RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592790.1

VMP1-216, Transcript of vacuole membrane protein 1, human

Gene VMP1, Length 4,325 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VMP1-216	ENST00000592790	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		3.13	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	TMEM211	Q6ICI0	200 aa		3.13	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	OR2T2	Q6IF00	324 aa		3.13	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	PRSS41	Q7RTY9	318 aa		3.13	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	OR10AC1	Q8NH08	325 aa		3.13	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		3.13	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	NAT6	Q93015	286 aa		3.13	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	AICDA	Q9GZX7	198 aa		3.13	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	RAB33B	Q9H082	229 aa		3.13	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	ZNF230	Q9UIE0	474 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	PITPNC1	Q9UKF7	332 aa		3.13	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	KCNS2	Q9ULS6	477 aa		3.13	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	HSF4	Q9ULV5	492 aa		3.13	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	TIMM10B	Q9Y5J6	103 aa		3.13	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	PLXNB3	Q9ULL4	1909 aa		3.13	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	CKAP5	Q14008	2032 aa		3.13	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790		A0A087WWC5	75 aa		3.13	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	ZNF816-ZNF321P	A0A0X1KG74	233 aa		3.13	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790		A0A1W2PPC4	97 aa		3.13	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	CDC14C	A4D256	554 aa		3.13	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		3.13	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	FAM90A18P	A6NE21	464 aa		3.13	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	FAM90A16P	A6NEW6	464 aa		3.13	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	FAM90A20P	A6NIJ5	464 aa		3.13	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	FAM90A8P	A6NJQ4	464 aa		3.13	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	FAM90A7P	A6NKC0	464 aa		3.13	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	ZNF727	A8MUV8	499 aa		3.13	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	FAM90A22P	A8MWA6	464 aa		3.13	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	FAM90A12P	A8MX19	464 aa		3.13	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	FAM90A5P	A8MXJ8	464 aa		3.13	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	FAM90A23P	A8MXZ1	464 aa		3.13	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	LINC01387	J3KSC0	135 aa		3.13	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790		M0QZK8	103 aa		3.13	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	UBE2C	O00762	179 aa		3.13	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	TOX3	O15405	576 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	DOK2	O60496	412 aa		3.13	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	GGCT	O75223	188 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	PDCD6	O75340	191 aa		3.13	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	NRAS	P01111	189 aa		3.13	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	FAM90A15P	P0C7V4	464 aa		3.13	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	FAM90A13P	P0C7W8	464 aa		3.13	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	FAM90A14P	P0C7W9	464 aa		3.13	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	FAM90A24P	P0C7X0	464 aa		3.13	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	DANCR	P0C864	163 aa		3.13	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	PRF1	P14222	555 aa		3.13	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	GLRA1	P23415	457 aa		3.13	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	NPBWR1	P48145	328 aa		3.13	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	UCP3	P55916	312 aa		3.13	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	RAB11A	P62491	216 aa		3.13	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	DLK1	P80370	383 aa		3.13	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	PLGLB1	Q02325	96 aa		3.13	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	ATP6V1F	Q16864	119 aa		3.13	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	MAJIN	Q3KP22	176 aa		3.13	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	PHLDA2	Q53GA4	152 aa		3.13	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	ZNF542P	Q5EBM4	170 aa		3.13	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	ZNF787	Q6DD87	383 aa		3.13	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	BRICD5	Q6PL45	260 aa		3.13	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	CBLN3	Q6UW01	205 aa		3.13	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	SLC16A14	Q7RTX9	510 aa		3.13	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	FAM24B	Q8N5W8	94 aa		3.13	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	GVQW1	Q8N7I0	195 aa		3.13	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	POC1A	Q8NBT0	407 aa		3.13	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	CCL4L1	Q8NHW4	92 aa		3.13	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	M1AP	Q8TC57	530 aa		3.13	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	ZPLD1	Q8TCW7	415 aa		3.13	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	C8orf44	Q96CB5	159 aa		3.13	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	UHRF2	Q96PU4	802 aa		3.13	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	P2RX4	Q99571	388 aa		3.13	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	LPAR5	Q9H1C0	372 aa		3.13	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	SERGEF	Q9UGK8	458 aa		3.13	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790		A0A1B0GV50	99 aa		3.12	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790		A0A1B0GW64	132 aa		3.12	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790		A0A1W2PPH5	198 aa		3.12	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	LIPT2	A6NK58	231 aa		3.12	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	CDRT15L2	A8MXV6	281 aa		3.12	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	SLC33A1	O00400	549 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	DHH	O43323	396 aa		3.12	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	ADAP1	O75689	374 aa		3.12	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	TTR	P02766	147 aa		3.12	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	FBP1	P09467	338 aa		3.12	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	HKR1	P10072	659 aa		3.12	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	BCKDHB	P21953	392 aa		3.12	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	CDX1	P47902	265 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	INSM1	Q01101	510 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	TCTN1	Q2MV58	587 aa		3.12	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	NCR3LG1	Q68D85	454 aa		3.12	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	LINC00596	Q86U02	117 aa		3.12	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	C1QL4	Q86Z23	238 aa		3.12	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	H1FOO	Q8IZA3	346 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	ZSCAN4	Q8NAM6	433 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	TMEM52	Q8NDY8	209 aa		3.12	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	PPP1R35	Q8TAP8	253 aa		3.12	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	PIGT	Q969N2	578 aa		3.12	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	HIST1H2BA	Q96A08	127 aa		3.12	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	DNAJA3	Q96EY1	480 aa		3.12	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	FAM210B	Q96KR6	192 aa		3.12	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	TAAR9	Q96RI9	348 aa		3.12	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	GFI1	Q99684	422 aa		3.12	□□□□□ -1.91

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.2 ms