RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 FAM216BQ8N7L0 139 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 C3orf56Q8N813 242 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 ZDHHC22Q8N966 263 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 OR10Z1Q8NGY1 313 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 RHOXF1Q8NHV9 184 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 HPSE2Q8WWQ2 592 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 UBE2FQ969M7 185 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 YIPF6Q96EC8 236 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 WDFY2Q96P53 400 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 WDR13Q9H1Z4 485 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 PLEKHA1Q9HB21 404 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 GPR173Q9NS66 373 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 TNFRSF19Q9NS68 423 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 ONECUT1Q9UBC0 465 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 NLKQ9UBE8 527 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 KAAG1Q9UBP8 84 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 GNG8Q9UK08 70 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 A0A1B0GW55 424 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 DAPL1A0PJW8 107 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 OR2AT4A6NND4 320 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 GPR37O15354 613 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 SYT7O43581 403 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 ENTPD6O75354 484 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 CLIC3O95833 236 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 SERPINA3P01011 423 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 DUX4L2P0CJ85 424 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 DUX4L3P0CJ86 424 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 DUX4L4P0CJ87 422 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 DUX4L5P0CJ88 424 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 DUX4L6P0CJ89 424 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 DUX4L7P0CJ90 424 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 NDUFB7P17568 137 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 PRTN3P24158 256 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 HAAOP46952 286 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 CAPZA1P52907 286 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 GP2P55259 537 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 ISL1P61371 349 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 UBA52P62987 128 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 IL13RA1P78552 427 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 IFITM3Q01628 133 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 PDCD1Q15116 288 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 TP53I3Q53FA7 332 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 CLVS2Q5SYC1 327 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 MEDAGQ5VYS4 303 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 LAIR2Q6ISS4 152 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 BRICD5Q6PL45 260 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF573Q86YE8 665 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 PDZD9Q8IXQ8 264 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 CMTM4Q8IZR5 234 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 FGFRL1Q8N441 504 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF555Q8NEP9 628 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 OR14K1Q8NGZ2 314 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa6.89□□□□□ -1.31
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PTPRM-214ENST00000583153 LHX4Q969G2 390 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 SLC25A28Q96A46 364 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 RNFT2Q96EX2 444 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 MED30Q96HR3 178 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 HRASLS5Q96KN8 279 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 OR51I2Q9H344 312 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 ESM1Q9NQ30 184 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 DUX4Q9UBX2 424 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 SLC7A11Q9UPY5 501 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 GMPPBQ9Y5P6 360 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 V9GYS6 101 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 A0A1B0GTI1 187 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 A0A1W2PQ09 198 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM89A2RUT3 159 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 PLATP00750 562 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 IGLV3-1P01715 115 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 TFF1P04155 84 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 HTR1AP08908 422 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 SELLP14151 372 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 TGM4P49221 684 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 BPIFB3P59826 476 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 ACTC1P68032 377 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 ACTA1P68133 377 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 DEFB112Q30KQ8 113 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 CDONQ4KMG0 1287 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF691Q5VV52 312 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 STUMQ69YW2 141 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-214ENST00000583153 CATSPERDQ86XM0 798 aa6.88□□□□□ -1.31
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