RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 WIPI2Q9Y4P8 454 aa3.49□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa3.49□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 V9GYY5 206 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 A0A0B4J293 547 aa3.48□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 A0A1B0GVI7 797 aa3.48□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 DHRS7CA6NNS2 312 aa3.48□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa3.48□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF878C9JN71 531 aa3.48□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 FXYD1O00168 92 aa3.48□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 SLC16A7O60669 478 aa3.48□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 TPST2O60704 377 aa3.48□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 GLCEO94923 617 aa3.48□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 IGHV1-46P01743 117 aa3.48□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 IGHV2-70P01814 119 aa3.48□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 OPN1SWP03999 348 aa3.48□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 HMGN1P05114 100 aa3.48□□□□□ -1.85
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HDAC2-216ENST00000523628 COX4I1P13073 169 aa3.48□□□□□ -1.85
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HDAC2-216ENST00000523628 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 FMO3P31513 532 aa3.48□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 AQP2P41181 271 aa3.48□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 ALDH3B1P43353 468 aa3.48□□□□□ -1.85
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HDAC2-216ENST00000523628 NUDT2P50583 147 aa3.48□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 HIST1H3AP68431 136 aa3.48□□□□□ -1.85
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HDAC2-216ENST00000523628 SPIBQ01892 262 aa3.48□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 LIPEQ05469 1076 aa3.48□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 ACSM1Q08AH1 577 aa3.48□□□□□ -1.85
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HDAC2-216ENST00000523628 RFX4Q33E94 735 aa3.48□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa3.48□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa3.48□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 METTL11BQ5VVY1 283 aa3.48□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa3.48□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 HIST2H3AQ71DI3 136 aa3.48□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 TUBA1AQ71U36 451 aa3.48□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 FAM122BQ7Z309 247 aa3.48□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 ICA1LQ8NDH6 482 aa3.48□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 OR2T33Q8NG76 320 aa3.48□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 OR2Z1Q8NG97 314 aa3.48□□□□□ -1.85
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HDAC2-216ENST00000523628 SLC25A40Q8TBP6 338 aa3.48□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa3.48□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 DYRK2Q92630 601 aa3.48□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 UPRTQ96BW1 309 aa3.48□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 MED30Q96HR3 178 aa3.48□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 PYURFQ96I23 114 aa3.48□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 NSMCE2Q96MF7 247 aa3.48□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa3.48□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 OR2J1Q9GZK6 312 aa3.48□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 C1orf21Q9H246 121 aa3.48□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 MMP27Q9H306 513 aa3.48□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 IKZF5Q9H5V7 419 aa3.48□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 MOB1AQ9H8S9 216 aa3.48□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 LPAR2Q9HBW0 351 aa3.48□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 IL20Q9NYY1 176 aa3.48□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 KAAG1Q9UBP8 84 aa3.48□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 SIGLEC7Q9Y286 467 aa3.48□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa3.48□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 PPIAL4AQ9Y536 164 aa3.48□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 MPC1Q9Y5U8 109 aa3.48□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 KPTNQ9Y664 436 aa3.48□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 CDH10Q9Y6N8 788 aa3.48□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa3.48□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 A0A087WUU8 490 aa3.47□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa3.47□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa3.47□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 A0A1B0GUV1 79 aa3.47□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 LRP5LA4QPB2 252 aa3.47□□□□□ -1.85
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HDAC2-216ENST00000523628 OR5B21A6NL26 309 aa3.47□□□□□ -1.85
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HDAC2-216ENST00000523628 XRCC3O43542 346 aa3.47□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 OR10H3O60404 316 aa3.47□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF254O75437 659 aa3.47□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 NDUFA7O95182 113 aa3.47□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 LYPD3O95274 346 aa3.47□□□□□ -1.85
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HDAC2-216ENST00000523628 FAM107AO95990 144 aa3.47□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 SERPINA1P01009 418 aa3.47□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 RBP4P02753 201 aa3.47□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 FBP1P09467 338 aa3.47□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 CALB2P22676 271 aa3.47□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 CBLP22681 906 aa3.47□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 HSD11B1P28845 292 aa3.47□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 GGT2P36268 569 aa3.47□□□□□ -1.85
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