RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445369.2

CLDN9-201, Transcript of claudin 9, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CLDN9, Length 2,050 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9-201ENST00000445369 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa15.46■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 POC1AQ8NBT0 407 aa15.46■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 BHLHE23Q8NDY6 225 aa15.46■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 C2orf50Q96LR7 162 aa15.46■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa15.46■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 IL36GQ9NZH8 169 aa15.46■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 LNP1A1A4G5 178 aa15.45■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 FARS2O95363 451 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 LHX2P50458 406 aa15.45■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 STPG2Q8N412 459 aa15.45■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 SPSB4Q96A44 273 aa15.45■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 XRCC2O43543 280 aa15.45■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 KNG1P01042 644 aa15.45■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 FUT6P51993 359 aa15.45■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 NAAAQ02083 359 aa15.45■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa15.45■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 SULT4A1Q9BR01 284 aa15.45■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa15.45■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 LINC00470Q9BZP3 86 aa15.45■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 FAM117AQ9C073 453 aa15.45■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 PRDM14Q9GZV8 571 aa15.45■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 CYTL1Q9NRR1 136 aa15.45■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 OR5AC2Q9NZP5 309 aa15.45■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 MUC3AQ02505 3323 aa15.44■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa15.44■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa15.44■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 MSGN1A6NI15 193 aa15.44■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 IFNA2P01563 188 aa15.44■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 IGHV3-9P01782 118 aa15.44■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 FCGR3AP08637 254 aa15.44■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 CELA3AP09093 270 aa15.44■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 RFC3P40938 356 aa15.44■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 CLDN18P56856 261 aa15.44■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 PIGYQ3MUY2 71 aa15.44■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 OSR2Q8N2R0 312 aa15.44■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 TECTBQ96PL2 329 aa15.44■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 ATPIF1Q9UII2 106 aa15.44■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 ZNF587BE7ETH6 402 aa15.44■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 TPT1P13693 172 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 PDZK1IP1Q13113 114 aa15.44■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 RAB32Q13637 225 aa15.44■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 ABHD17BQ5VST6 288 aa15.44■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 SLC30A7Q8NEW0 376 aa15.44■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 OR10AD1Q8NGE0 317 aa15.44■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 AQP10Q96PS8 301 aa15.44■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 GPR87Q9BY21 358 aa15.44■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 HES7Q9BYE0 225 aa15.44■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 LIME1Q9H400 295 aa15.44■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 C1orf123Q9NWV4 160 aa15.44■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 B4GALT7Q9UBV7 327 aa15.44■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 SLC7A11Q9UPY5 501 aa15.44■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa15.43■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 C21orf140B9A014 251 aa15.43■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 OR5H8P0DN80 308 aa15.43■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 RRADP55042 308 aa15.43■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 CDCP2Q5VXM1 449 aa15.43■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 PLCXD3Q63HM9 321 aa15.43■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 ELP2Q6IA86 826 aa15.43■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 COLCA1Q6ZS62 124 aa15.43■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 BCO1Q9HAY6 547 aa15.43■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 SLC7A10Q9NS82 523 aa15.43■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 FGF16O43320 207 aa15.42■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 SFTPBP07988 381 aa15.42■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 HOXB5P09067 269 aa15.42■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 SP9P0CG40 484 aa15.42■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 PET100P0DJ07 73 aa15.42■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 OPRM1P35372 400 aa15.42■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 RBMXP38159 391 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 SRYQ05066 204 aa15.42■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 FBXL14Q8N1E6 418 aa15.42■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 OR51F2Q8NH61 342 aa15.42■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 PIGCQ92535 297 aa15.42■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 NECAP2Q9NVZ3 263 aa15.42■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 TAS2R3Q9NYW6 316 aa15.42■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 ZNF708P17019 499 aa15.42■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 ARF1P84077 181 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 STK11Q15831 433 aa15.42■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 DHRS11Q6UWP2 260 aa15.42■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 SGPP2Q8IWX5 399 aa15.42■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 BAP18Q8IXM2 172 aa15.42■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 NAXEQ8NCW5 288 aa15.42■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa15.42■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 DYRK2Q92630 601 aa15.42■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 DNAJB11Q9UBS4 358 aa15.42■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 GLS2Q9UI32 602 aa15.42■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 ST3GAL6Q9Y274 331 aa15.42■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 FREM1Q5H8C1 2179 aa15.42■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa15.41■□□□□ 0.06
CLDN9-201ENST00000445369 CD59P13987 128 aa15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms