RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 GPR148Q8TDV2 347 aa6.32□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 GATAD2BQ8WXI9 593 aa6.32□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 AQP3Q92482 292 aa6.32□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 GGHQ92820 318 aa6.32□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 LHX4Q969G2 390 aa6.32□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 SPSB1Q96BD6 273 aa6.32□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 TMIGD2Q96BF3 282 aa6.32□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 MED30Q96HR3 178 aa6.32□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 CNBD2Q96M20 576 aa6.32□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 DCTN5Q9BTE1 182 aa6.32□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 CDCA4Q9BXL8 241 aa6.32□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 CHST5Q9GZS9 411 aa6.32□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 GPR173Q9NS66 373 aa6.32□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 FKBP14Q9NWM8 211 aa6.32□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 NLKQ9UBE8 527 aa6.32□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 CKLFQ9UBR5 152 aa6.32□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa6.32□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 KPTNQ9Y664 436 aa6.32□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 V9GYS6 101 aa6.32□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa6.31□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa6.31□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 A0A1W2PQ09 198 aa6.31□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 PQLC2LA1A4F0 135 aa6.31□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 A6NIN4 97 aa6.31□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 OR4C45A6NMZ5 311 aa6.31□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 PTGES3LE9PB15 166 aa6.31□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 J3QT63 122 aa6.31□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 SIGLEC5O15389 551 aa6.31□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 XPNPEP2O43895 674 aa6.31□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 CYB5AP00167 134 aa6.31□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 IGHV1-69P01742 117 aa6.31□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 CD1AP06126 327 aa6.31□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 PSG2P11465 335 aa6.31□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 NDUFB7P17568 137 aa6.31□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 RANBP1P43487 201 aa6.31□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 HAAOP46952 286 aa6.31□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 GABRA2P47869 451 aa6.31□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 ETV1P50549 477 aa6.31□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 FUT6P51993 359 aa6.31□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 CAV3P56539 151 aa6.31□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 WNT4P56705 351 aa6.31□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 GABARAPL2P60520 117 aa6.31□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 SLC35A2P78381 396 aa6.31□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 FOXL1Q12952 345 aa6.31□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 CDK5R1Q15078 307 aa6.31□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 DGUOKQ16854 277 aa6.31□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 SMIM21Q3B7S5 101 aa6.31□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 YIF1BQ5BJH7 314 aa6.31□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 UTS2BQ765I0 119 aa6.31□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 PRSS48Q7RTY5 328 aa6.31□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 PDZD9Q8IXQ8 264 aa6.31□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 CMTM4Q8IZR5 234 aa6.31□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 PRSS35Q8N3Z0 413 aa6.31□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 SVOPQ8N4V2 548 aa6.31□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 POC1AQ8NBT0 407 aa6.31□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 DNAAF1Q8NEP3 725 aa6.31□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM185AQ8NFB2 350 aa6.31□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 OR5D14Q8NGL3 314 aa6.31□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 OR13C3Q8NGS6 347 aa6.31□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 OR14K1Q8NGZ2 314 aa6.31□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 C8orf46Q8TAG6 207 aa6.31□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF671Q8TAW3 534 aa6.31□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 SMIM19Q96E16 107 aa6.31□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 PRDM13Q9H4Q3 707 aa6.31□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 DUSP21Q9H596 190 aa6.31□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 CNTD2Q9H8S5 307 aa6.31□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 NOX4Q9NPH5 578 aa6.31□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 FRRS1LQ9P0K9 344 aa6.31□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF222Q9UK12 451 aa6.31□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 DHDHQ9UQ10 334 aa6.31□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF281Q9Y2X9 895 aa6.31□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 A0A0U1RQK1 487 aa6.3□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 H3BSH0 61 aa6.3□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 MAGEB3O15480 346 aa6.3□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 SYNGR1O43759 233 aa6.3□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 ALX3O95076 343 aa6.3□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 NXPH2O95156 264 aa6.3□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 ZFPL1O95159 310 aa6.3□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 MT-ND2P03891 347 aa6.3□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 MELTFP08582 738 aa6.3□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 PGA5P0DJD9 388 aa6.3□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 CRHBPP24387 322 aa6.3□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 KIR3DL2P43630 455 aa6.3□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 ACSM1Q08AH1 577 aa6.3□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 GPR50Q13585 617 aa6.3□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 TRAM1Q15629 374 aa6.3□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 Q6YL49 198 aa6.3□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 ACP7Q6ZNF0 438 aa6.3□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa6.3□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 SERPINA12Q8IW75 414 aa6.3□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 Q8IYB0 196 aa6.3□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 MS4A15Q8N5U1 240 aa6.3□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 NANOGP1Q8N7R0 232 aa6.3□□□□□ -1.4
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