RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308580.11

TMOD3-201, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD3, Length 8,255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-201ENST00000308580 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 MOB1BQ7L9L4 216 aa8.75□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 OR2M3Q8NG83 312 aa8.75□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 ZNF75AQ96N20 296 aa8.75□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 MBP02144 154 aa8.75□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 OR5AC1P0C628 307 aa8.75□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 ERHP84090 104 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 DEFA6Q01524 100 aa8.75□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 OR5M8Q8NGP6 311 aa8.75□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 NAA60Q9H7X0 242 aa8.75□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 EPOPA6NHQ4 379 aa8.75□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 HEXAP06865 529 aa8.75□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 SLC25A6P12236 298 aa8.75□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 MAGEA5P43359 124 aa8.75□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 AKR1E2Q96JD6 320 aa8.75□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 PRR13Q9NZ81 148 aa8.75□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 HNF1AP20823 631 aa8.75□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 CALCRP30988 508 aa8.75□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 LIMS1P48059 325 aa8.75□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 ABHD3Q8WU67 409 aa8.75□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa8.74□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 SLC25A4P12235 298 aa8.74□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 TNFRSF1AP19438 455 aa8.74□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 EFNB2P52799 333 aa8.74□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 ZXDAP98168 799 aa8.74□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 TXNDC12O95881 172 aa8.74□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 RRASP10301 218 aa8.74□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 DTYMKP23919 212 aa8.74□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 TAS2R45P59539 299 aa8.74□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 TIGITQ495A1 244 aa8.74□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 NIT2Q9NQR4 276 aa8.74□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 ANXA10Q9UJ72 324 aa8.74□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa8.74□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 FAM24AA6NFZ4 105 aa8.74□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa8.74□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 MICBQ29980 383 aa8.74□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 MIDNQ504T8 468 aa8.74□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 CABLES2Q9BTV7 478 aa8.74□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 PSG11Q9UQ72 335 aa8.74□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 VSIG8P0DPA2 414 aa8.74□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 FGF7P21781 194 aa8.74□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 RAB13P51153 203 aa8.74□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 SOX8P57073 446 aa8.74□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 UBAC2Q8NBM4 344 aa8.74□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 ZNF205O95201 554 aa8.74□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 FABP1P07148 127 aa8.74□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 ADH4P08319 380 aa8.74□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 PGA3P0DJD8 388 aa8.74□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 UBE2G2P60604 165 aa8.74□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 PPP1CBP62140 327 aa8.74□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 TSPO2Q5TGU0 170 aa8.74□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 ATAD5Q96QE3 1844 aa8.74□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 OR5B21A6NL26 309 aa8.74□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 MGAT2Q10469 447 aa8.74□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 PRSS54Q6PEW0 395 aa8.74□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 KCNE5Q9UJ90 142 aa8.74□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 KIF13BQ9NQT8 1826 aa8.74□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 CPN1P15169 458 aa8.73□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 LPAR6P43657 344 aa8.73□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 ZNF90Q03938 601 aa8.73□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 SIGLEC14Q08ET2 396 aa8.73□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 MITD1Q8WV92 249 aa8.73□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 SOX7Q9BT81 388 aa8.73□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa8.73□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 K7EQM0 130 aa8.73□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 GUK1Q16774 197 aa8.73□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 OR5C1Q8NGR4 320 aa8.73□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 LRRC29Q8WV35 223 aa8.73□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 GPR87Q9BY21 358 aa8.73□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 CTSBP07858 339 aa8.73□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa8.73□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 ASAH2BP0C7U1 165 aa8.73□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 IGHV3-43DP0DP04 118 aa8.73□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 LIFP15018 202 aa8.73□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 OR3A1P47881 315 aa8.73□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 C4orf17Q53FE4 359 aa8.73□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 CLEC18BQ6UXF7 455 aa8.73□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 SMIM15Q7Z3B0 74 aa8.73□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 CACNG5Q9UF02 275 aa8.73□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 FBXL17Q9UF56 701 aa8.73□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 MPC1Q9Y5U8 109 aa8.73□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa8.73□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 BPIFCQ8NFQ6 507 aa8.73□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 OR13D1Q8NGV5 346 aa8.73□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 KIAA1456Q9P272 454 aa8.73□□□□□ -1.01
TMOD3-201ENST00000308580 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms