RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556067.1

ATL1-208, Transcript of atlastin GTPase 1, human

TSL 4

Gene ATL1, Length 550 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATL1-208	ENST00000556067	TMEM14DP	A8MWL7	114 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	IQCF6	A8MYZ5	107 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	PRSS44	E7EML9	344 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	SULT1C2	O00338	296 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	TPD52L2	O43399	206 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	GSTZ1	O43708	216 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	CDC14B	O60729	498 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	CSF1	P09603	554 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	CSF3	P09919	207 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	MGMT	P16455	207 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	SERPINA2	P20848	420 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	KITLG	P21583	273 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	TNFSF4	P23510	183 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	CD40	P25942	277 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	RCVRN	P35243	200 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	GLRX	P35754	106 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	ALDH3B1	P43353	468 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	HAAO	P46952	286 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	VEGFC	P49767	419 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	GPM6A	P51674	278 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	KLF3	P57682	345 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	GNG2	P59768	71 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	ACTB	P60709	375 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	RPS27A	P62979	156 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	ACTG1	P63261	375 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	SORD	Q00796	357 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	SSBP1	Q04837	148 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	PDZK1IP1	Q13113	114 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	ARFRP1	Q13795	201 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF79	Q15937	498 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	MBNL2	Q5VZF2	373 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	OR10K2	Q6IF99	312 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	FIP1L1	Q6UN15	594 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	NCCRP1	Q6ZVX7	275 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	SLC25A26	Q70HW3	274 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	KRT74	Q7RTS7	529 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067		Q8IYB0	196 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	IZUMO1	Q8IYV9	350 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	SAXO1	Q8IYX7	474 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	OSR2	Q8N2R0	312 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF611	Q8N823	705 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	ACBD4	Q8NC06	268 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	RELL2	Q8NC24	303 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	PXT1	Q8NFP0	134 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	OR8G5	Q8NG78	346 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	OR10R2	Q8NGX6	335 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	SMIM4	Q8WVI0	70 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	OR5P3	Q8WZ94	311 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	SLC25A38	Q96DW6	304 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	RAB3C	Q96E17	227 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	MARS2	Q96GW9	593 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	NEDD4L	Q96PU5	975 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	SOST	Q9BQB4	213 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	C7orf50	Q9BRJ6	194 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	NUDT16L1	Q9BRJ7	211 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	ADAT1	Q9BUB4	502 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	CXXC4	Q9H2H0	198 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	POFUT1	Q9H488	388 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	PLK3	Q9H4B4	646 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	SCPEP1	Q9HB40	452 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	RHOF	Q9HBH0	211 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	IFT46	Q9NQC8	304 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	GLS2	Q9UI32	602 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	PURG	Q9UJV8	347 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	CACNA1A	O00555	2505 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	FAM240B	A0A1B0GVZ2	78 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	LRP5L	A4QPB2	252 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	NAP1L6	A6NFF2	107 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	TUBAL3	A6NHL2	446 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067		B8ZZF3	427 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	ATP6V1G2-DDX39B	F2Z307	99 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067		J3QT63	122 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	ABCD4	O14678	606 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	LDLRAD4	O15165	306 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	LYRM1	O43325	122 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	AKR7A2	O43488	359 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	SPRY1	O43609	319 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	AMY2A	P04746	511 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	LPL	P06858	475 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	GRP	P07492	148 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	CD3G	P09693	182 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	AMY2B	P19961	511 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	AGA	P20933	346 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	ANOS1	P23352	680 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	GABRR1	P24046	479 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	BLVRB	P30043	206 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	CALCR	P30988	508 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	CBX5	P45973	191 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	PTH2R	P49190	550 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	SRP9	P49458	86 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	EFNB2	P52799	333 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	ERVS71-1	P61550	626 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	IL24	Q13007	206 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	PSG7	Q13046	419 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	TNK1	Q13470	666 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	ASAH1	Q13510	395 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	BAK1	Q16611	211 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	PNLIPRP3	Q17RR3	467 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATL1-208	ENST00000556067	FBXL19-AS1	Q494R0	122 aa		4.74	□□□□□ -1.65

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