RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371953.7

PTEN-201, Transcript of phosphatase and tensin homolog, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTEN, Length 9,027 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTEN-201ENST00000371953 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa14.89□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 CLDN16Q9Y5I7 305 aa14.89□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 SLC2A10O95528 541 aa14.88□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 ORM1P02763 201 aa14.88□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 OR5G3P0C626 314 aa14.88□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 BCL3P20749 454 aa14.88□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 RPL11P62913 178 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 AAED1Q7RTV5 226 aa14.88□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 EDARADDQ8WWZ3 215 aa14.88□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 NAA60Q9H7X0 242 aa14.88□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 USP3Q9Y6I4 520 aa14.88□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 THADAQ6YHU6 1953 aa14.88□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 H3BNC9 293 aa14.88□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 APCSP02743 223 aa14.88□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 TOX2Q96NM4 488 aa14.88□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 NEU3Q9UQ49 428 aa14.88□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 PRAMEF20Q5VT98 475 aa14.88□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 PARM1Q6UWI2 310 aa14.88□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 EGLN1Q9GZT9 426 aa14.88□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 PLXNB1O43157 2135 aa14.88□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 PTGER1P34995 402 aa14.88□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 SKP2Q13309 424 aa14.88□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 NHLRC3Q5JS37 347 aa14.88□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 MOGAT1Q96PD6 335 aa14.88□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 PMCHL2Q9BQD1 86 aa14.88□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa14.88□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 SLC37A1P57057 533 aa14.88□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa14.88□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 FCMRO60667 390 aa14.88□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 SCGB1A1P11684 91 aa14.88□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 NKAIN4Q8IVV8 208 aa14.88□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 S1PR5Q9H228 398 aa14.88□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 HPP00738 406 aa14.88□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 OPRM1P35372 400 aa14.88□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 GUCA2BQ16661 112 aa14.88□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 C1orf140Q5VVS0 124 aa14.88□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 SAMD13Q5VXD3 122 aa14.88□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 TMED7Q9Y3B3 224 aa14.88□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 GJB3O75712 270 aa14.87□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 TMEM207Q6UWW9 146 aa14.87□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa14.87□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa14.87□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 HS3ST1O14792 307 aa14.87□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 OR2J3O76001 311 aa14.87□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 CYB561P49447 251 aa14.87□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 SLC38A11Q08AI6 406 aa14.87□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 NIT1Q86X76 327 aa14.87□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 TMEFF1Q8IYR6 380 aa14.87□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 PIGTQ969N2 578 aa14.87□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 SAP30LQ9HAJ7 183 aa14.87□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 GPR84Q9NQS5 396 aa14.87□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 PRSS23O95084 383 aa14.87□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 UBALD1Q8TB05 177 aa14.87□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 MMACHCQ9Y4U1 282 aa14.87□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 SH2D1BO14796 132 aa14.87□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 CNIH1O95406 144 aa14.87□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 SLC35E2P0CK97 266 aa14.87□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 GLI4P10075 376 aa14.87□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 CAMKMTQ7Z624 323 aa14.87□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 TMEM183AQ8IXX5 376 aa14.87□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 AAMDCQ9H7C9 122 aa14.87□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 SIPA1L1O43166 1804 aa14.87□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 LPAR5Q9H1C0 372 aa14.87□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa14.87□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 Q56UQ5 140 aa14.87□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 SLAMF6Q96DU3 332 aa14.87□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 TNFSF18Q9UNG2 199 aa14.87□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 IFITM10A6NMD0 228 aa14.87□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 NEURL1O76050 574 aa14.87□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 PMP22Q01453 160 aa14.87□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 IFITM2Q01629 132 aa14.87□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 FAM234AQ9H0X4 552 aa14.87□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 SELEP16581 610 aa14.86□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP14.86□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 ANKRD34AQ69YU3 496 aa14.86□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 DOK5Q9P104 306 aa14.86□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 LDLRAD3Q86YD5 345 aa14.86□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 HPXP02790 462 aa14.86□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 CCL11P51671 97 aa14.86□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 LURAP1LQ8IV03 231 aa14.86□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 CBLN4Q9NTU7 201 aa14.86□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 KIAA1456Q9P272 454 aa14.86□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 A0A0U1RQS6 177 aa14.86□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 PRSS37A4D1T9 235 aa14.86□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 PLPP1O14494 284 aa14.86□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 GUCA2AQ02747 115 aa14.86□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 TRPM7Q96QT4 1865 aa14.86□□□□□ -0.03
PTEN-201ENST00000371953 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 143.8 ms