RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473778.5

C9orf3-214, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf3, Length 2,396 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-214ENST00000473778 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
C9orf3-214ENST00000473778 SERPINE3A8MV23 424 aa9.53□□□□□ -0.88
C9orf3-214ENST00000473778 TNFSF11O14788 317 aa9.53□□□□□ -0.88
C9orf3-214ENST00000473778 PATE4P0C8F1 98 aa9.53□□□□□ -0.88
C9orf3-214ENST00000473778 RNF224P0DH78 156 aa9.53□□□□□ -0.88
C9orf3-214ENST00000473778 NME2P22392 152 aa9.53□□□□□ -0.88
C9orf3-214ENST00000473778 OPRM1P35372 400 aa9.53□□□□□ -0.88
C9orf3-214ENST00000473778 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
C9orf3-214ENST00000473778 PJVKQ0ZLH3 352 aa9.53□□□□□ -0.88
C9orf3-214ENST00000473778 TAF9Q16594 264 aa9.53□□□□□ -0.88
C9orf3-214ENST00000473778 RAET1LQ5VY80 246 aa9.53□□□□□ -0.88
C9orf3-214ENST00000473778 Q6ZPA2 131 aa9.53□□□□□ -0.88
C9orf3-214ENST00000473778 OR9K2Q8NGE7 335 aa9.53□□□□□ -0.88
C9orf3-214ENST00000473778 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
C9orf3-214ENST00000473778 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
C9orf3-214ENST00000473778 NRIP2Q9BQI9 281 aa9.53□□□□□ -0.88
C9orf3-214ENST00000473778 TCEAL7Q9BRU2 100 aa9.53□□□□□ -0.88
C9orf3-214ENST00000473778 FAAP24Q9BTP7 215 aa9.53□□□□□ -0.88
C9orf3-214ENST00000473778 TREM1Q9NP99 234 aa9.53□□□□□ -0.88
C9orf3-214ENST00000473778 ZFP57Q9NU63 452 aa9.53□□□□□ -0.88
C9orf3-214ENST00000473778 PLEK2Q9NYT0 353 aa9.53□□□□□ -0.88
C9orf3-214ENST00000473778 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa9.53□□□□□ -0.88
C9orf3-214ENST00000473778 A0A0J9YW62 118 aa9.53□□□□□ -0.88
C9orf3-214ENST00000473778 AGPAT2O15120 278 aa9.53□□□□□ -0.88
C9orf3-214ENST00000473778 DHHO43323 396 aa9.53□□□□□ -0.88
C9orf3-214ENST00000473778 FBXO24O75426 580 aa9.53□□□□□ -0.88
C9orf3-214ENST00000473778 GLI4P10075 376 aa9.53□□□□□ -0.88
C9orf3-214ENST00000473778 RAB5BP61020 215 aa9.53□□□□□ -0.88
C9orf3-214ENST00000473778 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
C9orf3-214ENST00000473778 SP6Q3SY56 376 aa9.53□□□□□ -0.88
C9orf3-214ENST00000473778 TSPO2Q5TGU0 170 aa9.53□□□□□ -0.88
C9orf3-214ENST00000473778 ETV3LQ6ZN32 361 aa9.53□□□□□ -0.88
C9orf3-214ENST00000473778 BEND4Q6ZU67 534 aa9.53□□□□□ -0.88
C9orf3-214ENST00000473778 NAXEQ8NCW5 288 aa9.53□□□□□ -0.88
C9orf3-214ENST00000473778 SAP25Q8TEE9 199 aa9.53□□□□□ -0.88
C9orf3-214ENST00000473778 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
C9orf3-214ENST00000473778 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa9.53□□□□□ -0.88
C9orf3-214ENST00000473778 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa9.53□□□□□ -0.88
C9orf3-214ENST00000473778 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
C9orf3-214ENST00000473778 RHOFQ9HBH0 211 aa9.53□□□□□ -0.88
C9orf3-214ENST00000473778 TAF9BQ9HBM6 251 aa9.53□□□□□ -0.88
C9orf3-214ENST00000473778 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
C9orf3-214ENST00000473778 AMDHD2Q9Y303 409 aa9.53□□□□□ -0.88
C9orf3-214ENST00000473778 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.88
C9orf3-214ENST00000473778 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.88
C9orf3-214ENST00000473778 FARS2O95363 451 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.88
C9orf3-214ENST00000473778 IFNA2P01563 188 aa9.52□□□□□ -0.88
C9orf3-214ENST00000473778 COX6A1P12074 109 aa9.52□□□□□ -0.88
C9orf3-214ENST00000473778 LIFP15018 202 aa9.52□□□□□ -0.88
C9orf3-214ENST00000473778 CPT2P23786 658 aa9.52□□□□□ -0.88
C9orf3-214ENST00000473778 SMCO1Q147U7 214 aa9.52□□□□□ -0.88
C9orf3-214ENST00000473778 TMEM268Q5VZI3 342 aa9.52□□□□□ -0.88
C9orf3-214ENST00000473778 PP6455Q8WZ26 134 aa9.52□□□□□ -0.88
C9orf3-214ENST00000473778 ERGIC1Q969X5 290 aa9.52□□□□□ -0.88
C9orf3-214ENST00000473778 SEC11CQ9BY50 192 aa9.52□□□□□ -0.88
C9orf3-214ENST00000473778 SMIM3Q9BZL3 60 aa9.52□□□□□ -0.88
C9orf3-214ENST00000473778 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.88
C9orf3-214ENST00000473778 DECR2Q9NUI1 292 aa9.52□□□□□ -0.88
C9orf3-214ENST00000473778 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa9.52□□□□□ -0.88
C9orf3-214ENST00000473778 GHRLQ9UBU3 117 aa9.52□□□□□ -0.88
C9orf3-214ENST00000473778 FREM1Q5H8C1 2179 aa9.52□□□□□ -0.89
C9orf3-214ENST00000473778 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa9.52□□□□□ -0.89
C9orf3-214ENST00000473778 A0A0G2JMM0 328 aa9.52□□□□□ -0.89
C9orf3-214ENST00000473778 A0A1W2PPB8 328 aa9.52□□□□□ -0.89
C9orf3-214ENST00000473778 A0A1W2PRS3 328 aa9.52□□□□□ -0.89
C9orf3-214ENST00000473778 FAM221AA4D161 298 aa9.52□□□□□ -0.89
C9orf3-214ENST00000473778 KIR3DP1A8MWS1 328 aa9.52□□□□□ -0.89
C9orf3-214ENST00000473778 FAM157AC9JC47 383 aa9.52□□□□□ -0.89
C9orf3-214ENST00000473778 UBE2CO00762 179 aa9.52□□□□□ -0.89
C9orf3-214ENST00000473778 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
C9orf3-214ENST00000473778 IGKV1D-12P01611 117 aa9.52□□□□□ -0.89
C9orf3-214ENST00000473778 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
C9orf3-214ENST00000473778 FCGR3AP08637 254 aa9.52□□□□□ -0.89
C9orf3-214ENST00000473778 TMEM225BP0DP42 221 aa9.52□□□□□ -0.89
C9orf3-214ENST00000473778 CRYGSP22914 178 aa9.52□□□□□ -0.89
C9orf3-214ENST00000473778 CAV2P51636 162 aa9.52□□□□□ -0.89
C9orf3-214ENST00000473778 CHAF1BQ13112 559 aa9.52□□□□□ -0.89
C9orf3-214ENST00000473778 RNF212Q495C1 297 aa9.52□□□□□ -0.89
C9orf3-214ENST00000473778 GGNBP1Q5YKI7 109 aa9.52□□□□□ -0.89
C9orf3-214ENST00000473778 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa9.52□□□□□ -0.89
C9orf3-214ENST00000473778 SKA3Q8IX90 412 aa9.52□□□□□ -0.89
C9orf3-214ENST00000473778 IMMP1LQ96LU5 166 aa9.52□□□□□ -0.89
C9orf3-214ENST00000473778 SCGB3A2Q96PL1 93 aa9.52□□□□□ -0.89
C9orf3-214ENST00000473778 SULT4A1Q9BR01 284 aa9.52□□□□□ -0.89
C9orf3-214ENST00000473778 DNAJB11Q9UBS4 358 aa9.52□□□□□ -0.89
C9orf3-214ENST00000473778 AK3Q9UIJ7 227 aa9.52□□□□□ -0.89
C9orf3-214ENST00000473778 ANXA10Q9UJ72 324 aa9.52□□□□□ -0.89
C9orf3-214ENST00000473778 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
C9orf3-214ENST00000473778 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf3-214ENST00000473778 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf3-214ENST00000473778 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
C9orf3-214ENST00000473778 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf3-214ENST00000473778 NPIPA2E9PIF3 369 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf3-214ENST00000473778 NPIPA3F8WFD2 350 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf3-214ENST00000473778 MED6O75586 246 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf3-214ENST00000473778 DEDDO75618 318 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf3-214ENST00000473778 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
C9orf3-214ENST00000473778 MTCP1P56278 107 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf3-214ENST00000473778 PDZK1IP1Q13113 114 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf3-214ENST00000473778 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms