RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602319.1

HCG18-242, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

BASIC

Gene HCG18, Length 3,342 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-242ENST00000602319 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 FAM213BQ8TBF2 198 aa8.65□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 RNF138Q8WVD3 245 aa8.65□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 MISP3Q96FF7 219 aa8.65□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 NDUFAF3Q9BU61 184 aa8.65□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 CHST11Q9NPF2 352 aa8.65□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 CENPMQ9NSP4 180 aa8.65□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 B3GAT1Q9P2W7 334 aa8.65□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 ANXA10Q9UJ72 324 aa8.65□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 A0A0C4DFX4 3053 aa8.65□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 SEMA4FO95754 770 aa8.64□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 DTYMKP23919 212 aa8.64□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 UBE2KP61086 200 aa8.64□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 NHLH2Q02577 135 aa8.64□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 C1QL2Q7Z5L3 287 aa8.64□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 C5orf24Q7Z6I8 188 aa8.64□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 ZNF283Q8N7M2 679 aa8.64□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 OR52M1Q8NGK5 317 aa8.64□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 Q96M66 194 aa8.64□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 GPR27Q9NS67 375 aa8.64□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 ADAMTS20P59510 1910 aa8.64□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa8.64□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 CLEC18AA5D8T8 446 aa8.64□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 C5orf67F2Z3F1 127 aa8.64□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 H3BMH7 237 aa8.64□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 IL18BPO95998 194 aa8.64□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 MYOGP15173 224 aa8.64□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 KLK2P20151 261 aa8.64□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 COL9A1P20849 921 aa8.64□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 PDLIM4P50479 330 aa8.64□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 ZNF266Q14584 549 aa8.64□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 SSX2Q16385 188 aa8.64□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 TMEM196Q5HYL7 178 aa8.64□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 TANGO2Q6ICL3 276 aa8.64□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 SFTPA2Q8IWL1 248 aa8.64□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 TMEM183AQ8IXX5 376 aa8.64□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 CLEC18CQ8NCF0 446 aa8.64□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 ST8SIA1Q92185 356 aa8.64□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 S100PBPQ96BU1 408 aa8.64□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 LYZL4Q96KX0 146 aa8.64□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 PITPNC1Q9UKF7 332 aa8.64□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 ANKUB1A6NFN9 424 aa8.64□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 PRH1P02810 166 aa8.64□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 OR5AC1P0C628 307 aa8.64□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 ATP6V0CP27449 155 aa8.64□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 IL12BP29460 328 aa8.64□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 EFNA3P52797 238 aa8.64□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 PIGPP57054 158 aa8.64□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 HIST3H3Q16695 136 aa8.64□□□□□ -1.03
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HCG18-242ENST00000602319 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa8.64□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 TTLL10Q6ZVT0 673 aa8.64□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 RD3Q7Z3Z2 195 aa8.64□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 PRR22Q8IZ63 422 aa8.64□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 PYGO2Q9BRQ0 406 aa8.64□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 CDRT15L2A8MXV6 281 aa8.63□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 CYB5BO43169 146 aa8.63□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 ST8SIA3O43173 380 aa8.63□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 PGA4P0DJD7 388 aa8.63□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 PGA3P0DJD8 388 aa8.63□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 SFTPDP35247 375 aa8.63□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 KISS1Q15726 138 aa8.63□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 FAM90A2PQ658T7 463 aa8.63□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 OR2T2Q6IF00 324 aa8.63□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 POMZP3Q6PJE2 187 aa8.63□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 LYZL2Q7Z4W2 148 aa8.63□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 ZNF248Q8NDW4 579 aa8.63□□□□□ -1.03
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HCG18-242ENST00000602319 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa8.63□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 WWTR1Q9GZV5 400 aa8.63□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 THADAQ6YHU6 1953 aa8.63□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 A0A1B0GU03 582 aa8.63□□□□□ -1.03
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HCG18-242ENST00000602319 HCKP08631 526 aa8.63□□□□□ -1.03
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HCG18-242ENST00000602319 CTNNB1P35222 781 aa8.63□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 FZD2Q14332 565 aa8.63□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 RAB35Q15286 201 aa8.63□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 C1orf87Q8N0U7 546 aa8.63□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa8.63□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa8.63□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 SLC38A9Q8NBW4 561 aa8.63□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 NOXO1Q8NFA2 376 aa8.63□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 C10orf35Q96D05 121 aa8.63□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa8.63□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 ALKBH4Q9NXW9 302 aa8.63□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa8.62□□□□□ -1.03
HCG18-242ENST00000602319 LIPT2A6NK58 231 aa8.62□□□□□ -1.03
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