RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 CD300LDQ6UXZ3 194 aa12.99□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 OVCH2Q7RTZ1 564 aa12.99□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 C16orf82Q7Z2V1 217 aa12.99□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 TIGD4Q8IY51 512 aa12.99□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 IQCF1Q8N6M8 205 aa12.99□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF555Q8NEP9 628 aa12.99□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM185AQ8NFB2 350 aa12.99□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 OR10Z1Q8NGY1 313 aa12.99□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 CYGBQ8WWM9 190 aa12.99□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 SGK3Q96BR1 496 aa12.99□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 REEP6Q96HR9 211 aa12.99□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 DUX3Q96PT4 197 aa12.99□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa12.99□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 ABHD6Q9BV23 337 aa12.99□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 ADI1Q9BV57 179 aa12.99□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 USE1Q9NZ43 259 aa12.99□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF222Q9UK12 451 aa12.99□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa12.98□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 RIIAD1A6NNX1 92 aa12.98□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 IFNGP01579 166 aa12.98□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa12.98□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 CCL3L1P16619 93 aa12.98□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 CAPGP40121 348 aa12.98□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 OPRL1P41146 370 aa12.98□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 SLC15A1P46059 708 aa12.98□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 BLVRAP53004 296 aa12.98□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 TIGD6Q17RP2 521 aa12.98□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 ABCA11PQ4W5N1 156 aa12.98□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 FAM57BQ71RH2 274 aa12.98□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa12.98□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 OR10G2Q8NGC3 310 aa12.98□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 RAX2Q96IS3 184 aa12.98□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 INTS14Q96SY0 518 aa12.98□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 TM2D3Q9BRN9 247 aa12.98□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa12.98□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 NLKQ9UBE8 527 aa12.98□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 PSMB11A5LHX3 300 aa12.97□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 OR2AT4A6NND4 320 aa12.97□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 NUDT19A8MXV4 375 aa12.97□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 TNFAIP8O95379 198 aa12.97□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 AMY1AP04745 511 aa12.97□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 AMY2AP04746 511 aa12.97□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 LYNP07948 512 aa12.97□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 ACKR3P25106 362 aa12.97□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 HSD11B1P28845 292 aa12.97□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 GSK3AP49840 483 aa12.97□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 TTC23Q5W5X9 447 aa12.97□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM200BQ69YZ2 307 aa12.97□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa12.97□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 EGFL6Q8IUX8 553 aa12.97□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 ANKRD60Q9BZ19 345 aa12.97□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa12.97□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 LIN7BQ9HAP6 207 aa12.97□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa12.97□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 TNCP24821 2201 aa12.97□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa12.96□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 A0A1W2PPE2 198 aa12.96□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 A0A1W2PR64 198 aa12.96□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 A0A1W2PRV1 198 aa12.96□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 AKR7A2O43488 359 aa12.96□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 ALPLP05186 524 aa12.96□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 PGA5P0DJD9 388 aa12.96□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 GSTT1P30711 240 aa12.96□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 GABRA2P47869 451 aa12.96□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 RAB25P57735 213 aa12.96□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 RPL31P62899 125 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF273Q14593 569 aa12.96□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 OR11H6Q8NGC7 330 aa12.96□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 TEX47Q8TBZ9 253 aa12.96□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa12.96□□□□□ -0.33
SPCS1-201ENST00000233025 A0A1W2PPH5 198 aa12.95□□□□□ -0.34
SPCS1-201ENST00000233025 ARRDC5A6NEK1 342 aa12.95□□□□□ -0.34
SPCS1-201ENST00000233025 SELENOFO60613 162 aa12.95□□□□□ -0.34
SPCS1-201ENST00000233025 MYF6P23409 242 aa12.95□□□□□ -0.34
SPCS1-201ENST00000233025 CFL1P23528 166 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
SPCS1-201ENST00000233025 DLX6P56179 175 aa12.95□□□□□ -0.34
SPCS1-201ENST00000233025 GFOD2Q3B7J2 385 aa12.95□□□□□ -0.34
SPCS1-201ENST00000233025 SHFQ7M4L6 423 aa12.95□□□□□ -0.34
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa12.95□□□□□ -0.34
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF329Q86UD4 541 aa12.95□□□□□ -0.34
SPCS1-201ENST00000233025 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa12.95□□□□□ -0.34
SPCS1-201ENST00000233025 OTOSQ8NHW6 89 aa12.95□□□□□ -0.34
SPCS1-201ENST00000233025 GIPC3Q8TF64 312 aa12.95□□□□□ -0.34
SPCS1-201ENST00000233025 HPSE2Q8WWQ2 592 aa12.95□□□□□ -0.34
SPCS1-201ENST00000233025 SDSLQ96GA7 329 aa12.95□□□□□ -0.34
SPCS1-201ENST00000233025 AKR1E2Q96JD6 320 aa12.95□□□□□ -0.34
SPCS1-201ENST00000233025 FEVQ99581 238 aa12.95□□□□□ -0.34
SPCS1-201ENST00000233025 OR10A2Q9H208 303 aa12.95□□□□□ -0.34
SPCS1-201ENST00000233025 SP140LQ9H930 580 aa12.95□□□□□ -0.34
SPCS1-201ENST00000233025 BRD7Q9NPI1 651 aa12.95□□□□□ -0.34
SPCS1-201ENST00000233025 ZFP57Q9NU63 452 aa12.95□□□□□ -0.34
SPCS1-201ENST00000233025 HILPDAQ9Y5L2 63 aa12.95□□□□□ -0.34
SPCS1-201ENST00000233025 SEC14L6B5MCN3 397 aa12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.6 ms