RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	OR12D2	P58182	307 aa		17.82	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	17.82	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	KLRD1	Q13241	179 aa		17.82	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	C9orf16	Q9BUW7	83 aa		17.82	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	ADI1	Q9BV57	179 aa		17.82	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	C19orf12	Q9NSK7	152 aa		17.82	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	C1RL	Q9NZP8	487 aa		17.82	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	FRRS1L	Q9P0K9	344 aa		17.82	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC7A11	Q9UPY5	501 aa		17.82	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM230A	A0A1W2PPH8	454 aa		17.81	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200		F8VVB4	439 aa		17.81	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200		F8VWA3	439 aa		17.81	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	NPFF	O15130	113 aa		17.81	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	ISG15	P05161	165 aa		17.81	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	OMG	P23515	440 aa		17.81	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	UBE2E1	P51965	193 aa		17.81	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	FUT6	P51993	359 aa		17.81	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	HCP5	Q6MZN7	132 aa		17.81	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	BATF2	Q8N1L9	274 aa		17.81	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	PQLC1	Q8N2U9	271 aa		17.81	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	C11orf42	Q8N5U0	333 aa		17.81	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	TBC1D15	Q8TC07	691 aa		17.81	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	LGALS12	Q96DT0	336 aa		17.81	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		17.81	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	GMPPB	Q9Y5P6	360 aa		17.81	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	DSCAML1	Q8TD84	2053 aa		17.81	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	DAPL1	A0PJW8	107 aa		17.81	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC1A7	O00341	560 aa		17.81	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	GATB	O75879	557 aa	Known RBP	17.81	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	NDUFA7	O95182	113 aa		17.81	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	17.81	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	NCR3LG1	Q68D85	454 aa		17.81	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	ENTHD1	Q8IYW4	607 aa		17.81	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	PNKD	Q8N490	385 aa		17.81	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	ACBD7	Q8N6N7	88 aa		17.81	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	RHOXF1	Q8NHV9	184 aa		17.81	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	PP6455	Q8WZ26	134 aa		17.81	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	DYRK2	Q92630	601 aa		17.81	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	ADAT3	Q96EY9	351 aa	Predicted RBP	17.81	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	VWF	P04275	2813 aa		17.8	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		17.8	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	SNTN	A6NMZ2	147 aa		17.8	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	KNG1	P01042	644 aa		17.8	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	EEF1B2	P24534	225 aa	Known RBP	17.8	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	CAPZA1	P52907	286 aa		17.8	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM244	Q5VVB8	128 aa		17.8	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM200B	Q69YZ2	307 aa		17.8	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM185A	Q8N0U4	392 aa		17.8	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	SLITRK2	Q9H156	845 aa		17.8	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNRD1	Q9P1U0	126 aa		17.8	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	CAB39	Q9Y376	341 aa	Predicted RBP	17.8	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM96B	Q9Y3D0	163 aa		17.8	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	IGKV1-9	A0A0C4DH69	117 aa		17.79	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	SERPINA3	P01011	423 aa		17.79	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	TK1	P04183	234 aa		17.79	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	FBP1	P09467	338 aa		17.79	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	DBT	P11182	482 aa	Known RBP	17.79	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	CCR9	P51686	369 aa		17.79	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	RPL31	P62899	125 aa	Known RBP	17.79	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF91	Q05481	1191 aa		17.79	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	ACSM1	Q08AH1	577 aa		17.79	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	BLMH	Q13867	455 aa		17.79	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	TAF9	Q16594	264 aa		17.79	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	ZBTB49	Q6ZSB9	765 aa		17.79	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	DNAAF1	Q8NEP3	725 aa		17.79	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	OR5D13	Q8NGL4	314 aa		17.79	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	PELI1	Q96FA3	418 aa		17.79	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	CEP19	Q96LK0	163 aa		17.79	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF649	Q9BS31	505 aa		17.79	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		17.79	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	CMYA5	Q8N3K9	4069 aa		17.78	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A1B0GUS0	222 aa		17.78	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	LOC100130705	A0A1B0GUX0	176 aa		17.78	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A1W2PRD5	423 aa		17.78	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A1W2PRF3	423 aa		17.78	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A1W2PRM7	423 aa		17.78	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200		K7N7A8	449 aa		17.78	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	GPR137B	O60478	399 aa		17.78	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	CRYBA1	P05813	215 aa		17.78	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	SAA4	P35542	130 aa		17.78	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	RAG2	P55895	527 aa		17.78	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	PRR31	Q5SQ13	230 aa		17.78	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	UTS2B	Q765I0	119 aa		17.78	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	OR4F5	Q8NH21	305 aa		17.78	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	BORCS8	Q96FH0	119 aa		17.78	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	AJUBA	Q96IF1	538 aa		17.78	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	DPAGT1	Q9H3H5	408 aa		17.78	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM118A	Q9NWS6	357 aa		17.78	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	OR14J1	Q9UGF5	321 aa		17.78	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	MYRF	Q9Y2G1	1151 aa		17.78	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	MEIOC	A2RUB1	952 aa		17.77	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	OR4C45	A6NMZ5	311 aa		17.77	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200		H0YAE9	185 aa		17.77	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	MPZL2	O60487	215 aa		17.77	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF737	O75373	536 aa		17.77	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	IGHA1	P01876	353 aa		17.77	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	ACTA2	P62736	377 aa		17.77	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	ACTG2	P63267	376 aa		17.77	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	GALE	Q14376	348 aa		17.77	■□□□□ 0.44
PPP4C-205	ENST00000563200	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	17.77	■□□□□ 0.44

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.5 ms