RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 OR4A8P0C604 315 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 ABOP16442 354 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 TNFRSF1AP19438 455 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 CD226Q15762 336 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP4.4□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 OR6X1Q8NH79 312 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 FBXO27Q8NI29 283 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 CXorf36Q9H7Y0 433 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM140Q9NV12 185 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 FREM3P0C091 2139 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 MYOFQ9NZM1 2061 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 NPPBP16860 134 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 CCNOP22674 350 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 C2orf76Q3KRA6 126 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 PECRQ9BY49 303 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 TWSG1Q9GZX9 223 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 A0A1W2PPC4 97 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP4.4□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 CTAG2O75638 210 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 IGHMP01871 453 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 LINC00614P0C842 121 aa4.4□□□□□ -1.71
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PTPRD-201ENST00000355233 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP4.4□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 OR2C3Q8N628 320 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 OR5A1Q8NGJ0 315 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 EXTL1Q92935 676 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 CLDN23Q96B33 292 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 SHISA4Q96DD7 197 aa4.4□□□□□ -1.71
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PTPRD-201ENST00000355233 ELOVL1Q9BW60 279 aa4.4□□□□□ -1.71
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PTPRD-201ENST00000355233 NACAE9PAV3 2078 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 CLEC18AA5D8T8 446 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 C2CD4DB7Z1M9 353 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 C9JVG2 144 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 M0R082 166 aa4.39□□□□□ -1.71
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PTPRD-201ENST00000355233 NME2P22392 152 aa4.39□□□□□ -1.71
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PTPRD-201ENST00000355233 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 OR8G2PQ6IF36 304 aa4.39□□□□□ -1.71
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PTPRD-201ENST00000355233 TTC9BQ8N6N2 239 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 CLEC18CQ8NCF0 446 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa4.39□□□□□ -1.71
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PTPRD-201ENST00000355233 OR51B6Q9H340 312 aa4.39□□□□□ -1.71
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PTPRD-201ENST00000355233 AAED1Q7RTV5 226 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 CBLN2Q8IUK8 224 aa4.39□□□□□ -1.71
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PTPRD-201ENST00000355233 OR2A5Q96R48 311 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 P4HTMQ9NXG6 502 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 NTMQ9P121 344 aa4.39□□□□□ -1.71
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PTPRD-201ENST00000355233 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
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PTPRD-201ENST00000355233 MOB3CQ70IA8 216 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 OLIG3Q7RTU3 272 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 OR4F17Q8NGA8 305 aa4.39□□□□□ -1.71
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PTPRD-201ENST00000355233 MKRN2OSH3BPM6 223 aa4.39□□□□□ -1.71
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PTPRD-201ENST00000355233 SLC19A1P41440 591 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 MVDP53602 400 aa4.39□□□□□ -1.71
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PTPRD-201ENST00000355233 CARD18P57730 90 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 ERVFC1-1P60608 527 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP4.39□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 FOXB2Q5VYV0 432 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 OR5M10Q6IEU7 315 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 LIAT1Q6ZQX7 453 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRD-201ENST00000355233 CYB561A3Q8NBI2 242 aa4.39□□□□□ -1.71
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