RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256413.7

CTIF-201, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 5,750 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-201ENST00000256413 IER3P46695 156 aa14.3□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 DPTQ07507 201 aa14.3□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 DMRTA1Q5VZB9 504 aa14.3□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 DEGS2Q6QHC5 323 aa14.3□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 A0A1W2PNR3 127 aa14.3□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 IFITM10A6NMD0 228 aa14.3□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 A8MXK9 166 aa14.3□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 CLEC3BP05452 202 aa14.3□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 FCARP24071 287 aa14.3□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 OR3A4PP47883 348 aa14.3□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 GNG10P50151 68 aa14.3□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 RHOBP62745 196 aa14.3□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 RUNX2Q13950 521 aa14.3□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 S1PR3Q99500 378 aa14.3□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP14.3□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP14.3□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 OR6C3Q9NZP0 311 aa14.3□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 ATP6V0CP27449 155 aa14.3□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 BRS3P32247 399 aa14.3□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 UBALD2Q8IYN6 164 aa14.3□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 DEDDO75618 318 aa14.29□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 ABLIM3O94929 683 aa14.29□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 IL3RAP26951 378 aa14.29□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 TCL1AP56279 114 aa14.29□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 TBC1D28Q2M2D7 210 aa14.29□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 SLC35E3Q7Z769 313 aa14.29□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP14.29□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa14.29□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 SRD5A3Q9H8P0 318 aa14.29□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 HCSTQ9UBK5 93 aa14.29□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa14.29□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 NEURL1O76050 574 aa14.29□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 HOXA6P31267 233 aa14.29□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 GZMMP51124 257 aa14.29□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 GABRA6Q16445 453 aa14.29□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 LINC01465Q8N7H1 131 aa14.29□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 OR2M7Q8NG81 312 aa14.29□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa14.29□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 YBX1P67809 324 aaKnown RBP14.29□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 MYEOVQ96EZ4 313 aa14.29□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 TOX2Q96NM4 488 aa14.29□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 CCL26Q9Y258 94 aa14.29□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 MMP16P51512 607 aa14.29□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP14.29□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 ZNF343Q6P1L6 599 aa14.29□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 COMMD5Q9GZQ3 224 aa14.29□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 FRRS1LQ9P0K9 344 aa14.29□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa14.29□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP14.28□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 EPPINO95925 133 aa14.28□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 ROBO4Q8WZ75 1007 aa14.28□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP14.28□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP14.28□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 MMP9P14780 707 aa14.28□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 RTL8BQ17RB0 113 aa14.28□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP14.28□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 CHST1O43916 411 aa14.28□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 OR4D11Q8NGI4 311 aa14.28□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 SMIM12Q96EX1 92 aa14.28□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 PLCH1Q4KWH8 1693 aa14.28□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 TLCD2A6NGC4 264 aa14.28□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa14.28□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 FAM219AQ8IW50 185 aa14.28□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 C20orf196Q8IYI0 205 aa14.28□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 FAM181AQ8N9Y4 354 aa14.28□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP14.28□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP14.28□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 PECRQ9BY49 303 aa14.28□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 PDE6DO43924 150 aa14.27□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 ZNF718Q3SXZ3 478 aa14.27□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP14.27□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 SRP14P37108 136 aaKnown RBP14.27□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa14.27□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 TSPO2Q5TGU0 170 aa14.27□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 EDARADDQ8WWZ3 215 aa14.27□□□□□ -0.12
CTIF-201ENST00000256413 TRGC1P0CF51 173 aa14.27□□□□□ -0.13
CTIF-201ENST00000256413 BCL2P10415 239 aa14.27□□□□□ -0.13
CTIF-201ENST00000256413 MICBQ29980 383 aa14.27□□□□□ -0.13
CTIF-201ENST00000256413 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP14.27□□□□□ -0.13
CTIF-201ENST00000256413 C17orf99Q6UX52 265 aa14.27□□□□□ -0.13
CTIF-201ENST00000256413 C12orf54Q6X4T0 127 aa14.27□□□□□ -0.13
CTIF-201ENST00000256413 LRFN3Q9BTN0 628 aa14.27□□□□□ -0.13
CTIF-201ENST00000256413 LANCL2Q9NS86 450 aa14.27□□□□□ -0.13
CTIF-201ENST00000256413 FOXJ2Q9P0K8 574 aa14.27□□□□□ -0.13
CTIF-201ENST00000256413 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP14.27□□□□□ -0.13
CTIF-201ENST00000256413 CCL27Q9Y4X3 112 aa14.27□□□□□ -0.13
CTIF-201ENST00000256413 FUT7Q11130 342 aa14.27□□□□□ -0.13
CTIF-201ENST00000256413 NOXO1Q8NFA2 376 aa14.27□□□□□ -0.13
CTIF-201ENST00000256413 GALMQ96C23 342 aa14.27□□□□□ -0.13
CTIF-201ENST00000256413 TSPAN32Q96QS1 320 aa14.27□□□□□ -0.13
CTIF-201ENST00000256413 OR2A5Q96R48 311 aa14.27□□□□□ -0.13
CTIF-201ENST00000256413 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP14.27□□□□□ -0.13
CTIF-201ENST00000256413 TIMM9Q9Y5J7 89 aa14.27□□□□□ -0.13
CTIF-201ENST00000256413 PAGE4O60829 102 aa14.26□□□□□ -0.13
CTIF-201ENST00000256413 SCRG1O75711 98 aa14.26□□□□□ -0.13
CTIF-201ENST00000256413 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
CTIF-201ENST00000256413 OR8B8Q15620 311 aa14.26□□□□□ -0.13
CTIF-201ENST00000256413 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
CTIF-201ENST00000256413 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.5 ms