RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495619.1

NCKAP1-208, Transcript of NCK associated protein 1, human

TSL 3

Gene NCKAP1, Length 665 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NCKAP1-208	ENST00000495619	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		2.58	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	OR4A4P	Q8NGN8	299 aa		2.58	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	OR9A2	Q8NGT5	310 aa		2.58	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	DYNC2LI1	Q8TCX1	351 aa		2.58	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	RTN4IP1	Q8WWV3	396 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	C22orf15	Q8WYQ4	148 aa		2.58	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	MAFIP	Q8WZ33	124 aa		2.58	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	C8orf44	Q96CB5	159 aa		2.58	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	CMTM5	Q96DZ9	223 aa		2.58	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	ANKRD36BP1	Q96IX9	119 aa		2.58	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	JSRP1	Q96MG2	331 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	ZFP3	Q96NJ6	502 aa		2.58	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	TEAD3	Q99594	435 aa		2.58	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	RNF5	Q99942	180 aa		2.58	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	COPS4	Q9BT78	406 aa		2.58	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	RSG1	Q9BU20	258 aa		2.58	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	ZNF426	Q9BUY5	554 aa		2.58	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	BEX2	Q9BXY8	128 aa		2.58	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	TRABD	Q9H4I3	376 aa		2.58	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	ASB7	Q9H672	318 aa		2.58	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	VCX3A	Q9NNX9	186 aa		2.58	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	ZC4H2	Q9NQZ6	224 aa		2.58	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	PLEKHJ1	Q9NW61	149 aa		2.58	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	CCDC59	Q9P031	241 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619		S4R3C0	116 aa		2.58	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		2.58	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	MAP3K5	Q99683	1374 aa		2.58	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619		A0A1B0GTI1	187 aa		2.57	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	SLC5A10	A0PJK1	596 aa		2.57	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	ZNF233	A6NK53	670 aa		2.57	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	LYRM9	A8MSI8	78 aa		2.57	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619		M0R036	132 aa		2.57	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619		M0R3G1	203 aa		2.57	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	BPY2	O14599	106 aa		2.57	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	ZBTB5	O15062	677 aa		2.57	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	CHST1	O43916	411 aa		2.57	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	SLC19A2	O60779	497 aa		2.57	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	CTNS	O60931	367 aa		2.57	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	HSBP1	O75506	76 aa		2.57	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	CLDN11	O75508	207 aa		2.57	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	FCN3	O75636	299 aa		2.57	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	ZMPSTE24	O75844	475 aa		2.57	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	CCNK	O75909	580 aa		2.57	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	FARS2	O95363	451 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	TNFAIP8	O95379	198 aa		2.57	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	SERPINA1	P01009	418 aa		2.57	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	CALB1	P05937	261 aa		2.57	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	CTSL	P07711	333 aa		2.57	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	MYL2	P10916	166 aa		2.57	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	SLC2A1	P11166	492 aa		2.57	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	GFAP	P14136	432 aa		2.57	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	NQO1	P15559	274 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	BCKDHB	P21953	392 aa		2.57	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	DCK	P27707	260 aa		2.57	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	HTR2C	P28335	458 aa		2.57	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	COIL	P38432	576 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	RBM34	P42696	430 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	SLC1A1	P43005	524 aa		2.57	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	XK	P51811	444 aa		2.57	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	RAB10	P61026	200 aa		2.57	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	STXBP1	P61764	594 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	CCL7	P80098	99 aa		2.57	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	OR4D1	Q15615	310 aa		2.57	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	SLC36A2	Q495M3	483 aa		2.57	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	ORMDL2	Q53FV1	153 aa		2.57	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	UBE2U	Q5VVX9	321 aa		2.57	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	C22orf42	Q6IC83	251 aa		2.57	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	TMPRSS11A	Q6ZMR5	421 aa		2.57	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	IDO2	Q6ZQW0	420 aa		2.57	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	SLC16A14	Q7RTX9	510 aa		2.57	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	S100A7A	Q86SG5	101 aa		2.57	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	NT5DC3	Q86UY8	548 aa		2.57	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	HORMAD1	Q86X24	394 aa		2.57	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	CMTM1	Q8IZ96	169 aa		2.57	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	STK40	Q8N2I9	435 aa		2.57	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	NPW	Q8N729	165 aa		2.57	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	C12orf29	Q8N999	325 aa		2.57	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	CDRT4	Q8N9R6	151 aa		2.57	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	TMEM35B	Q8NCS4	154 aa		2.57	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	OR52E5	Q8NH55	327 aa		2.57	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	OR2V1	Q8NHB1	315 aa		2.57	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	OR10J5	Q8NHC4	309 aa		2.57	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	LGALS14	Q8TCE9	139 aa		2.57	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	PIFO	Q8TCI5	191 aa		2.57	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	KCTD4	Q8WVF5	259 aa		2.57	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	RASSF5	Q8WWW0	418 aa		2.57	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	CDS1	Q92903	461 aa		2.57	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	BORCS5	Q969J3	196 aa		2.57	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	ZNF717	Q9BY31	904 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	PORCN	Q9H237	461 aa		2.57	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	PLEKHA1	Q9HB21	404 aa		2.57	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	PRSS16	Q9NQE7	514 aa		2.57	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	FBXO8	Q9NRD0	319 aa		2.57	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	HRASLS2	Q9NWW9	162 aa		2.57	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	FAM32A	Q9Y421	112 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	NUP155	O75694	1391 aa		2.57	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		2.57	□□□□□ -2
NCKAP1-208	ENST00000495619	DOCK8	Q8NF50	2099 aa		2.56	□□□□□ -2

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