RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320580.8

PACS1-201, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACS1, Length 4,392 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-201ENST00000320580 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa14.72□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 CNN1P51911 297 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 FMODQ06828 376 aa14.72□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 ELOBQ15370 118 aa14.72□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa14.72□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa14.72□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 OR13G1Q8NGZ3 307 aa14.72□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 APOOQ9BUR5 198 aa14.72□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 METTL7AQ9H8H3 244 aa14.72□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
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PACS1-201ENST00000320580 MGST1P10620 155 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 RAB7AP51149 207 aa14.71□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 C1orf61Q13536 156 aa14.71□□□□□ -0.05
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PACS1-201ENST00000320580 HIKESHIQ53FT3 197 aa14.71□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 C16orf52Q8NHV5 167 aa14.71□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 FGF11Q92914 225 aa14.71□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 TBX21Q9UL17 535 aa14.71□□□□□ -0.05
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PACS1-201ENST00000320580 HLA-DOBP13765 273 aa14.71□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 DPTQ07507 201 aa14.71□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 ISXQ2M1V0 245 aa14.71□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 DMBX1Q8NFW5 382 aa14.71□□□□□ -0.05
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PACS1-201ENST00000320580 CES1P1Q9UKY3 287 aa14.71□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 MYLKQ15746 1914 aa14.71□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 A0A1B0GWJ7 208 aa14.71□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 ZNF737O75373 536 aa14.71□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 MT-ATP6P00846 226 aa14.71□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa14.71□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 AQP3Q92482 292 aa14.71□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 DDIT4LQ96D03 193 aa14.71□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 TET1Q8NFU7 2136 aa14.71□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 TNFRSF10CO14798 259 aa14.71□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 HCRTR1O43613 425 aa14.71□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 HLA-GP17693 338 aa14.71□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 STPG1Q5TH74 334 aa14.71□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa14.71□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 IGHG1P01857 330 aa14.7□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 CHRNB4P30926 498 aa14.7□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 DOK3Q7L591 496 aa14.7□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 ZNF664Q8N3J9 261 aa14.7□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 PIGLQ9Y2B2 252 aa14.7□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 ZIC1Q15915 447 aa14.7□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 LINC01590Q5TEZ4 76 aa14.7□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 AADACL3Q5VUY0 350 aa14.7□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 PRSS41Q7RTY9 318 aa14.7□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 CATSPERDQ86XM0 798 aa14.7□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 SLC46A1Q96NT5 459 aa14.7□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 SLC2A9Q9NRM0 540 aa14.7□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 SCN2AQ99250 2005 aa14.7□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 TOX4O94842 621 aa14.7□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 NSDHLQ15738 373 aa14.7□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 TCTN1Q2MV58 587 aa14.7□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 FAM3CQ92520 227 aa14.7□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 STARD4Q96DR4 205 aa14.7□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 ZNF735P0CB33 412 aa14.69□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 COL10A1Q03692 680 aa14.69□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 C1QL3Q5VWW1 255 aa14.69□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 CBLN3Q6UW01 205 aa14.69□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 TMEM208Q9BTX3 173 aa14.69□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 A0A0J9YY10 115 aa14.69□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 ADAM20O43506 726 aa14.69□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 LMX1BO60663 402 aa14.69□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 OR2J2O76002 312 aa14.69□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 UBE2G2P60604 165 aa14.69□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 ZNF154Q13106 437 aa14.69□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 C10orf91Q5T1B1 145 aa14.69□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 SPTSSAQ969W0 71 aa14.69□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 TIMP4Q99727 224 aa14.69□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 TPSD1Q9BZJ3 242 aa14.69□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 A0A0G2JMZ2 1700 aa14.69□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 LRRC37A2A6NM11 1700 aa14.69□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 A0A1W2PP11 408 aa14.69□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa14.69□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 ANGPTL7O43827 346 aa14.69□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 VAX1Q5SQQ9 334 aa14.69□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 C20orf196Q8IYI0 205 aa14.69□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 LRRC18Q8N456 261 aa14.69□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 ZNF665Q9H7R5 613 aa14.69□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 CACNA1DQ01668 2161 aa14.69□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 HPRT1P00492 218 aa14.69□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 MELTFP08582 738 aa14.69□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 AMTP48728 403 aa14.69□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 FABP6P51161 128 aa14.69□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 FGF5P12034 268 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 CRISP2P16562 243 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 PMELP40967 661 aa14.68□□□□□ -0.06
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