RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320857.7

SSR4-201, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SSR4, Length 1,671 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4-201ENST00000320857 MAFIPQ8WZ33 124 aa14.6□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 OR5P3Q8WZ94 311 aa14.6□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa14.6□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 GPR132Q9UNW8 380 aa14.6□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 LHX6Q9UPM6 363 aa14.6□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 URB1O60287 2271 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 MKRN2OSH3BPM6 223 aa14.59□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 TPOP07202 933 aa14.59□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 CBR1P16152 277 aa14.59□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 FUT3P21217 361 aa14.59□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 ECI1P42126 302 aa14.59□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 PER3P56645 1201 aa14.59□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 IL13RA1P78552 427 aa14.59□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 LIN54Q6MZP7 749 aa14.59□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 FBXW12Q6X9E4 464 aa14.59□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 OVCH2Q7RTZ1 564 aa14.59□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 OR13G1Q8NGZ3 307 aa14.59□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 MITD1Q8WV92 249 aa14.59□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa14.59□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 PHB2Q99623 299 aa14.59□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 SULT4A1Q9BR01 284 aa14.59□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa14.59□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 OR51B6Q9H340 312 aa14.59□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 FN3KRPQ9HA64 309 aa14.59□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 PROCRQ9UNN8 238 aa14.59□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 OSGIN2Q9Y236 505 aa14.59□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 ACACAQ13085 2346 aa14.59□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 TMEM8BA6NDV4 472 aa14.58□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 K7EM74 188 aa14.58□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 SMPD2O60906 423 aa14.58□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 TSC22D2O75157 780 aa14.58□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 CELA3BP08861 270 aa14.58□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 AKR1C4P17516 323 aa14.58□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 BCL3P20749 454 aa14.58□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 IL32P24001 234 aa14.58□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 NPY4RP50391 375 aa14.58□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 ZNF81P51508 661 aa14.58□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 PPP1CBP62140 327 aa14.58□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 GNG3P63215 75 aa14.58□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 OR2T2Q6IF00 324 aa14.58□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 ZNF573Q86YE8 665 aa14.58□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 BHLHE23Q8NDY6 225 aa14.58□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 TMEM185AQ8NFB2 350 aa14.58□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 SLAMF9Q96A28 289 aa14.58□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 ANXA10Q9UJ72 324 aa14.58□□□□□ -0.07
SSR4-201ENST00000320857 MYO7BQ6PIF6 2116 aa14.58□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 A0A1W2PR80 420 aa14.58□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 PLSCR5A0PG75 271 aa14.58□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 TRAPPC2LH3BP13 241 aa14.58□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 VAMP1P23763 118 aa14.58□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 PTGER4P35408 488 aa14.58□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 NPBWR2P48146 333 aa14.58□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 GMFBP60983 142 aa14.58□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 FGF12P61328 243 aa14.58□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 NHLRC3Q5JS37 347 aa14.58□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 DCAF12L2Q5VW00 463 aa14.58□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 C17orf78Q8N4C9 275 aa14.58□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 OR5M8Q8NGP6 311 aa14.58□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 LOC400499M0QZD8 3231 aa14.57□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 CRHP06850 196 aa14.57□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 FCGR3AP08637 254 aa14.57□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 HLA-GP17693 338 aa14.57□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 FOXF2Q12947 444 aa14.57□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 TMEM128Q5BJH2 165 aa14.57□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 OBP2BQ9NPH6 170 aa14.57□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 ZNF581Q9P0T4 197 aa14.57□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 HMSDA8MTL9 139 aa14.56□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 WDR1O75083 606 aa14.56□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 TNFSF13O75888 250 aa14.56□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 SELEP16581 610 aa14.56□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 P2RY6Q15077 328 aa14.56□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 MPV17LQ2QL34 196 aa14.56□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 LY6G6FQ5SQ64 297 aa14.56□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 SPATA46Q5T0L3 261 aa14.56□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 AADACL3Q5VUY0 350 aa14.56□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 TMEM211Q6ICI0 200 aa14.56□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa14.56□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa14.56□□□□□ -0.08
SSR4-201ENST00000320857 WDR31Q8NA23 367 aa14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.2 ms