RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509355.5

PDE4D-217, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 847 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-217ENST00000509355 MED27Q6P2C8 311 aa3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 SSX9Q7RTT3 188 aa3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 VTCN1Q7Z7D3 282 aa3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 TCAIMQ8N3R3 496 aa3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 OR51G2Q8NGK0 314 aa3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 FBXO25Q8TCJ0 367 aa3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 MITD1Q8WV92 249 aa3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 RAB1CQ92928 201 aa3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 YIPF5Q969M3 257 aa3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 C10orf35Q96D05 121 aa3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 PELI1Q96FA3 418 aa3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 SERPINB12Q96P63 405 aa3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 TECTBQ96PL2 329 aa3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 C20orf24Q9BUV8 137 aa3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 KIFC1Q9BW19 673 aa3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF442Q9H7R0 627 aa3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 MED4Q9NPJ6 270 aa3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 MAT2BQ9NZL9 334 aa3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 SENP1Q9P0U3 644 aa3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 PRO0461Q9UI25 63 aa3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 IKZF2Q9UKS7 526 aa3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 TENM2Q9NT68 2774 aa3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 TRAV40A0A0B4J280 105 aa3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 HSBP1L1C9JCN9 74 aa3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 OR7A17O14581 309 aa3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 FADS1O60427 444 aa3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 STX11O75558 287 aa3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 NUDT14O95848 222 aa3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 HPGDP15428 266 aa3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 IGLL1P15814 213 aa3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 HPCAL1P37235 193 aa3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 EIF1P41567 113 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 EMDP50402 254 aa3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 RAB9AP51151 201 aa3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 BCAP31P51572 246 aa3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 XGP55808 180 aa3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 RWDD2BP57060 319 aa3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 BDH1Q02338 343 aa3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 LIPEQ05469 1076 aa3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 TGFBIQ15582 683 aa3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 CHI3L2Q15782 390 aa3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 C15orf32Q32M92 178 aa3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 ALKBH6Q3KRA9 238 aa3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 FAM106AQ4KMX7 169 aa3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 ZFAND6Q6FIF0 208 aa3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 TMEM53Q6P2H8 277 aa3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 CASP12Q6UXS9 341 aa3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 Q6ZVQ6 151 aa3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 MOB3BQ86TA1 216 aa3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 C1orf174Q8IYL3 243 aa3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 TMEM86BQ8N661 226 aa3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 GVQW1Q8N7I0 195 aa3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 GATSQ8NAP1 163 aa3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 DEFB108BQ8NET1 73 aa3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 OR52E4Q8NGH9 312 aa3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 ZFP90Q8TF47 636 aa3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 CDKL2Q92772 493 aa3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 SLC38A4Q969I6 547 aa3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 PARD6BQ9BYG5 372 aa3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 COMMD4Q9H0A8 199 aa3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 PARLQ9H300 379 aa3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 GOLPH3Q9H4A6 298 aa3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 ANKRA2Q9H9E1 313 aa3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 TAS2R9Q9NYW1 312 aa3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 OR5V1Q9UGF6 321 aa3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 PITPNC1Q9UKF7 332 aa3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 FBXO5Q9UKT4 447 aa3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 ASB4Q9Y574 426 aa3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 GMEB1Q9Y692 573 aa3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 HERC2O95714 4834 aa3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 EXPH5Q8NEV8 1989 aa3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 A0A0A6YYD5 115 aa3.48□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 TRAV25A0A0B4J276 109 aa3.48□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa3.48□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa3.48□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa3.48□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 H0YHG0 523 aa3.48□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms