RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438120.5

PTPRF-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRF, Length 6,377 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-209ENST00000438120 TBX19O60806 448 aa15.26■□□□□ 0.03
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PTPRF-209ENST00000438120 WDR34Q96EX3 536 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRF-209ENST00000438120 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRF-209ENST00000438120 DOCK2Q92608 1830 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRF-209ENST00000438120 CRYBA1P05813 215 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRF-209ENST00000438120 SRD5A2P31213 254 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRF-209ENST00000438120 TMEM108Q6UXF1 575 aa15.26■□□□□ 0.03
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PTPRF-209ENST00000438120 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
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PTPRF-209ENST00000438120 ST8SIA5O15466 376 aa15.25■□□□□ 0.03
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PTPRF-209ENST00000438120 MED30Q96HR3 178 aa15.25■□□□□ 0.03
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PTPRF-209ENST00000438120 OR2W3Q7Z3T1 314 aa15.25■□□□□ 0.03
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PTPRF-209ENST00000438120 UQCC2Q9BRT2 126 aa15.25■□□□□ 0.03
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PTPRF-209ENST00000438120 TCFL5Q9UL49 500 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRF-209ENST00000438120 KRTDAPP60985 99 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRF-209ENST00000438120 M1APQ8TC57 530 aa15.24■□□□□ 0.03
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PTPRF-209ENST00000438120 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRF-209ENST00000438120 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
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PTPRF-209ENST00000438120 SPINT1O43278 529 aa15.23■□□□□ 0.03
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PTPRF-209ENST00000438120 IL36GQ9NZH8 169 aa15.23■□□□□ 0.03
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PTPRF-209ENST00000438120 CLEC9AQ6UXN8 241 aa15.23■□□□□ 0.03
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PTPRF-209ENST00000438120 SELENOPP49908 381 aa15.23■□□□□ 0.03
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PTPRF-209ENST00000438120 U3KQ87 197 aa15.22■□□□□ 0.03
PTPRF-209ENST00000438120 MESTQ5EB52 335 aa15.22■□□□□ 0.03
PTPRF-209ENST00000438120 SFT2D2O95562 160 aa15.22■□□□□ 0.03
PTPRF-209ENST00000438120 SFTPA2Q8IWL1 248 aa15.22■□□□□ 0.03
PTPRF-209ENST00000438120 OR1L4Q8NGR5 311 aa15.22■□□□□ 0.03
PTPRF-209ENST00000438120 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
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