RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	NANP	Q8TBE9	248 aa		14.75	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	SLAMF9	Q96A28	289 aa		14.75	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	RFT1	Q96AA3	541 aa		14.75	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	SPSB1	Q96BD6	273 aa		14.75	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	SMIM19	Q96E16	107 aa		14.75	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	MED30	Q96HR3	178 aa		14.75	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	OPALIN	Q96PE5	141 aa		14.75	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	PKIB	Q9C010	78 aa		14.75	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	NEK6	Q9HC98	313 aa		14.75	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	METRN	Q9UJH8	293 aa		14.75	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	OGG1	O15527	345 aa		14.74	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	ENSA	O43768	121 aa	Known RBP	14.74	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	CD2	P06729	351 aa		14.74	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	HCK	P08631	526 aa		14.74	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	PSG2	P11465	335 aa		14.74	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	MPZ	P25189	248 aa		14.74	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	WNT4	P56705	351 aa		14.74	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	IL13RA1	P78552	427 aa		14.74	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	IL24	Q13007	206 aa		14.74	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	LRRC10	Q5BKY1	277 aa		14.74	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	ARMCX4	Q5H9R4	360 aa		14.74	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	LHFPL2	Q6ZUX7	228 aa		14.74	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	BTN2A1	Q7KYR7	527 aa		14.74	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	FGFRL1	Q8N441	504 aa		14.74	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	ANGPTL6	Q8NI99	470 aa		14.74	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	H1FX	Q92522	213 aa	Known RBP	14.74	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	GHSR	Q92847	366 aa		14.74	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	SPACA5	Q96QH8	159 aa		14.74	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	DNTTIP1	Q9H147	329 aa		14.74	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	FKBP14	Q9NWM8	211 aa		14.74	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	OR14J1	Q9UGF5	321 aa		14.74	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	OPN4	Q9UHM6	478 aa		14.74	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	ZNF281	Q9Y2X9	895 aa		14.74	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	KIR2DS1	A0A191URI9	304 aa		14.73	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	RFPL4A	A6NLU0	287 aa		14.73	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	C22orf46	C9J442	243 aa		14.73	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	RFPL4AL1	F8VTS6	287 aa		14.73	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	NOS1AP	O75052	506 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	SELL	P14151	372 aa		14.73	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	AMY2B	P19961	511 aa		14.73	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	CAPZA1	P52907	286 aa		14.73	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	TAS2R43	P59537	309 aa		14.73	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	ATPAF1	Q5TC12	328 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		14.73	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	C1QL2	Q7Z5L3	287 aa		14.73	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	MKX	Q8IYA7	352 aa		14.73	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	PARP16	Q8N5Y8	322 aa		14.73	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	NANOGP1	Q8N7R0	232 aa		14.73	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		14.73	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	RGP1	Q92546	391 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	CEP19	Q96LK0	163 aa		14.73	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	GAFA1	Q96PS6	74 aa		14.73	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		14.73	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	MND1	Q9BWT6	205 aa		14.73	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	CCDC90B	Q9GZT6	254 aa		14.73	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	OCEL1	Q9H607	264 aa		14.73	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	RAB26	Q9ULW5	256 aa		14.73	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	IGKV1D-17	A0A075B6S4	117 aa		14.72	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	MAGEB3	O15480	346 aa		14.72	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	SPRY1	O43609	319 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	SULT1B1	O43704	296 aa		14.72	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	ACAA1	P09110	424 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	NDUFB7	P17568	137 aa		14.72	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	PAX2	Q02962	417 aa		14.72	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	PAX8	Q06710	450 aa		14.72	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	SCGB2A2	Q13296	93 aa		14.72	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	DMKN	Q6E0U4	476 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	PNLDC1	Q8NA58	520 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		14.72	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	TMEM185A	Q8NFB2	350 aa		14.72	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	OR5D18	Q8NGL1	313 aa		14.72	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	OR13C5	Q8NGS8	318 aa		14.72	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	RPS4Y2	Q8TD47	263 aa		14.72	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	SGCD	Q92629	289 aa		14.72	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	PAK1IP1	Q9NWT1	392 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		14.72	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	SLC25A10	Q9UBX3	287 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	SIGLEC5	O15389	551 aa		14.71	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	FCN3	O75636	299 aa		14.71	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	ECD	O95905	644 aa	Predicted RBP	14.71	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	CEL	P19835	753 aa		14.71	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	RAB3A	P20336	220 aa		14.71	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	PRDX2	P32119	198 aa		14.71	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	CEBPD	P49716	269 aa	Predicted RBP	14.71	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	DGUOK	Q16854	277 aa		14.71	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	SATL1	Q86VE3	508 aa		14.71	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	ZNRF1	Q8ND25	227 aa		14.71	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	EMG1	Q92979	244 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	TMEM106A	Q96A25	262 aa		14.71	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	TAS2R4	Q9NYW5	299 aa		14.71	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902	PCDHGB5	Q9Y5G0	923 aa		14.71	□□□□□ -0.05
USP19-210	ENST00000465902		F8VVB4	439 aa		14.7	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902		F8VWA3	439 aa		14.7	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	RGS10	O43665	173 aa		14.7	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	ANGPTL7	O43827	346 aa		14.7	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	MT-ND2	P03891	347 aa		14.7	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	LIPF	P07098	398 aa		14.7	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	CALCB	P10092	127 aa		14.7	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	EPHA1	P21709	976 aa		14.7	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	EEF1B2	P24534	225 aa	Known RBP	14.7	□□□□□ -0.06

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