RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 ISOC2Q96AB3 205 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM45BQ96B21 275 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 MSL2Q9HCI7 577 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 ELOVL5Q9NYP7 299 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 JKAMPQ9P055 326 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 I6L893 689 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 MOSPD3O75425 235 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 F13BP05160 661 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 ZBTB25P24278 435 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 EFNA3P52797 238 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 ATP1B3P54709 279 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 IKZF1Q13422 519 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 FRMPD2BQ6IN97 320 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 SLC48A1Q6P1K1 146 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP5.64□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 JTBO76095 146 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 ACTL6AO96019 429 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 DBHP09172 617 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 ARRB2P32121 409 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 UFM1P61960 85 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF92Q03936 586 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 AGERQ15109 404 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 PMCHL1Q16048 86 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 KHDC3LQ587J8 217 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 PLAG1Q6DJT9 500 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 OR9Q2Q8NGE9 314 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 WFDC5Q8TCV5 224 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 RAX2Q96IS3 184 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 ANGPTL4Q9BY76 406 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 C20orf27Q9GZN8 174 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF835Q9Y2P0 537 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 SDK1Q7Z5N4 2213 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 A0A1W2PRS3 328 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 FRG2CA6NGY1 282 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 ANKRD34CP0C6C1 535 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 NPBWR1P48145 328 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 CAV2P51636 162 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 SIAH3Q8IW03 269 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 MKXQ8IYA7 352 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 PIANPQ8IYJ0 282 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 TMED6Q8WW62 240 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
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PTPRB-210ENST00000551525 SLC25A31Q9H0C2 315 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 TUBA4BQ9H853 241 aa5.63□□□□□ -1.51
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PTPRB-210ENST00000551525 CLN8Q9UBY8 286 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 HHLA2Q9UM44 414 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 KCNMB2Q9Y691 235 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 A0A1W2PPK0 400 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM262E9PQX1 116 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 MPPED1O15442 326 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF205O95201 554 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 SCG5P05408 212 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 GRPRP30550 384 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 PMP22Q01453 160 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 ACVR1Q04771 509 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 SHBQ15464 509 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 APOOLQ6UXV4 268 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 ZFP41Q8N8Y5 198 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 FNDC9Q8TBE3 224 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 A8MWP6 167 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF878C9JN71 531 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 GFYI3L273 518 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 EREGO14944 169 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 IL5P05113 134 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 ACP2P11117 423 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 AMTP48728 403 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 CPZQ66K79 652 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 TRAT1Q6PIZ9 186 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 BTNL8Q6UX41 500 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF627Q7L945 461 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF584Q8IVC4 421 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 CT55Q8WUE5 264 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 ZDHHC16Q969W1 377 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 APMAPQ9HDC9 416 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 DAPP1Q9UN19 280 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 LDB3O75112 727 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 LIM2P55344 173 aa5.63□□□□□ -1.51
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