Q96KG7 1140 aa23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 PKIBQ9C010 78 aa23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 METTL9Q9H1A3 318 aa23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 UBTD1Q9HAC8 227 aa23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 MTCH1Q9NZJ7 389 aa23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 TENM4Q6N022 2769 aa23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 LRRK2Q5S007 2527 aa23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 J3QT63 122 aa23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 COX6B1P14854 86 aa23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 MPZP25189 248 aa23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 PRSS3P35030 304 aa23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 NPBWR2P48146 333 aa23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF826PQ6ZT77 177 aa23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 CDH24Q86UP0 819 aa23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 IL19Q9UHD0 177 aa23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 A0A0A6YYD4 124 aa23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 SFTPBP07988 381 aa23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 CHRM2P08172 466 aa23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 SOD3P08294 240 aa23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 TNFSF4P23510 183 aa23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 GUCA2AQ02747 115 aa23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 IL24Q13007 206 aa23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 FAM189A2Q15884 450 aa23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 MKXQ8IYA7 352 aa23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 CHST4Q8NCG5 386 aa23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR10R2Q8NGX6 335 aa23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 A6NLC8 198 aa23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 ADH4P08319 380 aa23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 MGMTP16455 207 aa23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 RBMXP38159 391 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 CCL8P80075 99 aa23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF488Q96MN9 340 aa23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 DIRC2Q96SL1 478 aa23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 TLNRD1Q9H1K6 362 aa23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 MS4A5Q9H3V2 200 aa23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 C3orf80F5H4A9 247 aa23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 HTR3BO95264 441 aa23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 ECDO95905 644 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 CYB5AP00167 134 aa23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 CD8AP01732 235 aa23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 DANCRP0C864 163 aa23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 BCL3P20749 454 aa23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 COL8A1P27658 744 aa23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 SAXO1Q8IYX7 474 aa23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 CBLN4Q9NTU7 201 aa23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 LRBAP50851 2863 aa23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 CENPXA8MT69 81 aa23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 F8VVB4 439 aa23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 F8VWA3 439 aa23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 H7C417 338 aa23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 RBBP9O75884 186 aa23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 CSTBP04080 98 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 GSTT2BP0CG30 244 aa23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 DYRK1AQ13627 763 aa23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF260Q3ZCT1 412 aa23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 AGAP6Q5VW22 663 aa23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 TMEM200AQ86VY9 491 aa23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR51T1Q8NGJ9 327 aa23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 MMP28Q9H239 520 aa23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 MTFP1Q9UDX5 166 aa23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 AP3S2P59780 193 aa23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 CDNFQ49AH0 187 aa23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR56B1Q8NGI3 324 aa23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 GPX8Q8TED1 209 aa23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 SELENOIQ9C0D9 397 aa23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 C1orf123Q9NWV4 160 aa23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 IL36GQ9NZH8 169 aa23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 CACNA1DQ01668 2161 aa23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 FUOMA2VDF0 154 aa23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 TMEM235A6NFC5 223 aa23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 TRAPPC2LH3BP13 241 aa23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 SULT1C2O00338 296 aa23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 SOCS1O15524 211 aa23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 CD55P08174 381 aa23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 C11orf71Q6IPW1 123 aa23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 WDR82Q6UXN9 313 aa23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 Q6ZTK2 550 aa23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 MOGAT3Q86VF5 341 aa23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 SEH1LQ96EE3 360 aa23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
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