RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602190.1

IRF3-231, Transcript of interferon regulatory factor 3, human

TSL 3

Gene IRF3, Length 413 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IRF3-231	ENST00000602190	ACTG2	P63267	376 aa		14.55	□□□□□ -0.08
IRF3-231	ENST00000602190	ACTC1	P68032	377 aa		14.55	□□□□□ -0.08
IRF3-231	ENST00000602190	ACTA1	P68133	377 aa		14.55	□□□□□ -0.08
IRF3-231	ENST00000602190	RIPPLY1	Q0D2K3	151 aa		14.55	□□□□□ -0.08
IRF3-231	ENST00000602190	ARSJ	Q5FYB0	599 aa	Predicted RBP	14.55	□□□□□ -0.08
IRF3-231	ENST00000602190	FAM81A	Q8TBF8	368 aa		14.55	□□□□□ -0.08
IRF3-231	ENST00000602190	THEM6	Q8WUY1	208 aa		14.55	□□□□□ -0.08
IRF3-231	ENST00000602190	NUFIP1	Q9UHK0	495 aa	Known RBP	14.55	□□□□□ -0.08
IRF3-231	ENST00000602190	HHLA2	Q9UM44	414 aa		14.55	□□□□□ -0.08
IRF3-231	ENST00000602190	LSM4	Q9Y4Z0	139 aa	Known RBP	14.55	□□□□□ -0.08
IRF3-231	ENST00000602190	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		14.55	□□□□□ -0.08
IRF3-231	ENST00000602190		U3KQK5	164 aa		14.55	□□□□□ -0.08
IRF3-231	ENST00000602190	SRSF10	O75494	262 aa	Known RBP	14.54	□□□□□ -0.08
IRF3-231	ENST00000602190	DHRS3	O75911	302 aa		14.54	□□□□□ -0.08
IRF3-231	ENST00000602190	NXPH2	O95156	264 aa		14.54	□□□□□ -0.08
IRF3-231	ENST00000602190	CLIC3	O95833	236 aa		14.54	□□□□□ -0.08
IRF3-231	ENST00000602190	NRAS	P01111	189 aa		14.54	□□□□□ -0.08
IRF3-231	ENST00000602190	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	14.54	□□□□□ -0.08
IRF3-231	ENST00000602190	SLC2A5	P22732	501 aa		14.54	□□□□□ -0.08
IRF3-231	ENST00000602190	ROM1	Q03395	351 aa		14.54	□□□□□ -0.08
IRF3-231	ENST00000602190	MICA	Q29983	383 aa		14.54	□□□□□ -0.08
IRF3-231	ENST00000602190	PLCXD3	Q63HM9	321 aa		14.54	□□□□□ -0.08
IRF3-231	ENST00000602190	MOB3C	Q70IA8	216 aa		14.54	□□□□□ -0.08
IRF3-231	ENST00000602190	OR8H2	Q8N162	312 aa		14.54	□□□□□ -0.08
IRF3-231	ENST00000602190	ZNF714	Q96N38	554 aa		14.54	□□□□□ -0.08
IRF3-231	ENST00000602190	TEAD3	Q99594	435 aa		14.54	□□□□□ -0.08
IRF3-231	ENST00000602190	GPR84	Q9NQS5	396 aa		14.54	□□□□□ -0.08
IRF3-231	ENST00000602190	ENPP5	Q9UJA9	477 aa		14.54	□□□□□ -0.08
IRF3-231	ENST00000602190	LINC00312	Q9Y6C7	94 aa		14.54	□□□□□ -0.08
IRF3-231	ENST00000602190	SESN1	Q9Y6P5	492 aa		14.54	□□□□□ -0.08
IRF3-231	ENST00000602190	BIRC6	Q9NR09	4857 aa		14.53	□□□□□ -0.08
IRF3-231	ENST00000602190	DNAH7	Q8WXX0	4024 aa		14.53	□□□□□ -0.08
IRF3-231	ENST00000602190	PRR32	B1ATL7	298 aa		14.53	□□□□□ -0.08
IRF3-231	ENST00000602190		H0YHG0	523 aa		14.53	□□□□□ -0.08
IRF3-231	ENST00000602190	DLGAP1	O14490	977 aa		14.53	□□□□□ -0.08
IRF3-231	ENST00000602190	OR2F2	O95006	317 aa		14.53	□□□□□ -0.08
IRF3-231	ENST00000602190	SLC34A1	Q06495	639 aa		14.53	□□□□□ -0.08
IRF3-231	ENST00000602190	PPP1R8	Q12972	351 aa	Known RBP	14.53	□□□□□ -0.08
IRF3-231	ENST00000602190	IL24	Q13007	206 aa		14.53	□□□□□ -0.08
IRF3-231	ENST00000602190	RNF144B	Q7Z419	303 aa		14.53	□□□□□ -0.08
IRF3-231	ENST00000602190	PGAM4	Q8N0Y7	254 aa		14.53	□□□□□ -0.08
IRF3-231	ENST00000602190	OSR2	Q8N2R0	312 aa		14.53	□□□□□ -0.08
IRF3-231	ENST00000602190	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		14.53	□□□□□ -0.08
IRF3-231	ENST00000602190	OR51E1	Q8TCB6	317 aa		14.53	□□□□□ -0.08
IRF3-231	ENST00000602190	DPF1	Q92782	380 aa		14.53	□□□□□ -0.08
IRF3-231	ENST00000602190	AKR1E2	Q96JD6	320 aa		14.53	□□□□□ -0.08
IRF3-231	ENST00000602190	RBM14	Q96PK6	669 aa	Known RBP	14.53	□□□□□ -0.08
IRF3-231	ENST00000602190	P2RX4	Q99571	388 aa		14.53	□□□□□ -0.08
IRF3-231	ENST00000602190	NIPSNAP1	Q9BPW8	284 aa		14.53	□□□□□ -0.08
IRF3-231	ENST00000602190	MCRIP2	Q9BUT9	160 aa	Known RBP	14.53	□□□□□ -0.08
IRF3-231	ENST00000602190	PKIB	Q9C010	78 aa		14.53	□□□□□ -0.08
IRF3-231	ENST00000602190	PBOV1	Q9GZY1	135 aa		14.53	□□□□□ -0.08
IRF3-231	ENST00000602190	SLC22A13	Q9Y226	551 aa		14.53	□□□□□ -0.08
IRF3-231	ENST00000602190	PIGL	Q9Y2B2	252 aa		14.53	□□□□□ -0.08
IRF3-231	ENST00000602190	E2F6	O75461	281 aa		14.52	□□□□□ -0.09
IRF3-231	ENST00000602190	IGLV1-47	P01700	117 aa		14.52	□□□□□ -0.09
IRF3-231	ENST00000602190	TTR	P02766	147 aa		14.52	□□□□□ -0.09
IRF3-231	ENST00000602190	LPL	P06858	475 aa		14.52	□□□□□ -0.09
IRF3-231	ENST00000602190	CHRM2	P08172	466 aa		14.52	□□□□□ -0.09
IRF3-231	ENST00000602190	SLC6A1	P30531	599 aa		14.52	□□□□□ -0.09
IRF3-231	ENST00000602190	IL18R1	Q13478	541 aa		14.52	□□□□□ -0.09
IRF3-231	ENST00000602190	SPATS1	Q496A3	300 aa		14.52	□□□□□ -0.09
IRF3-231	ENST00000602190	SLC35D3	Q5M8T2	416 aa		14.52	□□□□□ -0.09
IRF3-231	ENST00000602190	CLVS2	Q5SYC1	327 aa		14.52	□□□□□ -0.09
IRF3-231	ENST00000602190	ZNF684	Q5T5D7	378 aa		14.52	□□□□□ -0.09
IRF3-231	ENST00000602190	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		14.52	□□□□□ -0.09
IRF3-231	ENST00000602190	OR51V1	Q9H2C8	321 aa		14.52	□□□□□ -0.09
IRF3-231	ENST00000602190	TMEM133	Q9H2Q1	129 aa		14.52	□□□□□ -0.09
IRF3-231	ENST00000602190	OR14J1	Q9UGF5	321 aa		14.52	□□□□□ -0.09
IRF3-231	ENST00000602190		V9GYS6	101 aa		14.52	□□□□□ -0.09
IRF3-231	ENST00000602190	EPPK1	P58107	5090 aa	Known RBP	14.52	□□□□□ -0.09
IRF3-231	ENST00000602190	SACS	Q9NZJ4	4579 aa		14.51	□□□□□ -0.09
IRF3-231	ENST00000602190	TMEM269	A0A1B0GVZ9	245 aa		14.51	□□□□□ -0.09
IRF3-231	ENST00000602190	TCRBV5S2	A0A599	114 aa		14.51	□□□□□ -0.09
IRF3-231	ENST00000602190	TMEM82	A0PJX8	343 aa		14.51	□□□□□ -0.09
IRF3-231	ENST00000602190	ARRDC5	A6NEK1	342 aa		14.51	□□□□□ -0.09
IRF3-231	ENST00000602190	DHRS7C	A6NNS2	312 aa		14.51	□□□□□ -0.09
IRF3-231	ENST00000602190		F8VVB4	439 aa		14.51	□□□□□ -0.09
IRF3-231	ENST00000602190		F8VWA3	439 aa		14.51	□□□□□ -0.09
IRF3-231	ENST00000602190	ZFPL1	O95159	310 aa		14.51	□□□□□ -0.09
IRF3-231	ENST00000602190	HTR1D	P28221	377 aa		14.51	□□□□□ -0.09
IRF3-231	ENST00000602190	BDH1	Q02338	343 aa		14.51	□□□□□ -0.09
IRF3-231	ENST00000602190	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	14.51	□□□□□ -0.09
IRF3-231	ENST00000602190	ABCA11P	Q4W5N1	156 aa		14.51	□□□□□ -0.09
IRF3-231	ENST00000602190	PLBD1	Q6P4A8	553 aa		14.51	□□□□□ -0.09
IRF3-231	ENST00000602190	ZBTB49	Q6ZSB9	765 aa		14.51	□□□□□ -0.09
IRF3-231	ENST00000602190	KRT77	Q7Z794	578 aa		14.51	□□□□□ -0.09
IRF3-231	ENST00000602190	SNX22	Q96L94	193 aa		14.51	□□□□□ -0.09
IRF3-231	ENST00000602190	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		14.51	□□□□□ -0.09
IRF3-231	ENST00000602190	YIPF3	Q9GZM5	350 aa		14.51	□□□□□ -0.09
IRF3-231	ENST00000602190	MAGIX	Q9H6Y5	334 aa		14.51	□□□□□ -0.09
IRF3-231	ENST00000602190	TAS2R1	Q9NYW7	299 aa		14.51	□□□□□ -0.09
IRF3-231	ENST00000602190		A0A1B0GTI1	187 aa		14.5	□□□□□ -0.09
IRF3-231	ENST00000602190	MEX3A	A1L020	520 aa	Known RBP	14.5	□□□□□ -0.09
IRF3-231	ENST00000602190	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	14.5	□□□□□ -0.09
IRF3-231	ENST00000602190		H3BUI4	141 aa		14.5	□□□□□ -0.09
IRF3-231	ENST00000602190	ZNF254	O75437	659 aa		14.5	□□□□□ -0.09
IRF3-231	ENST00000602190	MMP23A	O75900	390 aa		14.5	□□□□□ -0.09
IRF3-231	ENST00000602190	DNAJC8	O75937	253 aa	Predicted RBP	14.5	□□□□□ -0.09
IRF3-231	ENST00000602190	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	14.5	□□□□□ -0.09

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