RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639599.1

TARDBP-231, Transcript of TAR DNA binding protein, human

TSL 5

Gene TARDBP, Length 1,283 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARDBP-231	ENST00000639599	EMX1	Q04741	257 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	REC114	Q7Z4M0	266 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	CALHM1	Q8IU99	346 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	SLC35F2	Q8IXU6	374 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	TRMT10A	Q8TBZ6	339 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	PPP1R14A	Q96A00	147 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	KRT84	Q9NSB2	600 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	OR52A1	Q9UKL2	312 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	COPS3	Q9UNS2	423 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	SLC22A13	Q9Y226	551 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	TBL2	Q9Y4P3	447 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	SNX5	Q9Y5X3	404 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	CCDC182	A6NF36	153 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	F2RL2	O00254	374 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	PIN1P1	O15428	100 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	GATB	O75879	557 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	RPP14	O95059	124 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	CYB5A	P00167	134 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	TTR	P02766	147 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	CHRM2	P08172	466 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF273	Q14593	569 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	MEPCE	Q7L2J0	689 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	KRT74	Q7RTS7	529 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	GID4	Q8IVV7	300 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	YIPF7	Q8N8F6	280 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	OR4F17	Q8NGA8	305 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	OR4F4	Q96R69	305 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	APOL4	Q9BPW4	351 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	PQLC2L	A1A4F0	135 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	NOS1AP	O75052	506 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	DNAJC8	O75937	253 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	SERPINA3	P01011	423 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	OCM2	P0CE71	109 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	OCM	P0CE72	109 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	ATP6V1E1	P36543	226 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	COL10A1	Q03692	680 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	IL24	Q13007	206 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	EDDM3A	Q14507	147 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	SSX2	Q16385	188 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	ODF4	Q2M2E3	257 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	SLX4IP	Q5VYV7	408 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	ELMOD2	Q8IZ81	293 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	LYG1	Q8N1E2	194 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	NDNF	Q8TB73	568 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	SGCD	Q92629	289 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	R3HDM4	Q96D70	268 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	MALSU1	Q96EH3	234 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	NRBF2	Q96F24	287 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	CEP19	Q96LK0	163 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF714	Q96N38	554 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	CDCA4	Q9BXL8	241 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	PKIB	Q9C010	78 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	ENOPH1	Q9UHY7	261 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	GLS2	Q9UI32	602 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	TCF19	Q9Y242	345 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599		V9GYS6	101 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	hADV38S2	A0JD32	116 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599		A6NIN4	97 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	DHRS7C	A6NNS2	312 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	SYT7	O43581	403 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	CHST1	O43916	411 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	PRKY	O43930	277 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	INMT	O95050	263 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	IGLV3-1	P01715	115 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF728	P0DKX0	622 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	GABRR1	P24046	479 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	ARHGDIB	P52566	201 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	SLC34A1	Q06495	639 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	PTGES3	Q15185	160 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	BEAN1	Q3B7T3	259 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	NXNL2	Q5VZ03	156 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	PLEKHG7	Q6ZR37	379 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	FAM220A	Q7Z4H9	259 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	TRAPPC6B	Q86SZ2	158 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	ANGPTL5	Q86XS5	388 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	TMEM219	Q86XT9	240 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	TCEANC	Q8N8B7	351 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	CFHR4	Q92496	578 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	EMG1	Q92979	244 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	BORCS8	Q96FH0	119 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	TBX5	Q99593	518 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	CLN6	Q9NWW5	311 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TARDBP-231	ENST00000639599	VGLL3	A8MV65	326 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TARDBP-231	ENST00000639599		H3BSH0	61 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TARDBP-231	ENST00000639599		K7N7A8	449 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TARDBP-231	ENST00000639599	RBP4	P02753	201 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TARDBP-231	ENST00000639599	T-ENOL	P0DO92	83 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TARDBP-231	ENST00000639599	MPZ	P25189	248 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TARDBP-231	ENST00000639599	PEX2	P28328	305 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TARDBP-231	ENST00000639599	VDAC2	P45880	294 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
TARDBP-231	ENST00000639599	FBLN7	Q53RD9	439 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TARDBP-231	ENST00000639599	TMEM42	Q69YG0	159 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TARDBP-231	ENST00000639599	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TARDBP-231	ENST00000639599	ZBTB49	Q6ZSB9	765 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TARDBP-231	ENST00000639599	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		11.89	□□□□□ -0.51

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