RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574322.5

CTDNEP1-210, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-210ENST00000574322 SFTPBP07988 381 aa24.38■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 GLI4P10075 376 aa24.38■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 CD83Q01151 205 aa24.38■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa24.38■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 SNAPC3Q92966 411 aa24.38■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 PRRT1Q99946 306 aa24.38■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF835Q9Y2P0 537 aa24.38■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 ARFRP1Q13795 201 aa24.37■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 FCN2Q15485 313 aa24.37■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 ACTBL2Q562R1 376 aa24.37■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa24.37■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 FBXW5Q969U6 566 aa24.37■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 SLC6A7Q99884 636 aa24.37■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR51B6Q9H340 312 aa24.37■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 SLC25A15Q9Y619 301 aa24.37■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 SNRPGP15A8MWD9 76 aa24.36■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 PRRG2O14669 202 aa24.36■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 HPXP02790 462 aa24.36■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 IL32P24001 234 aa24.36■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 RAD52P43351 418 aa24.36■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 GPM6AP51674 278 aa24.36■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 CBX3Q13185 183 aa24.36■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR2T2Q6IF00 324 aa24.36■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR52W1Q6IF63 320 aa24.36■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa24.36■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 IDO2Q6ZQW0 420 aa24.36■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 SLC25A26Q70HW3 274 aa24.36■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 HOGA1Q86XE5 327 aa24.36■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 DOLPP1Q86YN1 238 aa24.36■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF732B4DXR9 585 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 PRSS44E7EML9 344 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 LILRA1O75019 489 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 AGFG2O95081 481 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 PRB1P04280 392 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 GABRR1P24046 479 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 TAF9Q16594 264 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 C1orf174Q8IYL3 243 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR2J1Q9GZK6 312 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 FAM90A10PA6NDY2 464 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 FAM90A18PA6NE21 464 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 FAM90A16PA6NEW6 464 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 FAM90A7PA6NKC0 464 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 FAM90A22PA8MWA6 464 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 FAM90A12PA8MX19 464 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 FAM90A15PP0C7V4 464 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 FAM90A13PP0C7W8 464 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 FAM90A14PP0C7W9 464 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 FAM90A24PP0C7X0 464 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 SELEP16581 610 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 CHATP28329 748 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZFP69Q49AA0 526 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 NHLRC3Q5JS37 347 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 VAX1Q5SQQ9 334 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 MKXQ8IYA7 352 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 FBXL14Q8N1E6 418 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 BEST4Q8NFU0 473 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 BEX2Q9BXY8 128 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 MSTNO14793 375 aa24.34■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 CECR9P0C854 216 aa24.34■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 SULT1A3P0DMM9 295 aa24.34■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 SULT1A4P0DMN0 295 aa24.34■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 HRH1P35367 487 aa24.34■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 PMELP40967 661 aa24.34■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 HAAOP46952 286 aa24.34■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 RBM11P57052 281 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 GNG3P63215 75 aa24.34■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 MAB21L1Q13394 359 aa24.34■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 C3orf36Q3SXR2 165 aa24.34■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 TIMM23BQ5SRD1 257 aa24.34■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 SPATA46Q5T0L3 261 aa24.34■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa24.34■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 C6orf201Q7Z4U5 140 aa24.34■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 BHLHE23Q8NDY6 225 aa24.34■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR11H7Q8NGC8 314 aa24.34■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR4K15Q8NH41 348 aa24.34■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 SLC25A40Q8TBP6 338 aa24.34■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 BEX1Q9HBH7 125 aa24.34■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 ST3GAL6Q9Y274 331 aa24.34■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 IQCF6A8MYZ5 107 aa24.33■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF573Q86YE8 665 aa24.33■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 LIX1LQ8IVB5 337 aa24.33■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR1J1Q8NGS3 322 aa24.33■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR13C8Q8NGS7 320 aa24.33■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 KALRNO60229 2985 aa24.33■■□□□ 1.49
CTDNEP1-210ENST00000574322 OPRM1P35372 400 aa24.32■■□□□ 1.48
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF626Q68DY1 528 aa24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms