RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559061.5

SNX1-204, Transcript of sorting nexin 1, humanhuman

TSL 5

Gene SNX1, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX1-204ENST00000559061 CPEP16870 476 aa9.5□□□□□ -0.89
SNX1-204ENST00000559061 ADRA2CP18825 462 aa9.5□□□□□ -0.89
SNX1-204ENST00000559061 FSTP19883 344 aa9.5□□□□□ -0.89
SNX1-204ENST00000559061 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SNX1-204ENST00000559061 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SNX1-204ENST00000559061 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
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SNX1-204ENST00000559061 DGUOKQ16854 277 aa9.5□□□□□ -0.89
SNX1-204ENST00000559061 Q499Y3 187 aa9.5□□□□□ -0.89
SNX1-204ENST00000559061 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SNX1-204ENST00000559061 LIPKQ5VXJ0 399 aa9.5□□□□□ -0.89
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SNX1-204ENST00000559061 SLC25A26Q70HW3 274 aa9.5□□□□□ -0.89
SNX1-204ENST00000559061 ZNF573Q86YE8 665 aa9.5□□□□□ -0.89
SNX1-204ENST00000559061 SERPINA12Q8IW75 414 aa9.5□□□□□ -0.89
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SNX1-204ENST00000559061 CD177Q8N6Q3 437 aa9.5□□□□□ -0.89
SNX1-204ENST00000559061 OR5D18Q8NGL1 313 aa9.5□□□□□ -0.89
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SNX1-204ENST00000559061 RAB39BQ96DA2 213 aa9.5□□□□□ -0.89
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SNX1-204ENST00000559061 Q9H521 79 aa9.5□□□□□ -0.89
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SNX1-204ENST00000559061 YAE1D1Q9NRH1 226 aa9.5□□□□□ -0.89
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SNX1-204ENST00000559061 MAB21L2Q9Y586 359 aa9.5□□□□□ -0.89
SNX1-204ENST00000559061 HIVEP2P31629 2446 aa9.5□□□□□ -0.89
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SNX1-204ENST00000559061 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa9.49□□□□□ -0.89
SNX1-204ENST00000559061 ZNF879B4DU55 563 aa9.49□□□□□ -0.89
SNX1-204ENST00000559061 GABRPO00591 440 aa9.49□□□□□ -0.89
SNX1-204ENST00000559061 ADAM20O43506 726 aa9.49□□□□□ -0.89
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SNX1-204ENST00000559061 RPSAP08865 295 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
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SNX1-204ENST00000559061 KCTD21Q4G0X4 260 aa9.49□□□□□ -0.89
SNX1-204ENST00000559061 UBE2UQ5VVX9 321 aa9.49□□□□□ -0.89
SNX1-204ENST00000559061 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SNX1-204ENST00000559061 ZNF773Q6PK81 442 aa9.49□□□□□ -0.89
SNX1-204ENST00000559061 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa9.49□□□□□ -0.89
SNX1-204ENST00000559061 ZNF367Q7RTV3 350 aa9.49□□□□□ -0.89
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SNX1-204ENST00000559061 GFI1Q99684 422 aa9.49□□□□□ -0.89
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SNX1-204ENST00000559061 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
SNX1-204ENST00000559061 OR3A4PP47883 348 aa9.48□□□□□ -0.89
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SNX1-204ENST00000559061 POU3F4P49335 361 aa9.48□□□□□ -0.89
SNX1-204ENST00000559061 FABP5Q01469 135 aa9.48□□□□□ -0.89
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SNX1-204ENST00000559061 MICBQ29980 383 aa9.48□□□□□ -0.89
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SNX1-204ENST00000559061 OR5D14Q8NGL3 314 aa9.48□□□□□ -0.89
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SNX1-204ENST00000559061 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
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SNX1-204ENST00000559061 ZNF581Q9P0T4 197 aa9.48□□□□□ -0.89
SNX1-204ENST00000559061 BLOC1S6Q9UL45 172 aa9.48□□□□□ -0.89
SNX1-204ENST00000559061 LRCH1Q9Y2L9 728 aa9.48□□□□□ -0.89
SNX1-204ENST00000559061 TRAV20A0A0B4J274 112 aa9.47□□□□□ -0.89
SNX1-204ENST00000559061 RFPL4AA6NLU0 287 aa9.47□□□□□ -0.89
SNX1-204ENST00000559061 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa9.47□□□□□ -0.89
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