RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493976.1

AKAP9-215, Transcript of A-kinase anchoring protein 9, human

TSL 3

Gene AKAP9, Length 724 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP9-215	ENST00000493976	UTP4	Q969X6	686 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
AKAP9-215	ENST00000493976	SLC7A6OS	Q96CW6	309 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
AKAP9-215	ENST00000493976	USE1	Q9NZ43	259 aa		12.86	□□□□□ -0.35
AKAP9-215	ENST00000493976	OR52A1	Q9UKL2	312 aa		12.86	□□□□□ -0.35
AKAP9-215	ENST00000493976	SLC22A13	Q9Y226	551 aa		12.86	□□□□□ -0.35
AKAP9-215	ENST00000493976	TMEM14A	Q9Y6G1	99 aa		12.86	□□□□□ -0.35
AKAP9-215	ENST00000493976		R4GMQ9	66 aa		12.86	□□□□□ -0.35
AKAP9-215	ENST00000493976	NXPH2	O95156	264 aa		12.85	□□□□□ -0.35
AKAP9-215	ENST00000493976	TK1	P04183	234 aa		12.85	□□□□□ -0.35
AKAP9-215	ENST00000493976	ERVK11-1	P61568	191 aa		12.85	□□□□□ -0.35
AKAP9-215	ENST00000493976	ESRRG	P62508	458 aa		12.85	□□□□□ -0.35
AKAP9-215	ENST00000493976	BEAN1	Q3B7T3	259 aa		12.85	□□□□□ -0.35
AKAP9-215	ENST00000493976	CCBE1	Q6UXH8	406 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
AKAP9-215	ENST00000493976		Q6ZSR3	168 aa		12.85	□□□□□ -0.35
AKAP9-215	ENST00000493976		Q6ZTK2	550 aa		12.85	□□□□□ -0.35
AKAP9-215	ENST00000493976	MEPCE	Q7L2J0	689 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
AKAP9-215	ENST00000493976	TCF23	Q7RTU1	214 aa		12.85	□□□□□ -0.35
AKAP9-215	ENST00000493976	ZNF573	Q86YE8	665 aa		12.85	□□□□□ -0.35
AKAP9-215	ENST00000493976	LYG1	Q8N1E2	194 aa		12.85	□□□□□ -0.35
AKAP9-215	ENST00000493976	TCEANC	Q8N8B7	351 aa		12.85	□□□□□ -0.35
AKAP9-215	ENST00000493976	OR2T27	Q8NH04	317 aa		12.85	□□□□□ -0.35
AKAP9-215	ENST00000493976	TRMT10A	Q8TBZ6	339 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
AKAP9-215	ENST00000493976	TEX12	Q9BXU0	123 aa		12.85	□□□□□ -0.35
AKAP9-215	ENST00000493976	MOB1A	Q9H8S9	216 aa		12.85	□□□□□ -0.35
AKAP9-215	ENST00000493976	IGKV1-27	A0A075B6S5	117 aa		12.84	□□□□□ -0.35
AKAP9-215	ENST00000493976	DLGAP1	O14490	977 aa		12.84	□□□□□ -0.35
AKAP9-215	ENST00000493976	GYG2	O15488	501 aa		12.84	□□□□□ -0.35
AKAP9-215	ENST00000493976	JUNB	P17275	347 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
AKAP9-215	ENST00000493976	HOXB6	P17509	224 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
AKAP9-215	ENST00000493976	RAB13	P51153	203 aa		12.84	□□□□□ -0.35
AKAP9-215	ENST00000493976	AANAT	Q16613	207 aa		12.84	□□□□□ -0.35
AKAP9-215	ENST00000493976	ODF4	Q2M2E3	257 aa		12.84	□□□□□ -0.35
AKAP9-215	ENST00000493976	SLX4IP	Q5VYV7	408 aa		12.84	□□□□□ -0.35
AKAP9-215	ENST00000493976	NXNL2	Q5VZ03	156 aa		12.84	□□□□□ -0.35
AKAP9-215	ENST00000493976	C12orf73	Q69YU5	71 aa		12.84	□□□□□ -0.35
AKAP9-215	ENST00000493976	DNAJC9	Q8WXX5	260 aa		12.84	□□□□□ -0.35
AKAP9-215	ENST00000493976	ITFG2	Q969R8	447 aa		12.84	□□□□□ -0.35
AKAP9-215	ENST00000493976	NRBF2	Q96F24	287 aa		12.84	□□□□□ -0.35
AKAP9-215	ENST00000493976	TBX5	Q99593	518 aa		12.84	□□□□□ -0.35
AKAP9-215	ENST00000493976	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		12.84	□□□□□ -0.35
AKAP9-215	ENST00000493976	RANBP3	Q9H6Z4	567 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
AKAP9-215	ENST00000493976	ZNF702P	Q9H963	129 aa		12.84	□□□□□ -0.35
AKAP9-215	ENST00000493976	POLDIP2	Q9Y2S7	368 aa		12.84	□□□□□ -0.35
AKAP9-215	ENST00000493976	FAM90A8P	A6NJQ4	464 aa		12.83	□□□□□ -0.36
AKAP9-215	ENST00000493976	ZAR1L	A6NP61	321 aa		12.83	□□□□□ -0.36
AKAP9-215	ENST00000493976	C17orf98	A8MV24	154 aa		12.83	□□□□□ -0.36
AKAP9-215	ENST00000493976	ODF3B	A8MYP8	253 aa		12.83	□□□□□ -0.36
AKAP9-215	ENST00000493976	ZNF737	O75373	536 aa		12.83	□□□□□ -0.36
AKAP9-215	ENST00000493976	RPP14	O95059	124 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
AKAP9-215	ENST00000493976	APOL3	O95236	402 aa		12.83	□□□□□ -0.36
AKAP9-215	ENST00000493976	PRB2	P02812	416 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
AKAP9-215	ENST00000493976	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		12.83	□□□□□ -0.36
AKAP9-215	ENST00000493976	CCL1	P22362	96 aa		12.83	□□□□□ -0.36
AKAP9-215	ENST00000493976	COL10A1	Q03692	680 aa		12.83	□□□□□ -0.36
AKAP9-215	ENST00000493976	DNAL1	Q4LDG9	190 aa		12.83	□□□□□ -0.36
AKAP9-215	ENST00000493976	SAMD5	Q5TGI4	173 aa		12.83	□□□□□ -0.36
AKAP9-215	ENST00000493976	OR2T6	Q8NHC8	308 aa		12.83	□□□□□ -0.36
AKAP9-215	ENST00000493976	TMEM163	Q8TC26	289 aa		12.83	□□□□□ -0.36
AKAP9-215	ENST00000493976	IL4I1	Q96RQ9	567 aa		12.83	□□□□□ -0.36
AKAP9-215	ENST00000493976	NKX3-1	Q99801	234 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
AKAP9-215	ENST00000493976	CADM1	Q9BY67	442 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
AKAP9-215	ENST00000493976	HEXA-AS1	Q9H8Q6	139 aa		12.83	□□□□□ -0.36
AKAP9-215	ENST00000493976	KRT84	Q9NSB2	600 aa		12.83	□□□□□ -0.36
AKAP9-215	ENST00000493976	SERTAD4	Q9NUC0	356 aa		12.83	□□□□□ -0.36
AKAP9-215	ENST00000493976	CLN6	Q9NWW5	311 aa		12.83	□□□□□ -0.36
AKAP9-215	ENST00000493976	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		12.83	□□□□□ -0.36
AKAP9-215	ENST00000493976	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		12.83	□□□□□ -0.36
AKAP9-215	ENST00000493976	SNX5	Q9Y5X3	404 aa		12.83	□□□□□ -0.36
AKAP9-215	ENST00000493976	FAM230A	A0A1W2PPH8	454 aa		12.82	□□□□□ -0.36
AKAP9-215	ENST00000493976	VGLL3	A8MV65	326 aa		12.82	□□□□□ -0.36
AKAP9-215	ENST00000493976	ZNF670-ZNF695	F2Z2N8	137 aa		12.82	□□□□□ -0.36
AKAP9-215	ENST00000493976		K7N7A8	449 aa		12.82	□□□□□ -0.36
AKAP9-215	ENST00000493976	OPN1MW	P04001	364 aa		12.82	□□□□□ -0.36
AKAP9-215	ENST00000493976	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		12.82	□□□□□ -0.36
AKAP9-215	ENST00000493976	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		12.82	□□□□□ -0.36
AKAP9-215	ENST00000493976	IL24	Q13007	206 aa		12.82	□□□□□ -0.36
AKAP9-215	ENST00000493976	UBE2V2	Q15819	145 aa		12.82	□□□□□ -0.36
AKAP9-215	ENST00000493976	TMEM219	Q86XT9	240 aa		12.82	□□□□□ -0.36
AKAP9-215	ENST00000493976	ASCC1	Q8N9N2	400 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
AKAP9-215	ENST00000493976	PKIB	Q9C010	78 aa		12.82	□□□□□ -0.36
AKAP9-215	ENST00000493976	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		12.82	□□□□□ -0.36
AKAP9-215	ENST00000493976	TCF19	Q9Y242	345 aa		12.82	□□□□□ -0.36
AKAP9-215	ENST00000493976		A0A1W2PPH5	198 aa		12.81	□□□□□ -0.36
AKAP9-215	ENST00000493976	TMEM82	A0PJX8	343 aa		12.81	□□□□□ -0.36
AKAP9-215	ENST00000493976	DHRS7C	A6NNS2	312 aa		12.81	□□□□□ -0.36
AKAP9-215	ENST00000493976	DNAJC8	O75937	253 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
AKAP9-215	ENST00000493976	INMT	O95050	263 aa		12.81	□□□□□ -0.36
AKAP9-215	ENST00000493976	ARG1	P05089	322 aa		12.81	□□□□□ -0.36
AKAP9-215	ENST00000493976	LGALS4	P56470	323 aa		12.81	□□□□□ -0.36
AKAP9-215	ENST00000493976	KPRP	Q5T749	579 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
AKAP9-215	ENST00000493976	ZNF626	Q68DY1	528 aa		12.81	□□□□□ -0.36
AKAP9-215	ENST00000493976	KDM4D	Q6B0I6	523 aa		12.81	□□□□□ -0.36
AKAP9-215	ENST00000493976		Q6ZS46	218 aa		12.81	□□□□□ -0.36
AKAP9-215	ENST00000493976	CATSPERD	Q86XM0	798 aa		12.81	□□□□□ -0.36
AKAP9-215	ENST00000493976	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
AKAP9-215	ENST00000493976	SLAMF9	Q96A28	289 aa		12.81	□□□□□ -0.36
AKAP9-215	ENST00000493976	RAB18	Q9NP72	206 aa		12.81	□□□□□ -0.36
AKAP9-215	ENST00000493976		A0A1W2PQL4	384 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
AKAP9-215	ENST00000493976		A6NDX4	124 aa		12.8	□□□□□ -0.36
AKAP9-215	ENST00000493976	CD28	P10747	220 aa		12.8	□□□□□ -0.36

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