RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297354.6

SBSPON-201, Transcript of somatomedin B and thrombospondin type 1 domain containing, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SBSPON, Length 3,801 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBSPON-201ENST00000297354 TTRP02766 147 aa14.72□□□□□ -0.05
SBSPON-201ENST00000297354 P2RY1P47900 373 aa14.72□□□□□ -0.05
SBSPON-201ENST00000297354 SLC38A9Q8NBW4 561 aa14.72□□□□□ -0.05
SBSPON-201ENST00000297354 SLC37A2Q8TED4 501 aa14.72□□□□□ -0.05
SBSPON-201ENST00000297354 TMEM18Q96B42 140 aa14.72□□□□□ -0.05
SBSPON-201ENST00000297354 MUCL1Q96DR8 90 aa14.72□□□□□ -0.05
SBSPON-201ENST00000297354 RSPRY1Q96DX4 576 aa14.72□□□□□ -0.05
SBSPON-201ENST00000297354 PILRAQ9UKJ1 303 aa14.72□□□□□ -0.05
SBSPON-201ENST00000297354 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SBSPON-201ENST00000297354 WDR90Q96KV7 1748 aa14.72□□□□□ -0.05
SBSPON-201ENST00000297354 CBY3A6NI87 242 aa14.72□□□□□ -0.05
SBSPON-201ENST00000297354 DHRS7CA6NNS2 312 aa14.72□□□□□ -0.05
SBSPON-201ENST00000297354 FCARP24071 287 aa14.72□□□□□ -0.05
SBSPON-201ENST00000297354 HGFACQ04756 655 aa14.72□□□□□ -0.05
SBSPON-201ENST00000297354 KISS1Q15726 138 aa14.72□□□□□ -0.05
SBSPON-201ENST00000297354 OR8G2PQ6IF36 304 aa14.72□□□□□ -0.05
SBSPON-201ENST00000297354 CNKSR3Q6P9H4 555 aa14.72□□□□□ -0.05
SBSPON-201ENST00000297354 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SBSPON-201ENST00000297354 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa14.72□□□□□ -0.05
SBSPON-201ENST00000297354 PIGLQ9Y2B2 252 aa14.72□□□□□ -0.05
SBSPON-201ENST00000297354 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SBSPON-201ENST00000297354 PPIHO43447 177 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SBSPON-201ENST00000297354 ASAH2BP0C7U1 165 aa14.72□□□□□ -0.05
SBSPON-201ENST00000297354 SEC11BP0C7V7 166 aa14.72□□□□□ -0.05
SBSPON-201ENST00000297354 RAB4BP61018 213 aa14.72□□□□□ -0.05
SBSPON-201ENST00000297354 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP14.72□□□□□ -0.05
SBSPON-201ENST00000297354 C1QL2Q7Z5L3 287 aa14.72□□□□□ -0.05
SBSPON-201ENST00000297354 IL22RA1Q8N6P7 574 aa14.72□□□□□ -0.05
SBSPON-201ENST00000297354 UBALD1Q8TB05 177 aa14.72□□□□□ -0.05
SBSPON-201ENST00000297354 TAAR9Q96RI9 348 aa14.72□□□□□ -0.05
SBSPON-201ENST00000297354 UCK1Q9HA47 277 aa14.72□□□□□ -0.05
SBSPON-201ENST00000297354 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SBSPON-201ENST00000297354 DYNLT3P51808 116 aa14.71□□□□□ -0.05
SBSPON-201ENST00000297354 PMP22Q01453 160 aa14.71□□□□□ -0.05
SBSPON-201ENST00000297354 PAX5Q02548 391 aa14.71□□□□□ -0.05
SBSPON-201ENST00000297354 FAM189A2Q15884 450 aa14.71□□□□□ -0.05
SBSPON-201ENST00000297354 S100A7P31151 101 aa14.71□□□□□ -0.05
SBSPON-201ENST00000297354 ZNF141Q15928 474 aa14.71□□□□□ -0.05
SBSPON-201ENST00000297354 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
SBSPON-201ENST00000297354 SPRED2Q7Z698 418 aa14.71□□□□□ -0.05
SBSPON-201ENST00000297354 DKKL1Q9UK85 242 aa14.71□□□□□ -0.05
SBSPON-201ENST00000297354 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
SBSPON-201ENST00000297354 IFITM10A6NMD0 228 aa14.71□□□□□ -0.06
SBSPON-201ENST00000297354 TMEM50BP56557 158 aa14.71□□□□□ -0.06
SBSPON-201ENST00000297354 GABREP78334 506 aa14.71□□□□□ -0.06
SBSPON-201ENST00000297354 HSF1Q00613 529 aa14.71□□□□□ -0.06
SBSPON-201ENST00000297354 ZNF664Q8N3J9 261 aa14.71□□□□□ -0.06
SBSPON-201ENST00000297354 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
SBSPON-201ENST00000297354 CALHM2Q9HA72 323 aa14.71□□□□□ -0.06
SBSPON-201ENST00000297354 PARD6AQ9NPB6 346 aa14.71□□□□□ -0.06
SBSPON-201ENST00000297354 NKX2-6A6NCS4 301 aa14.7□□□□□ -0.06
SBSPON-201ENST00000297354 ZNHIT1O43257 154 aa14.7□□□□□ -0.06
SBSPON-201ENST00000297354 SGCBQ16585 318 aa14.7□□□□□ -0.06
SBSPON-201ENST00000297354 Q6ZSR6 202 aa14.7□□□□□ -0.06
SBSPON-201ENST00000297354 GALNT14Q96FL9 552 aa14.7□□□□□ -0.06
SBSPON-201ENST00000297354 SLC25A31Q9H0C2 315 aa14.7□□□□□ -0.06
SBSPON-201ENST00000297354 ZBP1Q9H171 429 aa14.7□□□□□ -0.06
SBSPON-201ENST00000297354 DNAJC13O75165 2243 aa14.7□□□□□ -0.06
SBSPON-201ENST00000297354 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa14.7□□□□□ -0.06
SBSPON-201ENST00000297354 TLCD2A6NGC4 264 aa14.7□□□□□ -0.06
SBSPON-201ENST00000297354 LCATP04180 440 aa14.7□□□□□ -0.06
SBSPON-201ENST00000297354 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SBSPON-201ENST00000297354 TFPI2P48307 235 aa14.7□□□□□ -0.06
SBSPON-201ENST00000297354 RUNX3Q13761 415 aa14.7□□□□□ -0.06
SBSPON-201ENST00000297354 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SBSPON-201ENST00000297354 M1APQ8TC57 530 aa14.7□□□□□ -0.06
SBSPON-201ENST00000297354 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SBSPON-201ENST00000297354 KLHL13Q9P2N7 655 aa14.7□□□□□ -0.06
SBSPON-201ENST00000297354 VSTM2BA6NLU5 285 aa14.7□□□□□ -0.06
SBSPON-201ENST00000297354 IFNL4K9M1U5 179 aa14.7□□□□□ -0.06
SBSPON-201ENST00000297354 ZNF43P17038 809 aa14.7□□□□□ -0.06
SBSPON-201ENST00000297354 GNG10P50151 68 aa14.7□□□□□ -0.06
SBSPON-201ENST00000297354 DAP3P51398 398 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SBSPON-201ENST00000297354 TNFRSF9Q07011 255 aa14.7□□□□□ -0.06
SBSPON-201ENST00000297354 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa14.7□□□□□ -0.06
SBSPON-201ENST00000297354 OR10A7Q8NGE5 316 aa14.7□□□□□ -0.06
SBSPON-201ENST00000297354 OR13D1Q8NGV5 346 aa14.7□□□□□ -0.06
SBSPON-201ENST00000297354 HDAC8Q9BY41 377 aa14.7□□□□□ -0.06
SBSPON-201ENST00000297354 SLC39A9Q9NUM3 307 aa14.7□□□□□ -0.06
SBSPON-201ENST00000297354 PITPNC1Q9UKF7 332 aa14.7□□□□□ -0.06
SBSPON-201ENST00000297354 STARD10Q9Y365 291 aa14.7□□□□□ -0.06
SBSPON-201ENST00000297354 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa14.69□□□□□ -0.06
SBSPON-201ENST00000297354 HLA-GP17693 338 aa14.69□□□□□ -0.06
SBSPON-201ENST00000297354 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SBSPON-201ENST00000297354 NT5CQ8TCD5 201 aa14.69□□□□□ -0.06
SBSPON-201ENST00000297354 RSG1Q9BU20 258 aa14.69□□□□□ -0.06
SBSPON-201ENST00000297354 SUSD2Q9UGT4 822 aa14.69□□□□□ -0.06
SBSPON-201ENST00000297354 KCNS2Q9ULS6 477 aa14.69□□□□□ -0.06
SBSPON-201ENST00000297354 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SBSPON-201ENST00000297354 WNT5AP41221 380 aa14.69□□□□□ -0.06
SBSPON-201ENST00000297354 RTP5Q14D33 572 aa14.69□□□□□ -0.06
SBSPON-201ENST00000297354 LHX4Q969G2 390 aa14.69□□□□□ -0.06
SBSPON-201ENST00000297354 MS4A10Q96PG2 267 aa14.69□□□□□ -0.06
SBSPON-201ENST00000297354 PCGF1Q9BSM1 259 aa14.69□□□□□ -0.06
SBSPON-201ENST00000297354 ZNF407Q9C0G0 2248 aa14.69□□□□□ -0.06
SBSPON-201ENST00000297354 WIPF3A6NGB9 483 aa14.69□□□□□ -0.06
SBSPON-201ENST00000297354 ADAM20O43506 726 aa14.69□□□□□ -0.06
SBSPON-201ENST00000297354 ADH1BP00325 375 aa14.69□□□□□ -0.06
SBSPON-201ENST00000297354 SLC6A8P48029 635 aa14.69□□□□□ -0.06
SBSPON-201ENST00000297354 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.4 ms