RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261799.8

PDGFRB-201, Transcript of platelet derived growth factor receptor beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDGFRB, Length 5,717 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRB-201ENST00000261799 S100A8P05109 93 aa11.97□□□□□ -0.49
PDGFRB-201ENST00000261799 WDR38Q5JTN6 314 aa11.97□□□□□ -0.49
PDGFRB-201ENST00000261799 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
PDGFRB-201ENST00000261799 ZNF519Q8TB69 540 aa11.97□□□□□ -0.49
PDGFRB-201ENST00000261799 JMJD8Q96S16 334 aa11.97□□□□□ -0.49
PDGFRB-201ENST00000261799 PLEKHA2Q9HB19 425 aa11.97□□□□□ -0.49
PDGFRB-201ENST00000261799 FOXS1O43638 330 aa11.97□□□□□ -0.49
PDGFRB-201ENST00000261799 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
PDGFRB-201ENST00000261799 TFAP2AP05549 437 aa11.97□□□□□ -0.49
PDGFRB-201ENST00000261799 OR1L1Q8NH94 360 aa11.97□□□□□ -0.49
PDGFRB-201ENST00000261799 UCN2Q96RP3 112 aa11.97□□□□□ -0.49
PDGFRB-201ENST00000261799 CDIPTO14735 213 aa11.96□□□□□ -0.49
PDGFRB-201ENST00000261799 PDCD6O75340 191 aa11.96□□□□□ -0.49
PDGFRB-201ENST00000261799 SLC31A2O15432 143 aa11.96□□□□□ -0.49
PDGFRB-201ENST00000261799 GYPAP02724 150 aa11.96□□□□□ -0.49
PDGFRB-201ENST00000261799 COL19A1Q14993 1142 aa11.96□□□□□ -0.49
PDGFRB-201ENST00000261799 CD226Q15762 336 aa11.96□□□□□ -0.49
PDGFRB-201ENST00000261799 FNDC7Q5VTL7 733 aa11.96□□□□□ -0.49
PDGFRB-201ENST00000261799 YIPF5Q969M3 257 aa11.96□□□□□ -0.49
PDGFRB-201ENST00000261799 WNK3Q9BYP7 1800 aa11.96□□□□□ -0.49
PDGFRB-201ENST00000261799 A0A1W2PPV9 198 aa11.96□□□□□ -0.49
PDGFRB-201ENST00000261799 SLC17A2O00624 439 aa11.96□□□□□ -0.49
PDGFRB-201ENST00000261799 OR2F2O95006 317 aa11.96□□□□□ -0.49
PDGFRB-201ENST00000261799 COX6A1P12074 109 aa11.96□□□□□ -0.49
PDGFRB-201ENST00000261799 OR10K2Q6IF99 312 aa11.96□□□□□ -0.49
PDGFRB-201ENST00000261799 TMEM229BQ8NBD8 167 aa11.96□□□□□ -0.49
PDGFRB-201ENST00000261799 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa11.96□□□□□ -0.49
PDGFRB-201ENST00000261799 PERPQ96FX8 193 aa11.96□□□□□ -0.49
PDGFRB-201ENST00000261799 ZNF714Q96N38 554 aa11.96□□□□□ -0.49
PDGFRB-201ENST00000261799 SEC22CQ9BRL7 303 aa11.96□□□□□ -0.49
PDGFRB-201ENST00000261799 J3QT63 122 aa11.96□□□□□ -0.5
PDGFRB-201ENST00000261799 FOXH1O75593 365 aa11.96□□□□□ -0.5
PDGFRB-201ENST00000261799 CELA2AP08217 269 aa11.96□□□□□ -0.5
PDGFRB-201ENST00000261799 OR2B8PP59922 312 aa11.96□□□□□ -0.5
PDGFRB-201ENST00000261799 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.5
PDGFRB-201ENST00000261799 RHOUQ7L0Q8 258 aa11.96□□□□□ -0.5
PDGFRB-201ENST00000261799 PIPOXQ9P0Z9 390 aa11.96□□□□□ -0.5
PDGFRB-201ENST00000261799 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
PDGFRB-201ENST00000261799 NDUFA2O43678 99 aa11.95□□□□□ -0.5
PDGFRB-201ENST00000261799 LIMK1P53667 647 aa11.95□□□□□ -0.5
PDGFRB-201ENST00000261799 LOXL3P58215 753 aa11.95□□□□□ -0.5
PDGFRB-201ENST00000261799 BAMBIQ13145 260 aa11.95□□□□□ -0.5
PDGFRB-201ENST00000261799 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
PDGFRB-201ENST00000261799 ITPKCQ96DU7 683 aa11.95□□□□□ -0.5
PDGFRB-201ENST00000261799 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa11.95□□□□□ -0.5
PDGFRB-201ENST00000261799 TCRBV5S2A0A599 114 aa11.95□□□□□ -0.5
PDGFRB-201ENST00000261799 ONECUT2O95948 504 aa11.95□□□□□ -0.5
PDGFRB-201ENST00000261799 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
PDGFRB-201ENST00000261799 ZNF485Q8NCK3 441 aa11.95□□□□□ -0.5
PDGFRB-201ENST00000261799 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
PDGFRB-201ENST00000261799 C20orf141Q9NUB4 165 aa11.95□□□□□ -0.5
PDGFRB-201ENST00000261799 MT-ND4LP03901 98 aa11.95□□□□□ -0.5
PDGFRB-201ENST00000261799 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
PDGFRB-201ENST00000261799 RIMKLAQ8IXN7 391 aa11.95□□□□□ -0.5
PDGFRB-201ENST00000261799 C20orf196Q8IYI0 205 aa11.95□□□□□ -0.5
PDGFRB-201ENST00000261799 FADS6Q8N9I5 356 aa11.95□□□□□ -0.5
PDGFRB-201ENST00000261799 OR8B12Q8NGG6 310 aa11.95□□□□□ -0.5
PDGFRB-201ENST00000261799 MARCH1Q8TCQ1 289 aa11.95□□□□□ -0.5
PDGFRB-201ENST00000261799 SLC17A5Q9NRA2 495 aa11.95□□□□□ -0.5
PDGFRB-201ENST00000261799 RABAC1Q9UI14 185 aa11.95□□□□□ -0.5
PDGFRB-201ENST00000261799 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
PDGFRB-201ENST00000261799 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
PDGFRB-201ENST00000261799 CCL8P80075 99 aa11.95□□□□□ -0.5
PDGFRB-201ENST00000261799 OR4Q3Q8NH05 313 aa11.95□□□□□ -0.5
PDGFRB-201ENST00000261799 ABHD17AQ96GS6 310 aa11.95□□□□□ -0.5
PDGFRB-201ENST00000261799 ATAD5Q96QE3 1844 aa11.95□□□□□ -0.5
PDGFRB-201ENST00000261799 JTBO76095 146 aa11.95□□□□□ -0.5
PDGFRB-201ENST00000261799 CRHP06850 196 aa11.95□□□□□ -0.5
PDGFRB-201ENST00000261799 PSG6Q00889 435 aa11.95□□□□□ -0.5
PDGFRB-201ENST00000261799 LSAMPQ13449 338 aa11.95□□□□□ -0.5
PDGFRB-201ENST00000261799 TMEM41BQ5BJD5 291 aa11.95□□□□□ -0.5
PDGFRB-201ENST00000261799 SOHLH1Q5JUK2 328 aa11.95□□□□□ -0.5
PDGFRB-201ENST00000261799 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa11.95□□□□□ -0.5
PDGFRB-201ENST00000261799 C2orf50Q96LR7 162 aa11.95□□□□□ -0.5
PDGFRB-201ENST00000261799 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
PDGFRB-201ENST00000261799 WIPI2Q9Y4P8 454 aa11.95□□□□□ -0.5
PDGFRB-201ENST00000261799 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
PDGFRB-201ENST00000261799 PXDC1Q5TGL8 231 aa11.94□□□□□ -0.5
PDGFRB-201ENST00000261799 Q8WTZ3 238 aa11.94□□□□□ -0.5
PDGFRB-201ENST00000261799 IL20Q9NYY1 176 aa11.94□□□□□ -0.5
PDGFRB-201ENST00000261799 UCP2P55851 309 aa11.94□□□□□ -0.5
PDGFRB-201ENST00000261799 MMDQ15546 238 aa11.94□□□□□ -0.5
PDGFRB-201ENST00000261799 PLPPR5Q32ZL2 321 aa11.94□□□□□ -0.5
PDGFRB-201ENST00000261799 P2RX4Q99571 388 aa11.94□□□□□ -0.5
PDGFRB-201ENST00000261799 MAGT1Q9H0U3 335 aa11.94□□□□□ -0.5
PDGFRB-201ENST00000261799 PLSCR3Q9NRY6 295 aa11.94□□□□□ -0.5
PDGFRB-201ENST00000261799 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
PDGFRB-201ENST00000261799 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
PDGFRB-201ENST00000261799 IGHV3-13P01766 116 aa11.94□□□□□ -0.5
PDGFRB-201ENST00000261799 IGHV3-7P01780 117 aa11.94□□□□□ -0.5
PDGFRB-201ENST00000261799 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
PDGFRB-201ENST00000261799 SBK3P0C264 359 aa11.94□□□□□ -0.5
PDGFRB-201ENST00000261799 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
PDGFRB-201ENST00000261799 FAAP24Q9BTP7 215 aa11.94□□□□□ -0.5
PDGFRB-201ENST00000261799 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa11.94□□□□□ -0.5
PDGFRB-201ENST00000261799 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa11.94□□□□□ -0.5
PDGFRB-201ENST00000261799 MYO9BQ13459 2157 aa11.94□□□□□ -0.5
PDGFRB-201ENST00000261799 C1QAP02745 245 aa11.94□□□□□ -0.5
PDGFRB-201ENST00000261799 CSF2RBP32927 897 aa11.94□□□□□ -0.5
PDGFRB-201ENST00000261799 RPS19P39019 145 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms