RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293826.4

TNFSF12-TNFSF13-201, Transcript of TNFSF12-TNFSF13 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNFSF12-TNFSF13, Length 1,816 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CALHM1Q8IU99 346 aa20.3■□□□□ 0.84
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OR56B1Q8NGI3 324 aa20.3■□□□□ 0.84
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MEIS3P1A6NDR6 274 aa20.3■□□□□ 0.84
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GTF2F2P13984 249 aa20.3■□□□□ 0.84
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 METTL9Q9H1A3 318 aa20.29■□□□□ 0.84
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SOCS1O15524 211 aa20.28■□□□□ 0.84
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OR51T1Q8NGJ9 327 aa20.28■□□□□ 0.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OR10K1Q8NGX5 313 aa20.28■□□□□ 0.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OR56B4Q8NH76 319 aa20.28■□□□□ 0.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RAB3CQ96E17 227 aa20.28■□□□□ 0.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TM2D1Q9BX74 207 aa20.28■□□□□ 0.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF442Q9H7R0 627 aa20.28■□□□□ 0.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 F5H5P2 479 aa20.27■□□□□ 0.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GNB3P16520 340 aa20.27■□□□□ 0.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SERPINA2P20848 420 aa20.27■□□□□ 0.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TAS2R19P59542 299 aa20.27■□□□□ 0.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OR8G1Q15617 311 aa20.27■□□□□ 0.84
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OR4C16Q8NGL9 310 aa20.27■□□□□ 0.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OR8S1Q8NH09 359 aa20.27■□□□□ 0.84
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 STEAP1BQ6NZ63 245 aa20.27■□□□□ 0.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OR5A2Q8NGI9 324 aa20.27■□□□□ 0.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TMEM204Q9BSN7 226 aa20.27■□□□□ 0.84
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ING3Q9NXR8 418 aa20.27■□□□□ 0.84
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HAAOP46952 286 aa20.26■□□□□ 0.83
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FAAP20Q6NZ36 180 aa20.26■□□□□ 0.83
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa20.26■□□□□ 0.83
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa20.25■□□□□ 0.83
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OR2Z1Q8NG97 314 aa20.25■□□□□ 0.83
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 C20orf85Q9H1P6 137 aa20.25■□□□□ 0.83
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 A1L4Q6 167 aa20.25■□□□□ 0.83
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 C7orf66A4D0T2 115 aa20.25■□□□□ 0.83
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SPRY3O43610 288 aa20.25■□□□□ 0.83
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CPT2P23786 658 aa20.25■□□□□ 0.83
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MAB21L1Q13394 359 aa20.25■□□□□ 0.83
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NOXA1Q86UR1 476 aa20.25■□□□□ 0.83
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FAM222BQ8WU58 562 aa20.25■□□□□ 0.83
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP20.25■□□□□ 0.83
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PKDREJQ9NTG1 2253 aa20.24■□□□□ 0.83
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CLDN1O95832 211 aa20.24■□□□□ 0.83
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CSTBP04080 98 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FCER2P06734 321 aa20.24■□□□□ 0.83
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SERPINF1P36955 418 aa20.24■□□□□ 0.83
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