RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438055.5

TTC3-209, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, humanhuman

TSL 5

Gene TTC3, Length 3,606 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC3-209ENST00000438055 PPT1P50897 306 aa14.6□□□□□ -0.07
TTC3-209ENST00000438055 TRIM61Q5EBN2 209 aa14.6□□□□□ -0.07
TTC3-209ENST00000438055 RTL6Q6ICC9 239 aa14.6□□□□□ -0.07
TTC3-209ENST00000438055 Q6ZRG5 221 aa14.6□□□□□ -0.07
TTC3-209ENST00000438055 LDLRAD3Q86YD5 345 aa14.6□□□□□ -0.07
TTC3-209ENST00000438055 CYTL1Q9NRR1 136 aa14.6□□□□□ -0.07
TTC3-209ENST00000438055 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa14.6□□□□□ -0.07
TTC3-209ENST00000438055 OR5AC1P0C628 307 aa14.6□□□□□ -0.07
TTC3-209ENST00000438055 TCN2P20062 427 aa14.6□□□□□ -0.07
TTC3-209ENST00000438055 AKR1C3P42330 323 aa14.6□□□□□ -0.07
TTC3-209ENST00000438055 POC1AQ8NBT0 407 aa14.6□□□□□ -0.07
TTC3-209ENST00000438055 NABP1Q96AH0 204 aa14.6□□□□□ -0.07
TTC3-209ENST00000438055 UQCC1Q9NVA1 299 aa14.6□□□□□ -0.07
TTC3-209ENST00000438055 TMEM33P57088 247 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC3-209ENST00000438055 H3F3AP84243 136 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC3-209ENST00000438055 RAB35Q15286 201 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC3-209ENST00000438055 C10orf128Q5T292 105 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC3-209ENST00000438055 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
TTC3-209ENST00000438055 LHFPL1Q86WI0 220 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC3-209ENST00000438055 SUMF1Q8NBK3 374 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC3-209ENST00000438055 OR2Y1Q8NGV0 311 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC3-209ENST00000438055 PRRX2Q99811 253 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC3-209ENST00000438055 SULT4A1Q9BR01 284 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC3-209ENST00000438055 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC3-209ENST00000438055 MMP26Q9NRE1 261 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC3-209ENST00000438055 DNAJC13O75165 2243 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC3-209ENST00000438055 A0A096LPE4 126 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC3-209ENST00000438055 A0A1W2PPZ6 126 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC3-209ENST00000438055 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
TTC3-209ENST00000438055 MALLQ13021 153 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC3-209ENST00000438055 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
TTC3-209ENST00000438055 FAM27BQ5VT28 67 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC3-209ENST00000438055 TMEM123Q8N131 208 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC3-209ENST00000438055 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC3-209ENST00000438055 FOXB1Q99853 325 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC3-209ENST00000438055 PRRG4Q9BZD6 226 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC3-209ENST00000438055 WDR54Q9H977 334 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC3-209ENST00000438055 TSPAN15O95858 294 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC3-209ENST00000438055 ASCL1P50553 236 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC3-209ENST00000438055 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
TTC3-209ENST00000438055 NAAAQ02083 359 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC3-209ENST00000438055 ZFP82Q8N141 532 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC3-209ENST00000438055 TMEM54Q969K7 222 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC3-209ENST00000438055 SPSB1Q96BD6 273 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC3-209ENST00000438055 IMMP1LQ96LU5 166 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC3-209ENST00000438055 V9GYS6 101 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC3-209ENST00000438055 NME2P1O60361 137 aa14.58□□□□□ -0.08
TTC3-209ENST00000438055 FGF5P12034 268 aa14.58□□□□□ -0.08
TTC3-209ENST00000438055 FBXW12Q6X9E4 464 aa14.58□□□□□ -0.08
TTC3-209ENST00000438055 ZIC4Q8N9L1 334 aa14.58□□□□□ -0.08
TTC3-209ENST00000438055 C2CD4CQ8TF44 421 aa14.58□□□□□ -0.08
TTC3-209ENST00000438055 RNF138Q8WVD3 245 aa14.58□□□□□ -0.08
TTC3-209ENST00000438055 Q96M66 194 aa14.58□□□□□ -0.08
TTC3-209ENST00000438055 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
TTC3-209ENST00000438055 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
TTC3-209ENST00000438055 F8VVB4 439 aa14.58□□□□□ -0.08
TTC3-209ENST00000438055 F8VWA3 439 aa14.58□□□□□ -0.08
TTC3-209ENST00000438055 ZNF708P17019 499 aa14.58□□□□□ -0.08
TTC3-209ENST00000438055 NFYBP25208 207 aa14.58□□□□□ -0.08
TTC3-209ENST00000438055 NPBWR1P48145 328 aa14.58□□□□□ -0.08
TTC3-209ENST00000438055 RAC3P60763 192 aa14.58□□□□□ -0.08
TTC3-209ENST00000438055 CDCP2Q5VXM1 449 aa14.58□□□□□ -0.08
TTC3-209ENST00000438055 SLC25A26Q70HW3 274 aa14.58□□□□□ -0.08
TTC3-209ENST00000438055 OR10D3Q8NH80 312 aa14.58□□□□□ -0.08
TTC3-209ENST00000438055 ABHD3Q8WU67 409 aa14.58□□□□□ -0.08
TTC3-209ENST00000438055 AQP10Q96PS8 301 aa14.58□□□□□ -0.08
TTC3-209ENST00000438055 ZNF286AQ9HBT8 521 aa14.58□□□□□ -0.08
TTC3-209ENST00000438055 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
TTC3-209ENST00000438055 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
TTC3-209ENST00000438055 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa14.58□□□□□ -0.08
TTC3-209ENST00000438055 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
TTC3-209ENST00000438055 RFPL3SP0C7P2 107 aa14.58□□□□□ -0.08
TTC3-209ENST00000438055 CCL2P13500 99 aa14.58□□□□□ -0.08
TTC3-209ENST00000438055 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
TTC3-209ENST00000438055 LPAR6P43657 344 aa14.58□□□□□ -0.08
TTC3-209ENST00000438055 LYZL2Q7Z4W2 148 aa14.58□□□□□ -0.08
TTC3-209ENST00000438055 OR4A4PQ8NGN8 299 aa14.58□□□□□ -0.08
TTC3-209ENST00000438055 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
TTC3-209ENST00000438055 SLC5A7Q9GZV3 580 aa14.58□□□□□ -0.08
TTC3-209ENST00000438055 OR51B6Q9H340 312 aa14.58□□□□□ -0.08
TTC3-209ENST00000438055 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
TTC3-209ENST00000438055 ADCYAP1P18509 176 aa14.57□□□□□ -0.08
TTC3-209ENST00000438055 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
TTC3-209ENST00000438055 CEBPGP53567 150 aa14.57□□□□□ -0.08
TTC3-209ENST00000438055 PDZK1IP1Q13113 114 aa14.57□□□□□ -0.08
TTC3-209ENST00000438055 OSR2Q8N2R0 312 aa14.57□□□□□ -0.08
TTC3-209ENST00000438055 BCO1Q9HAY6 547 aa14.57□□□□□ -0.08
TTC3-209ENST00000438055 DNAJB11Q9UBS4 358 aa14.57□□□□□ -0.08
TTC3-209ENST00000438055 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa14.57□□□□□ -0.08
TTC3-209ENST00000438055 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa14.57□□□□□ -0.08
TTC3-209ENST00000438055 M0R036 132 aa14.57□□□□□ -0.08
TTC3-209ENST00000438055 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
TTC3-209ENST00000438055 CD63P08962 238 aa14.57□□□□□ -0.08
TTC3-209ENST00000438055 HKR1P10072 659 aa14.57□□□□□ -0.08
TTC3-209ENST00000438055 OMGP23515 440 aa14.57□□□□□ -0.08
TTC3-209ENST00000438055 CAMLGP49069 296 aa14.57□□□□□ -0.08
TTC3-209ENST00000438055 CAV2P51636 162 aa14.57□□□□□ -0.08
TTC3-209ENST00000438055 PMS2CLQ68D20 193 aa14.57□□□□□ -0.08
TTC3-209ENST00000438055 OR11L1Q8NGX0 322 aa14.57□□□□□ -0.08
TTC3-209ENST00000438055 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.5 ms