RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560631.1

RNF31-222, Transcript of ring finger protein 31, human

TSL 2

Gene RNF31, Length 320 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF31-222	ENST00000560631	INAFM1	C9JVW0	142 aa		6.69	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631		H3BSH0	61 aa		6.69	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	AKR7A2	O43488	359 aa		6.69	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	SULT1B1	O43704	296 aa		6.69	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	SYNGR1	O43759	233 aa		6.69	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	GYPA	P02724	150 aa		6.69	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	CD2	P06729	351 aa		6.69	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	RPS2	P15880	293 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	IGFBP3	P17936	291 aa	Predicted RBP	6.69	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	CEL	P19835	753 aa		6.69	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	FST	P19883	344 aa		6.69	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	AMY2B	P19961	511 aa		6.69	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	GLRA1	P23415	457 aa		6.69	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	AZGP1	P25311	298 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	PITPNB	P48739	271 aa		6.69	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	6.69	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	PDZK1IP1	Q13113	114 aa		6.69	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	TPBG	Q13641	420 aa		6.69	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	DOC2B	Q14184	412 aa		6.69	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	TBCE	Q15813	527 aa	Predicted RBP	6.69	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	CR1L	Q2VPA4	569 aa		6.69	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	6.69	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	ASPHD2	Q6ICH7	369 aa		6.69	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	LYPD2	Q6UXB3	125 aa		6.69	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		6.69	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	NLRC3	Q7RTR2	1065 aa		6.69	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	SLC36A1	Q7Z2H8	476 aa		6.69	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	ANGPTL5	Q86XS5	388 aa		6.69	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	CALHM1	Q8IU99	346 aa		6.69	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	MKX	Q8IYA7	352 aa		6.69	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	SAXO1	Q8IYX7	474 aa		6.69	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	MS4A15	Q8N5U1	240 aa		6.69	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	ZSCAN4	Q8NAM6	433 aa	Predicted RBP	6.69	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	DEFB108B	Q8NET1	73 aa		6.69	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	TMEM106A	Q96A25	262 aa		6.69	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	MED30	Q96HR3	178 aa		6.69	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	OPALIN	Q96PE5	141 aa		6.69	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	OR5M11	Q96RB7	305 aa		6.69	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		6.69	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	WDR13	Q9H1Z4	485 aa		6.69	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	HIF1AN	Q9NWT6	349 aa		6.69	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	NLK	Q9UBE8	527 aa		6.69	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	CTSZ	Q9UBR2	303 aa		6.69	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	CDC42EP3	Q9UKI2	254 aa		6.69	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	FAM230A	A0A1W2PPH8	454 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	OR2AT4	A6NND4	320 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	ZNF879	B4DU55	563 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	TRAPPC2L	H3BP13	241 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	SIGLEC5	O15389	551 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	ADAM20	O43506	726 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	FCN3	O75636	299 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	SC5D	O75845	299 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	ECD	O95905	644 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	KNG1	P01042	644 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	OCM2	P0CE71	109 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	PPIAL4G	P0DN37	164 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	PSG2	P11465	335 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	MTCP1	P56278	107 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	CAV3	P56539	151 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	RIPPLY3	P57055	190 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	GNB2	P62879	340 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	PAX8	Q06710	450 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	SMIM21	Q3B7S5	101 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631		Q499Y3	187 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	CD276	Q5ZPR3	534 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	ASCL4	Q6XD76	172 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631		Q71RC1	249 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	CDH26	Q8IXH8	852 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631		Q8IYB0	196 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	TEX29	Q8N6K0	151 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	ZFP41	Q8N8Y5	198 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	BOLL	Q8N9W6	283 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	C19orf18	Q8NEA5	215 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	PXT1	Q8NFP0	134 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	OR13C9	Q8NGT0	318 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	TRMT10A	Q8TBZ6	339 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	TSEN15	Q8WW01	171 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	EDARADD	Q8WWZ3	215 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	TMIGD2	Q96BF3	282 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	SEH1L	Q96EE3	360 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	SDSL	Q96GA7	329 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	TMPRSS13	Q9BYE2	586 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	CLN8	Q9UBY8	286 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	ZNF222	Q9UK12	451 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	FOXJ3	Q9UPW0	622 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	LRRC42	Q9Y546	428 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	INSIG2	Q9Y5U4	225 aa		6.68	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	MXRA5	Q9NR99	2828 aa		6.67	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	IGKV1D-17	A0A075B6S4	117 aa		6.67	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	LOC105371242	A0A075B767	164 aa		6.67	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	IGHV3OR15-7	A0A075B7D8	119 aa		6.67	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631	IGHV2-70D	A0A0C4DH43	119 aa		6.67	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631		A0A0G2JMP0	313 aa		6.67	□□□□□ -1.34
RNF31-222	ENST00000560631		A0A0X1KG70	313 aa		6.67	□□□□□ -1.34

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.2 ms