RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 FN3KRPQ9HA64 309 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 CENPMQ9NSP4 180 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 POMT1Q9Y6A1 747 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 LMX1BO60663 402 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 WDR1O75083 606 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 IFNA4P05014 189 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 GLI4P10075 376 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 C1orf185Q5T7R7 199 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 SLAMF6Q96DU3 332 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 MRGPRX4Q96LA9 322 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A0J9YW62 118 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 PMP2P02689 132 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 B2MP61769 119 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 ANGPTL5Q86XS5 388 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 SMIM8Q96KF7 97 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 TREM1Q9NP99 234 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 AHRRA9YTQ3 701 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 TNFSF11O14788 317 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF20P17024 532 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 EIF1P41567 113 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 RAC1P63000 192 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 LINC00346Q8IVM7 164 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 DMBX1Q8NFW5 382 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 OR11A1Q9GZK7 315 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 CHST11Q9NPF2 352 aa22.85■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 PAX6P26367 422 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 ADH6P28332 368 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 NAXEQ8NCW5 288 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 RAB3CQ96E17 227 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 ADGRG7Q96K78 797 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 LPAR5Q9H1C0 372 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 TLNRD1Q9H1K6 362 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 IFT22Q9H7X7 185 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 KLHL13Q9P2N7 655 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A1W2PNR3 127 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 HLA-DOBP13765 273 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 CAV2P51636 162 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 AVPI1Q5T686 147 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM88Q6PEY1 159 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF101Q8IZC7 436 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 OR56B1Q8NGI3 324 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 TMED6Q8WW62 240 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 C2orf50Q96LR7 162 aa22.84■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 CACNA1CQ13936 2221 aa22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 OR7A5Q15622 319 aa22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC22A6Q4U2R8 563 aa22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 C9orf106Q8NAJ2 232 aa22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 OR4A4PQ8NGN8 299 aa22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 GLYATL2Q8WU03 294 aa22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 DDIT4LQ96D03 193 aa22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 FMODQ06828 376 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-201ENST00000246533 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-201ENST00000246533 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-201ENST00000246533 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-201ENST00000246533 C5orf66Q9H5L9 145 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-201ENST00000246533 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-201ENST00000246533 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A0G2JNJ9 132 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-201ENST00000246533 H0YIZ8 118 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-201ENST00000246533 LINC01387J3KSC0 135 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-201ENST00000246533 CSTBP04080 98 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-201ENST00000246533 KLK2P20151 261 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-201ENST00000246533 TAS2R46P59540 309 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-201ENST00000246533 MST1LQ2TV78 715 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-201ENST00000246533 THEM4Q5T1C6 240 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-201ENST00000246533 OR5H2Q8NGV7 314 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-201ENST00000246533 OR10D3Q8NH80 312 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-201ENST00000246533 SSC4DQ8WTU2 575 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-201ENST00000246533 C11orf40Q8WZ69 217 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-201ENST00000246533 ARL5BQ96KC2 179 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-201ENST00000246533 Q9UFV3 132 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A1W2PNV4 684 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-201ENST00000246533 PCP4L1A6NKN8 68 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-201ENST00000246533 CXCL13O43927 109 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-201ENST00000246533 FOLR2P14207 255 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-201ENST00000246533 ECI1P42126 302 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-201ENST00000246533 ARL6IP1Q15041 203 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-201ENST00000246533 TSC22D1Q15714 1073 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-201ENST00000246533 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-201ENST00000246533 MRGPRGQ86SM5 289 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-201ENST00000246533 LHFPL1Q86WI0 220 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-201ENST00000246533 CBLN2Q8IUK8 224 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-201ENST00000246533 OR13C9Q8NGT0 318 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-201ENST00000246533 FNDC9Q8TBE3 224 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM230Q96A57 120 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-201ENST00000246533 NRIP2Q9BQI9 281 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-201ENST00000246533 COA4Q9NYJ1 87 aa22.81■■□□□ 1.24
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