RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550734.5

CS-221, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-221ENST00000550734 DMRTC1Q5HYR2 192 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 PRSS35Q8N3Z0 413 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 PIP4P2Q8N4L2 257 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 CBR4Q8N4T8 237 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 ZNF561Q8N587 486 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 ZNRF1Q8ND25 227 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 TBX5Q99593 518 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 CHST5Q9GZS9 411 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 C16orf95Q9H693 158 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 TCF7L1Q9HCS4 588 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 GPR173Q9NS66 373 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 RFPL4AA6NLU0 287 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 SLC16A6O15403 523 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 SYNGR1O43759 233 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 MPZL2O60487 215 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 GATBO75879 557 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 APOL3O95236 402 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 PRDX2P32119 198 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 KIR3DL2P43630 455 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 IER3P46695 156 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 CCR9P51686 369 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 UBE2E1P51965 193 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 FUT6P51993 359 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 GMFBP60983 142 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 ACSM1Q08AH1 577 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 UBE2V2Q15819 145 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 TMEM244Q5VVB8 128 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 NCR3LG1Q68D85 454 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 CALHM1Q8IU99 346 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 ACBD7Q8N6N7 88 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 CD177Q8N6Q3 437 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 DNAAF1Q8NEP3 725 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 OR2G2Q8NGZ5 317 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 RHOXF1Q8NHV9 184 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 PP6455Q8WZ26 134 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 MBOAT4Q96T53 435 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 C9orf16Q9BUW7 83 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 S100A14Q9HCY8 104 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 ONECUT1Q9UBC0 465 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 SLC7A11Q9UPY5 501 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 PLXNB1O43157 2135 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 A0A0U1RQK1 487 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 SLC1A7O00341 560 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 SERPINA3P01011 423 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 TFF1P04155 84 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 NDUFB7P17568 137 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 GABRA2P47869 451 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 BLMHQ13867 455 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 C2orf68Q2NKX9 166 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 TP53I3Q53FA7 332 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 Q6ZSV7 163 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 UTS2BQ765I0 119 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 FAM220AQ7Z4H9 259 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 SYS1Q8N2H4 156 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 PQLC1Q8N2U9 271 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 OR5D13Q8NGL4 314 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 RNFT2Q96EX2 444 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 SLC29A1Q99808 456 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 ADI1Q9BV57 179 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 FAM234AQ9H0X4 552 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 PLEKHA1Q9HB21 404 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 FRRS1LQ9P0K9 344 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 GNG8Q9UK08 70 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 DAPL1A0PJW8 107 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 A6NIN4 97 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 K7N7A8 449 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 NPFFO15130 113 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 TSPAN9O75954 239 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 NXPH2O95156 264 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 IGHV4-59P01825 116 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 IGHA1P01876 353 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 RPSAP08865 295 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 FBP1P09467 338 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 OR12D2P58182 307 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 ACTA2P62736 377 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 ACTG2P63267 376 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 Q6ZPA2 131 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 ANGPTL5Q86XS5 388 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 ENTHD1Q8IYW4 607 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-221ENST00000550734 C11orf42Q8N5U0 333 aa9.4□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.9 ms