RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585685.5

APOC4-APOC2-201, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 5

Gene APOC4-APOC2, Length 1,829 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ARPC4P59998 168 aa14.29□□□□□ -0.12
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OSR2Q8N2R0 312 aa14.29□□□□□ -0.12
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 C2orf50Q96LR7 162 aa14.26□□□□□ -0.13
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NECAP2Q9NVZ3 263 aa14.26□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ST3GAL6Q9Y274 331 aa14.26□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PCNX2A6NKB5 2137 aa14.26□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MPTX1A8MV57 137 aa14.25□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 F8VVB4 439 aa14.25□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 F8VWA3 439 aa14.25□□□□□ -0.13
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IFNA2P01563 188 aa14.25□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF806P0C7X5 589 aa14.25□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OR5H8P0DN80 308 aa14.25□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PMELP40967 661 aa14.25□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 Q8NFD4 153 aa14.25□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OR51F2Q8NH61 342 aa14.25□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 APH1AQ96BI3 265 aa14.25□□□□□ -0.13
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CCDC120Q96HB5 630 aa14.25□□□□□ -0.13
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