RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428098.5

DDX39B-208, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 3

Gene DDX39B, Length 817 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-208ENST00000428098 GNG3P63215 75 aa9.21□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 FOXE3Q13461 319 aa9.21□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 GPR50Q13585 617 aa9.21□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 HNF4GQ14541 408 aa9.21□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 SMIM21Q3B7S5 101 aa9.21□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 CEACAM21Q3KPI0 293 aa9.21□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa9.21□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 CEP78Q5JTW2 689 aa9.21□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa9.21□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 TPRX1Q8N7U7 411 aa9.21□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 ZNF511Q8NB15 262 aa9.21□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 OR1N2Q8NGR9 330 aa9.21□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa9.21□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa9.21□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 NRIP2Q9BQI9 281 aa9.21□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa9.21□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 ABCB9Q9NP78 766 aa9.21□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa9.21□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 DHRS12A0PJE2 317 aa9.2□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 FAM172BPA6NC97 362 aa9.2□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 ARRDC5A6NEK1 342 aa9.2□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 ZNF878C9JN71 531 aa9.2□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 SAP30O75446 220 aa9.2□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 DEDDO75618 318 aa9.2□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 FAM106CPP0CH98 169 aa9.2□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 FSTP19883 344 aa9.2□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 GDNFP39905 211 aa9.2□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 POU3F4P49335 361 aa9.2□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa9.2□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa9.2□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 KRT74Q7RTS7 529 aa9.2□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 THNSL2Q86YJ6 484 aa9.2□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 FTMTQ8N4E7 242 aa9.2□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 FAM110AQ9BQ89 295 aa9.2□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 OR10A2Q9H208 303 aa9.2□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 SLC22A13Q9Y226 551 aa9.2□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 TMEM82A0PJX8 343 aa9.19□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa9.19□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 I3L521 148 aa9.19□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 OVOL1O14753 267 aa9.19□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 ELANEP08246 267 aa9.19□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 GRB2P62993 217 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 CFHR3Q02985 330 aa9.19□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 SNCBQ16143 134 aa9.19□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 KRT71Q3SY84 523 aa9.19□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 GDPD3Q7L5L3 318 aa9.19□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 FOXRED2Q8IWF2 684 aa9.19□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 PGAM5Q96HS1 289 aa9.19□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 AMELYQ99218 206 aa9.19□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 CCDC28BQ9BUN5 200 aa9.19□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 GNB4Q9HAV0 340 aa9.19□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 HES4Q9HCC6 221 aa9.19□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa9.18□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 hADV38S2A0JD32 116 aa9.18□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 ANGPT2O15123 496 aa9.18□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 FGF16O43320 207 aa9.18□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 OR8U8P0C7N1 319 aa9.18□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 SLC15A1P46059 708 aa9.18□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 GNB1P62873 340 aa9.18□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP9.18□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 EDDM3AQ14507 147 aa9.18□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa9.18□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 TEX30Q5JUR7 227 aa9.18□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa9.18□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 HAPLN4Q86UW8 402 aa9.18□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 PROKR2Q8NFJ6 384 aa9.18□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 OR52N4Q8NGI2 321 aa9.18□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 OR5A2Q8NGI9 324 aa9.18□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP9.18□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 OR5B12Q96R08 314 aa9.18□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 IFT27Q9BW83 186 aa9.18□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 KLK15Q9H2R5 256 aa9.18□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 OR52D1Q9H346 318 aa9.18□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 RGCCQ9H4X1 137 aa9.18□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 ZNF286AQ9HBT8 521 aa9.18□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 LINC00312Q9Y6C7 94 aa9.18□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 F8VVB4 439 aa9.17□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 F8VWA3 439 aa9.17□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 FXYD1O00168 92 aa9.17□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 AP4M1O00189 453 aa9.17□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 NXPH2O95156 264 aa9.17□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 IGHG4P01861 327 aa9.17□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 HSD11B1P28845 292 aa9.17□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 SLC6A6P31641 620 aa9.17□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 GPR12P47775 334 aa9.17□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 ARHGDIBP52566 201 aa9.17□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 ERVK11-1P61568 191 aa9.17□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 ESRRGP62508 458 aa9.17□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 ZNF616Q08AN1 781 aa9.17□□□□□ -0.94
DDX39B-208ENST00000428098 FGD3Q5JSP0 725 aa9.17□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.1 ms